protTMHMM
MyspiTrxH04	529	20.41	20.35	1	i7-29o

View Redoxidase 19097
Entry information : MyspiTrxH04(Myrspi0001g0018370.t1)
Entry ID 19097
Creation 2025-07-03 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2025-07-03 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: MyspiTrxH04(Myrspi0001g0018370.t1)
Name MyspiTrxH04(Myrspi0001g0018370.t1)
Class Thioredoxin Type H    [Orthogroup: N/D] N/D
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Myriophyllum spicatum    [TaxId: 208873 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value MyspiTrxH04
start..stop
S start..stop
MyspiTrxH17 1052 0 1..529 1..529
MyspiTrxH11 338 4.37e-115 1..195 1..195
MyspiTrxH86 295 2.07e-93 85..496 105..514
MyspiTrxH71 292 2.13e-92 85..496 107..516
Literature and cross-references MyspiTrxH04(Myrspi0001g0018370.t1)
Protein sequence: MyspiTrxH04(Myrspi0001g0018370.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   529
PWM (Da)   %s   59136.9 Transmb domain   %s   i7-29o
PI (pH)   %s   4.81
A INSERT TMH
INSERT INTO TMH(TMH_IdPerox,TMH_PeroxName,TMH_Type,TMH_Length, TMH_Expa,TMH_First60,TMH_PredHel,TMH_Topo) VALUES ('19097','MyspiTrxH04','pep','529','20.41','20.35','1','i7-29o')

Insert TMH record :
INSERT INTO TMH(TMH_IdPerox,TMH_PeroxName,TMH_Type,TMH_Length, TMH_Expa,TMH_First60,TMH_PredHel,TMH_Topo) VALUES ('19097','MyspiTrxH04','pep','529','20.41','20.35','1','i7-29o')

Update Perox 19097 Properties = '529;4.81;59136.9'
signalp /usr/local/bioinfo/src/SignalP/signalp-4.1/signalp -m ./assets/temp/tmp_mature ./assets/temp/tmp_pep 2>/dev/null
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MFRPKPIFRF IYITFTLFLL LTFSSPILSS TDPDSEEGIE ELIALDEEQE THGQVAGHHV SEAEVLSKAQ RVVLELNIDS TERVLRQNEY VLVLGYAPWC ARSAELMPQF AEAAMALKEL  GSSLLMAKID AERYPKAASI LGIKGFPTLL LFVNGSSQLY TGGFTGEDIV IWVKKKTGVP VVRVSSVPEA EEVVEKYSAF VIGRFEKFEG PGYEEFIKVA ASDNEIQFVE VSDVEVAKVL  FPDAKPISPF LGLVKSEAEK YTTYEGSFTE DKMLEFLNYN KFPLVNILTE LNSARIYSSP IKLQVFVFAK ADEFEKLLEP LQNVARKFLS QILFVLVDIA EENLSKPFLT LFGLEETKKT  VVSAFDNNVS SKYLLESEPT PSHLEEFCRR LLLGIQPQYF KSQPAPDNTE AMIQIVVGKT FDDLVLNSPE NVLLEVHAPW CINCEATSKH VEKLAKHFKG LDTLVFARLD ASANEHPKLK 
VDDYPTLLFY PVGDKSNPKK LSTRVGLKEL AASINKNLKD KAEATKDEL 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTTTCGTC CAAAACCCAT TTTCAGATTC ATCTATATCA CATTCACGCT CTTTCTTTTA CTCACCTTTT CGAGTCCGAT CTTATCTTCA ACTGATCCTG ATTCGGAGGA AGGCATTGAA  GAGCTCATTG CGCTGGATGA GGAGCAAGAG ACACATGGTC AAGTAGCGGG TCATCACGTC AGTGAAGCGG AGGTGCTGAG CAAAGCTCAA AGAGTGGTTC TTGAGCTCAA CATTGACAGC  ACAGAGAGAG TTCTTCGCCA GAATGAGTAT GTTTTAGTTC TGGGTTATGC GCCATGGTGT GCAAGGAGTG CTGAATTGAT GCCACAATTT GCTGAAGCTG CTATGGCTTT GAAGGAATTA  GGCAGTTCTC TTTTGATGGC TAAGATTGAT GCTGAGAGGT ATCCGAAAGC AGCGTCGATT CTTGGGATTA AAGGGTTCCC TACTTTGCTT CTTTTTGTTA ACGGAAGCTC TCAACTTTAC  ACTGGTGGTT TCACTGGGTA CGTCATTATT TGGTTTTATG TAAATCATAG ATTTGTCTGT CATCTTTTCA TGATATTTGT TTGTAGTAAC AAAGGAATTT AATTTGCAAT TGATTTGTTG  TTGTGGGAAT TAACTTTTGA TCAGGGAAGA CATTGTGATA TGGGTAAAAA AGAAGACTGG TGTTCCTGTT GTTAGAGTAA GCTCAGTCCC AGAGGCTGAA GAAGTTGTTG AAAAATATTC  AGCTTTTGTT ATTGGACGCT TTGAGAAATT TGAGGTAAGT TGCTCACCGT CATAGAAGGT TTGATTTAGT CGAGGTAGAT AATTGGTAGG CCTGAAATGG AATGAGCACC AACACTTTAT  TCAATACTTC ATTCCACGCA TGGTTTAGGA CTTCGTGATT TGTACCCCGT AGCCTGGCAA TTTTTTAGGC ACACATGATT AGAGAGTTAT GCAGTTGCCT ACATGATGCA GGCTGAATTT  AGAAGTGTCC TGTAGAAAGA AACTGACTTA CTGAATTTAT ATAGGAAGTT CAGTGGCTCA ACTGCATATC AAATTATCCC CTGTAATTTT GTTTTTGTGG TGAAAGCTTC TTGTCTTTAG  TGATTGTGCT TCTGATAATA TATTAAATAT GTCCTCAGTG TTGTTGCCTA CGATGGCAGT ATTTAACCTT GCTTGATTGC AAGAAGCTAA AGAGCAAATG ATTATTTAAG CATGTATGGA  TTTCTTTATA GGACAGTTCC ATGAGCACAT GGGAATGATG GATGTCAGAA TTGTGGATTA GTTTTGGACT AACATGGATC ATTTTCTACT CTCAACCTGC CCGAGAACAA GAATCTGATT  CTGATGTAGT GGCCCTACGG GCTAGTCCCA TCTTTAAGAA AACTGTTCAA AGAATATCTA TTTTGATTAC AAATGCAAAT CTGTTTTGCG AAAAATTGTC GTGATGAATG TATTGATGTT  AGTCACGGGA AATGGACTTC ACAAGTGGTC TGCTTTGCCG CTTGGATTGC TTCATTTATT TACTAATCAA AACATATCAA GCTCACAAAT CTATAATGCT CTTTGCAATA CATATCCTGT  CTTGACTAGT GAAAAAGTGA GAAATGAAGT TTCTGAGGGC ACATACAATT GACTTTGCAT GTATGGATCC TATGTCTATC TTCAGCCAGG ACTGTGCTGA TTGTATACTG CTATCTATTT  GAATGAGATG TCATCGAATA AGAGAAATTG TCATGCAAAT TTTGTAGGGA CCTGGTTATG AAGAGTTTAT AAAGGTTGCT GCTTCCGATA ATGAAATTCA GTTTGTTGAA GTGAGTGATG  TTGAAGTTGC TAAAGTTCTC TTCCCAGATG CTAAACCCAT TAGTCCATTC CTTGGCCTGG TCAAAAGTGA GGCAGAAAAG TATACTACAT ATGGTAAGTC AAACTGTCAG ACTCTTGTTA  TTCATTCATG CACTGGATCA AGTTTACCAT TGTCATAATG TAAATGCTCT ATTATAGTTT TAAATTTCTC CACTTTCCTG TTATCATGTT GAGTTAATCT GGGAAGCTTT TGTAAGGGCT  GTCTATTATC CCTCTCGATT AAGTCAATAG TTGTCAAATG CTAAGTATAG AATTCTGCAC TCGCAGAAGG ATCATTTACA GAAGACAAGA TGTTGGAGTT TTTGAACTAC AACAAGTTCC  CGTTGGTTAA CATTCTAACT GAGCTTAATT CTGCCAGAAT TTACTCCAGT CCAATTAAAC TTCAGGTTAC TACAATTCTC AGAATTGGAT CTCTTTTATG GTTGTATTCT ACATACTTTT  TTATTTCTAG TGCTTCGAGC CCTTGGAGCA GTCTCTCCAT TTGTTTGGAA ATAAGGCTTG CCTATGTGCT CCATTTCCTG TCCCTGCTCC AAGCCGGAGT CTTGTGCATT GGATACAGAA  TGTATTATTT CTTTGGAGTT TTTTCTTATT GAATGTATAA TATATCCTGT CCATCCAAAA TTAAGTGTCG TGTCAAAACA TCTAAATAGA TATAGAAGGA AGAATTGACC TATTTCTTTA  TACTTCAGGT TTTTGTGTTT GCAAAGGCTG ATGAATTTGA GAAACTTCTT GAACCTCTTC AAAATGTAGC TCGGAAGTTC TTGTCGCAGG TTAACAGAAT TTAGAACTCA ATAGTTTACT  GTTTCTTTTT ATGACACTTC ACGTGAGCTT TCTTTTCTTG ATGCAGATAC TATTTGTATT AGTAGATATT GCAGAGGAAA ACCTATCAAA GCCTTTCCTT ACTTTGTTTG GGCTTGAAGA  AACAAAAAAG ACCGTTGTAA GTCTCCTGCT AGTAATTTTT TGTTTTGCCG TGGATCCAAA ACTTAAAGTT GGTTACTCTT TTTCTCTATA GGTTTCTGCT TTTGACAACA ATGTCAGTTC  GAAGTACTTG TTGGAGTCAG AACCGACACC CAGCCACTTG GAAGTAATTT ATCTCACTAC AAAACTTTCT TCCGTGCAAT GTCAAGTATC AAAACTAAAT GGTTTCCTTC AACTGGATTT  TACAGGAATT CTGCAGAAGG CTTCTTCTTG GTATTCAGCC ACAATATTTT AAATCACAGC CCGCTCCGGA CAATGTAAGT GTTATTCTCT TTTCGTAGGA TCAGTTGGTT TCAGTATACC  TTCTCATGTC GTCATAGTCT TCCACTTTTT GCAGAACTCG TTTCTTGTTA GATGGACTCC ATATCTGAAA ATTAGGTTAT GTGCTCAGTC TTGAGATTGT CTTAATCTCT GAACTTAATT  TTTCTTTATT TCAAAGAATT ATTTCAGATT TAGACTGGCT CTCACATTTC TTTCAAGCTA GATGAACTGC CAGTGCATTG GAAATTGAAA TGGTTCATTT TGTCCTAACT AGAGAAACAT  GTCATTAAGA CATATTTAAG TTCCTTTAAC GTCCTTCTGA TTATCATGGG ATAAGTGACC TACTTGGTCC CCTAATGTTG AATAATAGGA CATTTTTTTC AACTTCTAAG TTGGTTTGGT  GCTCCCTCAA GTCATGATGT GTGTAGGTGA GAGTAATGTA TATCTATGCT CTTCACTAAA CATTCTTTCT TTGTATTTTT ACTGATGCAG ACAGAAGCGA TGATCCAGAT TGTAGTGGGG  AAGACATTTG ATGACTTGGT TTTGAATAGT CCTGAGAATG TGTTGCTAGA GGTTTGTAAA TACTAACTGC GTGTTTCATT TTGTTAAATT ACTCTTATAC GGAGTGGAGG ATGCACAGTG  ATGTTGTTTT CCCAAAGAGA AGTAATGGCT TCTGCTAATG CTCATCTCAG TAGCCACACT ATAAGTGCCT ATGAGCACTC AATTATCCTG TGTCGTGATT CCAATCCCAT CTGTTTCCTC  CTTATGGCTG ATAGTTTGCT TTTCTTTGAT CCAGTTACAC TTTAGTGATG ACAGTACGGG TTAGGTATTC TTTTCCATGT TCACTATCCT TTCAGAGAAA AATAGCATTC CAAAAACTAG  AAAGGAAACC TTAATTTCAT TTTTATGTAG ACTACTGAAT TGTGGTACCA GTGTTCTCAG TCAACAAATC TGTATATACT CAATGTTATT ACAGCCCATT TCTAGATGTG GGCATGCTAA  TTGTACTTAA AATGTCTTGT AAAATGACCT GCTCTATTAT CCCAAATGCA GGTACATGCT CCTTGGTGCA TCAATTGTGA AGCCACAAGC AAGCATGTAG AAAAGTTGGC TAAACACTTC  AAAGGATTAG ACACTCTAGT CTTTGCAAGA CTAGATGCTT CTGCAAATGA ACATCCAAAA CTGAAGGTGA GTTTTACTGC TAAGAATTAA AATTGAAAAT TGTTCCAGGC TAAATCCACA  TCCTGTAAAG GTAAATTAGT TCTTGCCTTT CCAGCCCTGG TCATTTCACA GGACCTTTCA ATCACATTAA GTACAGATTT TGTTGTGGTT GTGGGAAGAA AAAATGTGTT TTTTTTTGTT  TGGTAACATC TTATAATTGA TTGGGTGGAT AATAGTTCTC TTATTATGAG TGAGTCTGAA GAGCGAAGTA TAGTGATGAA TCTCTGTAAA TAGCAATAAC GACAGAAGAT CTAGTCTGTT  ACATGTTACA CTGAACTTGC ATTGAGCTTG GGGATTCCTG AAGAACATTT ATGCATTGAC ATCTTGCAGG TGGACGACTA TCCAACGCTC TTGTTCTATC CAGTGGGTGA TAAATCGAAT  CCGGTATTGT TTTATAGACT ATGGAGGGGA TTTTACTTCC CCCCTCCCCA TGAAAATGTA GTGTCTATGT ATCATTTTAA CATGTGCTAT TCTGTTCCAA TATGCACAGA AAAAACTCTC 
TACTAGAGTT GGACTGAAAG AGCTGGCTGC ATCAATCAAC AAGAATCTAA AAGACAAGGC TGAAGCAACC AAAGATGAAC TATAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTTTCGTC CAAAACCCAT TTTCAGATTC ATCTATATCA CATTCACGCT CTTTCTTTTA CTCACCTTTT CGAGTCCGAT CTTATCTTCA ACTGATCCTG ATTCGGAGGA AGGCATTGAA  GAGCTCATTG CGCTGGATGA GGAGCAAGAG ACACATGGTC AAGTAGCGGG TCATCACGTC AGTGAAGCGG AGGTGCTGAG CAAAGCTCAA AGAGTGGTTC TTGAGCTCAA CATTGACAGC  ACAGAGAGAG TTCTTCGCCA GAATGAGTAT GTTTTAGTTC TGGGTTATGC GCCATGGTGT GCAAGGAGTG CTGAATTGAT GCCACAATTT GCTGAAGCTG CTATGGCTTT GAAGGAATTA  GGCAGTTCTC TTTTGATGGC TAAGATTGAT GCTGAGAGGT ATCCGAAAGC AGCGTCGATT CTTGGGATTA AAGGGTTCCC TACTTTGCTT CTTTTTGTTA ACGGAAGCTC TCAACTTTAC  ACTGGTGGTT TCACTGGGGA AGACATTGTG ATATGGGTAA AAAAGAAGAC TGGTGTTCCT GTTGTTAGAG TAAGCTCAGT CCCAGAGGCT GAAGAAGTTG TTGAAAAATA TTCAGCTTTT  GTTATTGGAC GCTTTGAGAA ATTTGAGGGA CCTGGTTATG AAGAGTTTAT AAAGGTTGCT GCTTCCGATA ATGAAATTCA GTTTGTTGAA GTGAGTGATG TTGAAGTTGC TAAAGTTCTC  TTCCCAGATG CTAAACCCAT TAGTCCATTC CTTGGCCTGG TCAAAAGTGA GGCAGAAAAG TATACTACAT ATGAAGGATC ATTTACAGAA GACAAGATGT TGGAGTTTTT GAACTACAAC  AAGTTCCCGT TGGTTAACAT TCTAACTGAG CTTAATTCTG CCAGAATTTA CTCCAGTCCA ATTAAACTTC AGGTTTTTGT GTTTGCAAAG GCTGATGAAT TTGAGAAACT TCTTGAACCT  CTTCAAAATG TAGCTCGGAA GTTCTTGTCG CAGATACTAT TTGTATTAGT AGATATTGCA GAGGAAAACC TATCAAAGCC TTTCCTTACT TTGTTTGGGC TTGAAGAAAC AAAAAAGACC  GTTGTTTCTG CTTTTGACAA CAATGTCAGT TCGAAGTACT TGTTGGAGTC AGAACCGACA CCCAGCCACT TGGAAGAATT CTGCAGAAGG CTTCTTCTTG GTATTCAGCC ACAATATTTT  AAATCACAGC CCGCTCCGGA CAATACAGAA GCGATGATCC AGATTGTAGT GGGGAAGACA TTTGATGACT TGGTTTTGAA TAGTCCTGAG AATGTGTTGC TAGAGGTACA TGCTCCTTGG  TGCATCAATT GTGAAGCCAC AAGCAAGCAT GTAGAAAAGT TGGCTAAACA CTTCAAAGGA TTAGACACTC TAGTCTTTGC AAGACTAGAT GCTTCTGCAA ATGAACATCC AAAACTGAAG  GTGGACGACT ATCCAACGCT CTTGTTCTAT CCAGTGGGTG ATAAATCGAA TCCGAAAAAA CTCTCTACTA GAGTTGGACT GAAAGAGCTG GCTGCATCAA TCAACAAGAA TCTAAAAGAC 
AAGGCTGAAG CAACCAAAGA TGAACTATAG 

Retrieve as FASTA