protTMHMM
MyspiRboh23	901	114.38	0.01	4	o340-359i475-497o524-546i702-719o

View Redoxidase 19065
Entry information : MyspiRboh23(Myrspi0024g0582350.t1)
Entry ID 19065
Creation 2025-06-11 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2025-06-11 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: MyspiRboh23(Myrspi0024g0582350.t1)
Name MyspiRboh23(Myrspi0024g0582350.t1)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: N/D] N/D
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Myriophyllum spicatum    [TaxId: 208873 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value MyspiRboh23
start..stop
S start..stop
MyspiRboh27 1834 0 1..901 1..901
MyspiRboh25 1823 0 1..901 1..899
VvRboh07 1317 0 4..901 27..917
AgluRboh05 1290 0 2..901 52..946
Literature and cross-references MyspiRboh23(Myrspi0024g0582350.t1)
Protein sequence: MyspiRboh23(Myrspi0024g0582350.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   901
PWM (Da)   %s   101893.06 Transmb domain   %s   o340-359i475-497o524-546i702-719o
PI (pH)   %s   8.49
A INSERT TMH
INSERT INTO TMH(TMH_IdPerox,TMH_PeroxName,TMH_Type,TMH_Length, TMH_Expa,TMH_First60,TMH_PredHel,TMH_Topo) VALUES ('19065','MyspiRboh23','pep','901','114.38','0.01','4','o340-359i475-497o524-546i702-719o')

Insert TMH record :
INSERT INTO TMH(TMH_IdPerox,TMH_PeroxName,TMH_Type,TMH_Length, TMH_Expa,TMH_First60,TMH_PredHel,TMH_Topo) VALUES ('19065','MyspiRboh23','pep','901','114.38','0.01','4','o340-359i475-497o524-546i702-719o')

Update Perox 19065 Properties = '901;8.49;101893.06'
signalp /usr/local/bioinfo/src/SignalP/signalp-4.1/signalp -m ./assets/temp/tmp_mature ./assets/temp/tmp_pep 2>/dev/null
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MQTNNGEEVV GGAMLPIFLN DLGRRRGGGG AHVNDDGDDE LVEVTLELEH DSVVVCSVTP PSNEEANVSP TGFLRRSLSA TTASIRKKFA WLRSSSEKPD MEDEGPEAIA MAARDWRKMK  ARLQRDKSGA QRALTGLRFI SKTAKGGGKG NWENVESRFE SLSRDGLLSR EDFGLCIGME DSKEFAVGIF NALARRKGQN VRRITKEELK DFWRQMSDQS FDARLQLFFN MADSNEDGRI  TRDEVQELIM LSASANKLSK LKERAKDYAS LIMEELDPEN LGYIELWQLE TLLLQRDTYM NNSKQLTASP CQNQDFINYR PRNTIRRTML ALRCFVLENW QRYWILLLWV IVMALLFAWK  FNQYRYSPGF EIMGYCLTTA KGAAETVKLN MALILLPVCR NTLTWLRSTR ARLFVPFDDN INFHMIIACA IAVGVLLHAG NHLLCDFPRL LNSSPEKFAL ISSDFNNKRP TYVDFLVGVE  GITGIVMVIL MIIAFTLATN LLRKNMVRLP APFNRLTGFN AFWYAHHLTA IVYVLLIVHG TCLYFVHNWY EKTTWMYIAV PLLLYAAERS LRSCRSEYFL VKITKVSDLP GNVFSLIMSK  PLGFKYKSGQ YVFLKCPTIS SFEWHPFTIT SAPGDDYLSV HIRTVGDWTG ELKRVLTESQ DSSVIGRAKF SKLGSIDNSS LPKLLVDGPY GAPAQDYRNY DILLLVGLGI GATPFISIVR  DLIHNAAASE ELMESNTDIS TSDDSLTSMT STGTSSTVKR KLNRTMKAHF YWVTREPGSM EWFKGAMDEV AEMDHKRQID MHTYLTSVYD EGDARSTLLT LIQALNHAKY GVDILSGTRV 
RTHFARPNWK DVFTKIASKH PQSTVGVFYC GNPLLAKELK KISSELSHTT STRFDFHKEY F 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCAAACTA ATAATGGAGA AGAAGTTGTT GGAGGAGCAA TGCTGCCAAT ATTCCTGAAT GATTTGGGAA GAAGGAGAGG AGGAGGAGGA GCTCATGTGA ATGATGATGG TGATGATGAA  CTAGTTGAAG TCACATTGGA GCTTGAGCAC GACTCGGTGG TGGTGTGCAG TGTTACGCCG CCGTCTAATG AGGAGGCAAA CGTGTCTCCG ACGGGATTTC TGAGACGGAG TTTGTCCGCG  ACTACTGCGA GTATAAGGAA GAAGTTTGCA TGGTTGAGAT CGTCGTCGGA GAAACCGGAT ATGGAGGACG AAGGACCGGA GGCCATCGCT ATGGCTGCAA GGGATTGGAG GAAAATGAAG  GCGAGACTGC AACGAGATAA GTCGGGCGCG CAACGTGCCT TGACGGGTTT GAGATTCATA AGCAAGACTG CAAAGGGTGG TGGTAAAGGA AATTGGGAGA ATGTGGAATC AAGATTTGAG  TCCTTGTCCA GAGATGGATT GCTTTCAAGA GAAGATTTTG GCTTATGCAT AGGTGAGATT ATGAAACAAA GCTTGATCTT TACTGCTTCT TCGTTTCCCT GATGTCGCCA CTCGCGACGC  GAGCACGCAC TAGCTGTTCA GCTTGATCAT CAGAGCCTTC ATCACAAGCT AGCTGGAGTC TGCAATCACG AGCTATTGCC TGAACTATAA CGACATATAT AAGTTTCTCT GATTAGACTT  GATTCGATTG TGTTGTTTTA AGGAATGGAG GACTCGAAGG AGTTTGCTGT TGGGATTTTC AATGCATTGG CAAGACGAAA AGGGCAAAAC GTGCGAAGAA TTACTAAGGA AGAGCTGAAA  GATTTCTGGA GGCAGATGTC TGATCAAAGT TTTGATGCAC GTCTGCAGCT GTTTTTTAAT ATGTAAGTGA GAGTAATAAG GGAAAAGTGT AAAAATTCAT ATATATATAT ATAGGAGAAT  GTACAGAACA TGCTCAGAAT CTTTTCATTT GAGCAGGGCA GACAGCAATG AAGATGGGAG AATAACCAGG GATGAAGTTC AAGAGGTAAC AATCTTTTTT CCCTGTGTAA TATTTTTCCA  AACACTGTGA ACAACTTCTG AAGAACCTTC TTGTGTTGAT TTGCAGTTGA TAATGCTTAG TGCATCAGCT AACAAGCTGT CAAAATTGAA AGAACGGGCG AAAGATTACG CTTCTCTGAT  CATGGAAGAA TTAGACCCAG AAAACCTTGG ATACATCGAG GTAAATTCAA CTTTACAATT GTGTTCAGTA ATATGAAATG GTAGCAGTCT AGCAGATAAT AATAAGCAGA GAGTTACAAT  GTTTTCTGAT GCAGTTATGG CAGTTGGAGA CCCTACTCCT ACAGAGGGAT ACTTACATGA ATAACAGTAA ACAGTTAACT GCAAGTCCTT GCCAAAATCA GGACTTCATC AACTACAGGC  CCAGGAACAC AATCCGCCGA ACAATGCTTG CACTTAGATG CTTTGTACTA GAGAACTGGC AGAGATATTG GATATTGTTG CTGTGGGTGA TCGTGATGGC TTTGCTTTTC GCATGGAAAT  TCAACCAGTA CAGGTACTCT CCTGGATTTG AAATCATGGG ATACTGCCTG ACAACAGCCA AAGGAGCTGC TGAGACTGTA AAGCTCAATA TGGCTCTGAT CCTGTTACCA GTTTGTCGAA  ATACTCTGAC ATGGCTCCGA TCCACCAGAG CTCGTCTGTT CGTCCCTTTT GATGACAACA TTAACTTTCA CATGGTAAGA GTTTTACCTC TAAAGAACCT AACTTTATAG CATAGATGAA  AAGATAGATG CATTACTTAT TTGAAGTGTT TGAGGACAAG GAGTTCATCT CAAATTAGAA AATGAAGGCC TGAAATTACT GAACTGGACA CATTTCTTTC TCTTCACTTA CAGATTATAG  CCTGTGCAAT AGCTGTTGGA GTCCTCCTCC ATGCTGGGAA TCATTTGCTA TGCGACTTTC CTCGACTACT GAACTCCTCT CCTGAAAAGT TTGCCTTGAT ATCCTCTGAC TTTAATAACA  AAAGACCCAC ATACGTAGAT TTTTTAGTTG GTGTGGAAGG AATAACAGGA ATTGTCATGG TGATACTGAT GATAATAGCA TTTACATTGG CAACAAATCT CCTCAGGAAG AATATGGTGA  GGCTGCCCGC ACCATTCAAT CGTTTGACAG GGTTCAATGC ATTTTGGTAT GCTCATCATT TGACAGCAAT TGTGTACGTT TTGCTAATCG TCCATGGAAC CTGCCTATAC TTCGTCCACA  ATTGGTACGA AAAAACGGTA AGAGACAAAA ATGTGATCAG CATTGACAGT CAGACATAAA TCAAATTCAA ATAGCTGTAA ATATCTATGT TCATGCTGAC AATTATTGTT TCTATTTCAG  ACATGGATGT ATATCGCTGT CCCTCTGTTG CTGTATGCAG CAGAACGAAG TCTGCGGTCA TGCAGATCAG AATACTTTCT AGTTAAAATT ACAAAGGTAA GAAATCATAT CGTCTGCATC  CTTCAAAGAA CTTTGTCACA AAACGTGTCT TCAAAACTTA TTCTAAAGTA TTTTCCTTCA TTATACAGGT TTCGGATCTG CCTGGAAATG TCTTCAGCTT AATCATGTCA AAACCACTGG  GTTTCAAGTA CAAAAGTGGA CAGTATGTCT TTCTGAAATG TCCTACCATC TCCTCATTTG AGTGGTGAGT GCTATTTTCG ACCTCCCTTC ATGTTGAATA TCCAATCAAA GTCCTATAGT  TCATCAAGAC CAATGTAGCT TAGGCACTGA CATTGACAGT CTGCCTAAAC TGCAGGCATC CATTTACCAT AACCTCAGCC CCAGGTGATG ACTACCTCAG TGTTCACATT CGGACAGTTG  GCGACTGGAC TGGAGAATTG AAGCGAGTAC TCACTGAGAG TCAGGATTCT TCTGTAATTG GTCGAGCAAA GTTCAGTAAA CTAGGAAGCA TTGACAATAG CAGGTAACTC AAACAAACTC  AACTGGCCAA CATCCCAAAC CAGTTACGAT GATTATCATG AATCCTCTAG TTTGTGATTC ATATTAGTTT TCTCCTGTCA CTGTACATTT AATATCATAC GCCGTTGCAG TTTACCTAAG  CTGCTTGTGG ATGGCCCATA TGGAGCTCCT GCTCAGGACT ACAGGAACTA TGATATTCTG CTACTAGTGG GACTTGGAAT TGGAGCGACG CCTTTTATAA GCATTGTTAG AGATCTTATA  CATAATGCAG CAGCATCAGA GGAACTAATG GTAGATTTCA AACCTGATGT CCAACTTCCT TGCTTTTTGT TGAGCTTTTC CATCAGCTGA ATTCTCTGTT CATGTCTGTC TGCTCAGGAA  TCAAACACAG ATATCAGTAC ATCAGACGAT AGCCTCACTA GTATGACTTC GACAGGTACA TCATCAACAG TGAAAAGGAA GTTGAATAGA ACAATGAAAG CTCATTTCTA CTGGGTAACC  AGAGAACCGG GATCTATGGA GTGGTTCAAA GGAGCAATGG ATGAAGTTGC AGAAATGGAT CACAAAGTAA TCAACTAACT TTTCAAGCTT GAGTTTCCTA TGATGATTGG TCATCATTAT  GAATTTTATT CTCTTAACTT TCTTATTCCT AGAATAAAAA GGTCAAGTAC TAGTTCATCA GCAATTCTTA ATCTGTGTAC TGATTAACTG CTGTCTTTCT ACATTAAATC TGGAACAGAG  GCAAATTGAT ATGCATACTT ATTTAACAAG CGTCTATGAC GAAGGCGATG CCAGGTCCAC CCTACTGACT CTGATACAAG CTCTCAACCA TGCAAAATAT GGGGTAGACA TACTGTCTGG  TACCCGGGTA TGAGTTATGA TCTCAGAACT TTTCTGCTAA ACATCCTTCT CTAGACCTCT GTATTCAGTG GCAACCATAT TTTGCTTCCT TTTTTCTGCT AAGGGACACC TTGATATGCA  TCCTTATGTA GGTACGAACA CACTTTGCAA GGCCAAACTG GAAGGATGTC TTCACCAAAA TTGCTTCTAA GCATCCACAA TCTACAGTAG GTAAGGACAT TTTTACTTCT TTAAGAAGCT  CTTTACCTAT TCAGACCTGT CACAGAAGGT AGATCACTAG TTGGTAACTG TAACACTGAA TATAAGATTC TAAAGCATAA GAAATACAAC ACGATATCAA ATGAACACTG TAAACATATG  GAATGAGTCT GTAGAAACAA TGTAGTTTGA TCCTTAATAG AATATATATA TACACATATC TAACAAACTG GTGCATAGGA GTTCAGGAAT ATATCCAACG GGACAAGGCA CTACTGCAGG  TTGGTGGAAA ATTTTATGCT AATTAAAAGG TGTGTGCTCG TTAAATTGCA GGGGTCTTCT ATTGTGGCAA TCCATTGTTA GCAAAGGAGC TGAAGAAAAT ATCATCTGAA CTCAGTCACA 
CTACATCGAC ACGTTTTGAT TTCCACAAGG AGTACTTTTA A 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCAAACTA ATAATGGAGA AGAAGTTGTT GGAGGAGCAA TGCTGCCAAT ATTCCTGAAT GATTTGGGAA GAAGGAGAGG AGGAGGAGGA GCTCATGTGA ATGATGATGG TGATGATGAA  CTAGTTGAAG TCACATTGGA GCTTGAGCAC GACTCGGTGG TGGTGTGCAG TGTTACGCCG CCGTCTAATG AGGAGGCAAA CGTGTCTCCG ACGGGATTTC TGAGACGGAG TTTGTCCGCG  ACTACTGCGA GTATAAGGAA GAAGTTTGCA TGGTTGAGAT CGTCGTCGGA GAAACCGGAT ATGGAGGACG AAGGACCGGA GGCCATCGCT ATGGCTGCAA GGGATTGGAG GAAAATGAAG  GCGAGACTGC AACGAGATAA GTCGGGCGCG CAACGTGCCT TGACGGGTTT GAGATTCATA AGCAAGACTG CAAAGGGTGG TGGTAAAGGA AATTGGGAGA ATGTGGAATC AAGATTTGAG  TCCTTGTCCA GAGATGGATT GCTTTCAAGA GAAGATTTTG GCTTATGCAT AGGAATGGAG GACTCGAAGG AGTTTGCTGT TGGGATTTTC AATGCATTGG CAAGACGAAA AGGGCAAAAC  GTGCGAAGAA TTACTAAGGA AGAGCTGAAA GATTTCTGGA GGCAGATGTC TGATCAAAGT TTTGATGCAC GTCTGCAGCT GTTTTTTAAT ATGGCAGACA GCAATGAAGA TGGGAGAATA  ACCAGGGATG AAGTTCAAGA GTTGATAATG CTTAGTGCAT CAGCTAACAA GCTGTCAAAA TTGAAAGAAC GGGCGAAAGA TTACGCTTCT CTGATCATGG AAGAATTAGA CCCAGAAAAC  CTTGGATACA TCGAGTTATG GCAGTTGGAG ACCCTACTCC TACAGAGGGA TACTTACATG AATAACAGTA AACAGTTAAC TGCAAGTCCT TGCCAAAATC AGGACTTCAT CAACTACAGG  CCCAGGAACA CAATCCGCCG AACAATGCTT GCACTTAGAT GCTTTGTACT AGAGAACTGG CAGAGATATT GGATATTGTT GCTGTGGGTG ATCGTGATGG CTTTGCTTTT CGCATGGAAA  TTCAACCAGT ACAGGTACTC TCCTGGATTT GAAATCATGG GATACTGCCT GACAACAGCC AAAGGAGCTG CTGAGACTGT AAAGCTCAAT ATGGCTCTGA TCCTGTTACC AGTTTGTCGA  AATACTCTGA CATGGCTCCG ATCCACCAGA GCTCGTCTGT TCGTCCCTTT TGATGACAAC ATTAACTTTC ACATGATTAT AGCCTGTGCA ATAGCTGTTG GAGTCCTCCT CCATGCTGGG  AATCATTTGC TATGCGACTT TCCTCGACTA CTGAACTCCT CTCCTGAAAA GTTTGCCTTG ATATCCTCTG ACTTTAATAA CAAAAGACCC ACATACGTAG ATTTTTTAGT TGGTGTGGAA  GGAATAACAG GAATTGTCAT GGTGATACTG ATGATAATAG CATTTACATT GGCAACAAAT CTCCTCAGGA AGAATATGGT GAGGCTGCCC GCACCATTCA ATCGTTTGAC AGGGTTCAAT  GCATTTTGGT ATGCTCATCA TTTGACAGCA ATTGTGTACG TTTTGCTAAT CGTCCATGGA ACCTGCCTAT ACTTCGTCCA CAATTGGTAC GAAAAAACGA CATGGATGTA TATCGCTGTC  CCTCTGTTGC TGTATGCAGC AGAACGAAGT CTGCGGTCAT GCAGATCAGA ATACTTTCTA GTTAAAATTA CAAAGGTTTC GGATCTGCCT GGAAATGTCT TCAGCTTAAT CATGTCAAAA  CCACTGGGTT TCAAGTACAA AAGTGGACAG TATGTCTTTC TGAAATGTCC TACCATCTCC TCATTTGAGT GGCATCCATT TACCATAACC TCAGCCCCAG GTGATGACTA CCTCAGTGTT  CACATTCGGA CAGTTGGCGA CTGGACTGGA GAATTGAAGC GAGTACTCAC TGAGAGTCAG GATTCTTCTG TAATTGGTCG AGCAAAGTTC AGTAAACTAG GAAGCATTGA CAATAGCAGT  TTACCTAAGC TGCTTGTGGA TGGCCCATAT GGAGCTCCTG CTCAGGACTA CAGGAACTAT GATATTCTGC TACTAGTGGG ACTTGGAATT GGAGCGACGC CTTTTATAAG CATTGTTAGA  GATCTTATAC ATAATGCAGC AGCATCAGAG GAACTAATGG AATCAAACAC AGATATCAGT ACATCAGACG ATAGCCTCAC TAGTATGACT TCGACAGGTA CATCATCAAC AGTGAAAAGG  AAGTTGAATA GAACAATGAA AGCTCATTTC TACTGGGTAA CCAGAGAACC GGGATCTATG GAGTGGTTCA AAGGAGCAAT GGATGAAGTT GCAGAAATGG ATCACAAAAG GCAAATTGAT  ATGCATACTT ATTTAACAAG CGTCTATGAC GAAGGCGATG CCAGGTCCAC CCTACTGACT CTGATACAAG CTCTCAACCA TGCAAAATAT GGGGTAGACA TACTGTCTGG TACCCGGGTA  CGAACACACT TTGCAAGGCC AAACTGGAAG GATGTCTTCA CCAAAATTGC TTCTAAGCAT CCACAATCTA CAGTAGGGGT CTTCTATTGT GGCAATCCAT TGTTAGCAAA GGAGCTGAAG 
AAAATATCAT CTGAACTCAG TCACACTACA TCGACACGTT TTGATTTCCA CAAGGAGTAC TTTTAA 

Retrieve as FASTA