protTMHMM
MyspiTrxH47	499	16.72	16.72	1	i7-24o

View Redoxidase 19140
Entry information : MyspiTrxH47(Myrspi0011g0306790.t1)
Entry ID 19140
Creation 2025-07-03 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2025-07-03 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: MyspiTrxH47(Myrspi0011g0306790.t1)
Name MyspiTrxH47(Myrspi0011g0306790.t1)
Class Thioredoxin Type H    [Orthogroup: N/D] N/D
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Myriophyllum spicatum    [TaxId: 208873 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value MyspiTrxH47
start..stop
S start..stop
MyspiTrxH41 995 0 1..499 1..499
MyspiTrxH63 992 0 1..499 1..499
MyspiTrxH123 931 0 1..499 1..473
MyspiTrxH48 800 0 57..499 10..415
MyspiTrxH48 77 0.00000000000000216 49..149 310..407
Literature and cross-references MyspiTrxH47(Myrspi0011g0306790.t1)
Protein sequence: MyspiTrxH47(Myrspi0011g0306790.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   499
PWM (Da)   %s   55098.49 Transmb domain   %s   i7-24o
PI (pH)   %s   4.56
A INSERT TMH
INSERT INTO TMH(TMH_IdPerox,TMH_PeroxName,TMH_Type,TMH_Length, TMH_Expa,TMH_First60,TMH_PredHel,TMH_Topo) VALUES ('19140','MyspiTrxH47','pep','499','16.72','16.72','1','i7-24o')

Insert TMH record :
INSERT INTO TMH(TMH_IdPerox,TMH_PeroxName,TMH_Type,TMH_Length, TMH_Expa,TMH_First60,TMH_PredHel,TMH_Topo) VALUES ('19140','MyspiTrxH47','pep','499','16.72','16.72','1','i7-24o')

Update Perox 19140 Properties = '499;4.56;55098.49'
signalp /usr/local/bioinfo/src/SignalP/signalp-4.1/signalp -m ./assets/temp/tmp_mature ./assets/temp/tmp_pep 2>/dev/null
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MASSASWIWC FVLVVSSIGS IASASEEKEF VLALDHSNFS DVVSKNDFVV VEFYAPWCGH CKNLAPEYEK AASILNRHDS KVVLAKVDAN EEANKDLASQ YDVQGFPTLK ILRNGGKDIQ  DYKGPREADG IVEYLKKQSG PASAEIKSDE DAGALIDEKK VVVVGVFPKF SGEEFENFIT VAEILRSEYD FGHTKDAKLL PRGESSVTGP VVRLFKPFDE LVVDSKDFGV DALEKFVAAS  SVPTVTIFNI DPNNHPFVIK FFNSQDAKAM LFMNFSDGIH ESFKSKYHEV AKQYKGEGIS FLMGDLDASK GAFQYFGLDE DQVPLIIIQA TNGQKYLKPH LEPDHLASWV KDFKEGKVEP  FKKSEPIPEV NSEPVKVVVG DSIQDMVFNS GKNVLLEFYA PWCGHCKNLA PILEEVALSF QDDADVLIAK LDATANDYPT DVFDVKGYPT MYFRSSNGNI VSYDGDRSKE AIIDFVNQHR 
SGGSTAQQES EAEPAKDEL 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGAGTA GTGCTTCTTG GATTTGGTGC TTCGTTCTGG TAGTATCTTC AATCGGATCG ATCGCTTCTG CTTCAGAAGA GAAGGAGTTT GTATTAGCTC TGGATCATTC GAATTTCAGT  GACGTCGTCA GCAAAAATGA TTTCGTCGTC GTGGAATTCT ACGCTCCATG GTAAAGATCT CATTTTTATT CATTGTATTG TCATTTAGTT TTTTAATTTT CTGTTGGTGA TTGCTTTGAA  GAATGCTTCT GAAAGGTCTG TCTGTTTTCC TTTCCGTGGA TGACTATGGT GAATCAGTGA TTCTAATAGT CATATCACGT TTGTGGTTGA CCTCGATTTG ACTATTGAGT TTTTCATAAC  TGCTCATTGA CCGAATAAGA CTGGTTGTAG GAGTGTATTT TTGAATTTGT CACTGTTAGT CTCGGTCTGA ATTATGCAAT TGATCACTTG ATGGTTAGTT CATTTGTCCT GTGACTTTGA  TTGCAATATT GAGTAGATGG GTCATAAGCA GTGCCATGAT GATCAAGATT TTAGTTATGT TAATTTGCTG CATGGGATTG TGACTTTGAT GTGCATATTG GTTTTAAGGA TTATGCCATT  GCAGTGGAGC GTCATTTGTG ATCGGCAGTT CAGTGCTGAA TATTTTTAAA TTTTACATTG CTGCTTCCCT TGAAAATTTT GTCAACTATA TGCTTTGTTA GTCTATGCAT GTTACAAGGT  TTTAAATTTT AATCAATGGA GGGAAAAGAA TTTAACAAAT TTTAGCAGGG GTTTTCTTGC AATTTTAAAC GAGTTCTTTC TTGATTTAGA AATCTTAGAT TTCATACGTG TGGTCATCCA  GTTCAATGTT GACAATGAGA AGAAGATTTA CATTTATCAA AGAAACATCT TAACAAATGT GCTTGGTGCA CCTATTTACT AACCCCTTCT AATAATAGTT CTCTTTTTCA AAACATTGCC  TTGTTTTAAG GGAGAAATCA TGTTTTTTGG GGCTCTGACT AGCTATATTT AATTATATCA TCCAATTTAA CCTATCCATT TTGGCCAATT CAATCTCAAT AGGGGTTGGC TTTTTGGAAA  GCTTCTAATT TCTTTTTTTT TCTCCCTATC ACAGGTGTGG ACACTGTAAG AATCTTGCAC CAGAGGTAAA TTATAATCTG TGCAGTATAT ATGTCTTAAA TTTTTTATGA TGTCGATTGT  ATAATAAATT TCTGCAGAGG ATTATTAACA TCATTGTGCC TATGTTTTGT AGTATGAGAA GGCTGCATCC ATCTTGAACA GACATGACTC TAAGGTCGTC CTTGCTAAAG TTGATGCCAA  TGAGGAAGCA AACAAAGATC TTGCATCTCA ATATGATGTC CAGGGTTTTC CCACACTCAA GATTTTGAGA AATGGTGGAA AAGATATTCA AGATTATAAG GGGCCTCGAG AAGCAGATGG  TATTGTTGAA TACTTAAAGA AGCAGAGTGG CCCCGCTTCT GCTGAAATTA AATCTGATGA AGATGCTGGA GCTCTCATTG ATGAAAAGAA AGTAGTTGTC GTAAGTATAC ATTACACCAG  CTTTTTGAAT TTTCCGATGA TTATGTTGGT GTTCTATAGG AATAATCTTT ATTTCCACTT GCATGTAGGT CGGGGTTTTC CCAAAATTTT CTGGAGAGGA GTTCGAGAAC TTCATTACTG  TAGCTGAGAT ATTACGCTCA GAGTATGACT TTGGCCATAC TAAGGATGCT AAACTGCTTC CTCGTGGTGA ATCCTCAGTG ACTGGCCCTG TTGTCAGACT ATTCAAACCC TTCGATGAGT  TAGTTGTCGA TTCCAAGGTA CAAAAAGAAT TTTCTTTTTA ATTAGACCAT CTTCTGGTGC AAGGTTAACC TATTACTTGT GGGGATTATA TTCAAGGTGC TAAAAGATCA GCATGCTTGC  AGGATTTTGG TGTTGATGCT TTGGAAAAGT TTGTTGCAGC ATCTAGCGTA CCTACTGTAA CTATCTTTAA CATTGATCCG AACAATCACC CTTTCGTTAT CAAATTCTTC AATAGTCAAG  ATGCCAAGGT TAGTTATGTA AAACCGGCTC TCTTATTGTC TCTAAAGAAG TGGTTTGACG TGACACGAAG AGAGATTTTC TGTCAATACT TAACTCAAGA TGTCTAAAAC TTGTTTGTTT  TTCCATTTCC TAATGTAATT CACCTTAGCC CCAATTTGAT TTGGAAAACA AGTATCCAGC ACCAAGAATC CCATTTTCTT GTGTATTTTT TAACCTAACT TTTATACTAT TACGGCGATG  TCTACGTTAG GACATTTTTT TTTGTTTTCA GTTTATTATG CTATTGGTCA GTATTGACAT CAAAATTGGG AGTAAGATCT GTGCTTCAAT TTTTTTTTGT AAAATCATGC AGTTAATTGG  ATTTATCAAT TAAGTTCTAT ACTTTTTGTA GGCCATGCTG TTCATGAACT TTAGTGATGG GATTCATGAG TCATTTAAGT CAAAATATCA TGAAGTAGCT AAACAATACA AGGGAGAGGG  CATCAGCTTC CTAATGGGAG ACCTTGATGC TAGTAAAGGA GCTTTCCAGG TTAGAAACTT TCTGATGTGC TCTATGTTTA AGTCTGTGGT TGAGAAACTG CAATTTATGT TCTAATAACT  TTTGCTGGTT CACAGTATTT TGGATTGGAC GAGGATCAAG TGCCTCTAAT CATCATACAG GCTACCAATG GACAGAAGTA CCTGAAGCCC CATTTGGAGC CAGATCATCT TGCTTCCTGG  GTGAAGGATT TCAAGGTGAA TCTTTTGTCT CCTAATTGTC ATGTACTTCT ACGTCTGAAT TATTCAGGGC AATCTCAAAT TATAATCTAA CTATTTTTTT TACGATAACT GTTTATTCTC  CCTTACTAAA TGAAGTACAA AATTGCAGGA AGGTAAAGTA GAGCCATTCA AAAAGTCAGA ACCTATTCCT GAAGTAAACA GCGAGCCTGT GAAGGTGGTA GTTGGTGACA GCATTCAGGA  CATGGTCTTT AACTCTGGCA AAAATGGTAA GTACCAAATT ACAGAGATAA CTTCCAGTAT TCTGAAGGTT CTGCTGTACT GGTCATATGG ATCGTTTTGT GTGCATTCGT GTTTGTAGGC  TTTGCCTCTT TCATATGTAT ATCAGCAGCA CCATGTTCCA TAAATCATTT TGCTTTCAGT AGGCAGTCAA CAGGATTATA TACAAATAAA GTGTTTCTGG AAAAAAATGG TCGGAACTAC  CATGGTTTTC GCATGATACC TGCTTGTTCG AAAATGAAAT ATGATGAGCA AATGAATTTT TTGTACTGCC ACTTGCAAAG AAATGGTGAT CTTTATAAAT CATGTGTCTT TATGTATGTT  ATTGCAAAGC ACTGCCTGAA CTGAAGTGTC TTCTTGCAGT GTTGTTGGAG TTCTATGCTC CTTGGTGTGG GCATTGCAAA AACCTGGCTC CAATATTGGA GGAAGTTGCT CTCTCATTTC  AGGACGACGC AGATGTTCTA ATTGCCAAAC TTGTAAGTTA GTTACCTCCA ATATAGTTGT GGAAGTTGGT GGAGGTAGTT GTGTTTTGTT GGATATCATC TCTCGTATGT ACTCTCCTAG  CACAATCATT GTTTCTCCTC AGGATGCAAC TGCAAATGAT TACCCAACAG ATGTTTTTGA CGTTAAGGGC TACCCGACTA TGTACTTCAG GTCATCAAAT GGGAACATAG TGTCATATGA 
TGGAGACAGG AGCAAGGAAG CAATAATTGA CTTTGTAAAC CAACATCGTT CAGGCGGAAG CACTGCTCAA CAAGAGTCCG AGGCTGAGCC TGCCAAAGAC GAGCTGTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGAGTA GTGCTTCTTG GATTTGGTGC TTCGTTCTGG TAGTATCTTC AATCGGATCG ATCGCTTCTG CTTCAGAAGA GAAGGAGTTT GTATTAGCTC TGGATCATTC GAATTTCAGT  GACGTCGTCA GCAAAAATGA TTTCGTCGTC GTGGAATTCT ACGCTCCATG GTGTGGACAC TGTAAGAATC TTGCACCAGA GTATGAGAAG GCTGCATCCA TCTTGAACAG ACATGACTCT  AAGGTCGTCC TTGCTAAAGT TGATGCCAAT GAGGAAGCAA ACAAAGATCT TGCATCTCAA TATGATGTCC AGGGTTTTCC CACACTCAAG ATTTTGAGAA ATGGTGGAAA AGATATTCAA  GATTATAAGG GGCCTCGAGA AGCAGATGGT ATTGTTGAAT ACTTAAAGAA GCAGAGTGGC CCCGCTTCTG CTGAAATTAA ATCTGATGAA GATGCTGGAG CTCTCATTGA TGAAAAGAAA  GTAGTTGTCG TCGGGGTTTT CCCAAAATTT TCTGGAGAGG AGTTCGAGAA CTTCATTACT GTAGCTGAGA TATTACGCTC AGAGTATGAC TTTGGCCATA CTAAGGATGC TAAACTGCTT  CCTCGTGGTG AATCCTCAGT GACTGGCCCT GTTGTCAGAC TATTCAAACC CTTCGATGAG TTAGTTGTCG ATTCCAAGGA TTTTGGTGTT GATGCTTTGG AAAAGTTTGT TGCAGCATCT  AGCGTACCTA CTGTAACTAT CTTTAACATT GATCCGAACA ATCACCCTTT CGTTATCAAA TTCTTCAATA GTCAAGATGC CAAGGCCATG CTGTTCATGA ACTTTAGTGA TGGGATTCAT  GAGTCATTTA AGTCAAAATA TCATGAAGTA GCTAAACAAT ACAAGGGAGA GGGCATCAGC TTCCTAATGG GAGACCTTGA TGCTAGTAAA GGAGCTTTCC AGTATTTTGG ATTGGACGAG  GATCAAGTGC CTCTAATCAT CATACAGGCT ACCAATGGAC AGAAGTACCT GAAGCCCCAT TTGGAGCCAG ATCATCTTGC TTCCTGGGTG AAGGATTTCA AGGAAGGTAA AGTAGAGCCA  TTCAAAAAGT CAGAACCTAT TCCTGAAGTA AACAGCGAGC CTGTGAAGGT GGTAGTTGGT GACAGCATTC AGGACATGGT CTTTAACTCT GGCAAAAATG TGTTGTTGGA GTTCTATGCT  CCTTGGTGTG GGCATTGCAA AAACCTGGCT CCAATATTGG AGGAAGTTGC TCTCTCATTT CAGGACGACG CAGATGTTCT AATTGCCAAA CTTGATGCAA CTGCAAATGA TTACCCAACA  GATGTTTTTG ACGTTAAGGG CTACCCGACT ATGTACTTCA GGTCATCAAA TGGGAACATA GTGTCATATG ATGGAGACAG GAGCAAGGAA GCAATAATTG ACTTTGTAAA CCAACATCGT 
TCAGGCGGAA GCACTGCTCA ACAAGAGTCC GAGGCTGAGC CTGCCAAAGA CGAGCTGTAA 

Retrieve as FASTA