protTMHMM 
MyspiTrxH52	525	23.85	1.02	1	o484-506i

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Entry information : MyspiTrxH52(Myrspi0013g0353180.t1)
Entry ID 19145
Creation 2025-07-03 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2025-07-03 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: MyspiTrxH52(Myrspi0013g0353180.t1)
Name MyspiTrxH52(Myrspi0013g0353180.t1)
Class Thioredoxin Type H    [Orthogroup: N/D] N/D
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Myriophyllum spicatum    [TaxId: 208873 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value MyspiTrxH52
start..stop		 S start..stop
MyspiTrxH42 1066 0 1..525 1..525
MyspiTrxH26 1056 0 1..525 1..526
CbraTrxH30 110 5.82e-28 47..172 100..226
CbraTrxH25 56 0.0000000158 49..175 43..148
CbraTrxH25 52 0.000000184 43..174 155..266
Literature and cross-references MyspiTrxH52(Myrspi0013g0353180.t1)
Protein sequence: MyspiTrxH52(Myrspi0013g0353180.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   525
PWM (Da)   %s   58630.34 Transmb domain   %s   o484-506i
PI (pH)   %s   7.94
A INSERT TMH
INSERT INTO TMH(TMH_IdPerox,TMH_PeroxName,TMH_Type,TMH_Length, TMH_Expa,TMH_First60,TMH_PredHel,TMH_Topo) VALUES ('19145','MyspiTrxH52','pep','525','23.85','1.02','1','o484-506i')

Insert TMH record :
INSERT INTO TMH(TMH_IdPerox,TMH_PeroxName,TMH_Type,TMH_Length, TMH_Expa,TMH_First60,TMH_PredHel,TMH_Topo) VALUES ('19145','MyspiTrxH52','pep','525','23.85','1.02','1','o484-506i')

Update Perox 19145 Properties = '525;7.94;58630.34'
signalp /usr/local/bioinfo/src/SignalP/signalp-4.1/signalp -m ./assets/temp/tmp_mature ./assets/temp/tmp_pep 2>/dev/null
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MSRLFFVILF VLSVGVRTTS SVGSWRSILR AIDEKTYNAV HHPDVGVELN ATDFDSVLGG TLATHAIVEF FAHWCPACRN YKPHYERVAR LFNGPGAVHP GIILMTRVDC ALKINTKLCD  KFSVGHYPML FWGPPSKFVG GSWKPQQKKG DISVIDDGRT ADRLLNWIDK KIGSSYGLDD QKFEGSHVSA NVSDLEQIVR ALYDIEEATS TAFDIVVAHK MIKSDTRAAL ITFLQLLVAH  HPSWRCRKGS AGILVNFDDL YPSDPLSSNE KDSTGPQGGL VDNFQVCGKE VPHGYWVFCR GSRNETRGFS CGLWLLLHSL SVRIENEESQ FAFRATCDFI HNFFVCEECR EHFYEMCSSV  TSPFTKSRDF AIWLWDAHNK VNERLMKEEA SLGTGDPKFP KIIWPPEQLC PSCFISQSRK RNGANRIEWD HDEVFKFLCG YYGVKLMSLY KDKGVVKGGI KLMAGGGTGG DADDTAVSTH 
AVVVPVGAAL AIAFASCAFG VLAWFWRSQQ KNRKYAHHLH SFKET 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA ►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCTCGGT TATTTTTTGT AATATTATTT GTATTGAGCG TCGGAGTTCG AACGACGTCC TCCGTCGGAT CGTGGAGGTC AATTCTTCGA GCAATCGATG AGAAAACCTA CAACGCTGTT  CATCATCCTG ATGTGGGCGT TGAACTTAAT GCCACGGATT TTGATTCTGT GCTTGGGGGC ACCTTGGCTA CTCATGCTAT TGTTGAGTTC TTCGCTCACT GGTTAGTCCC CTTACTCTCT  CATTATTCTC ATTTATTCTT TTTGCATGCT TTATGTTCTA TATGCATTGT CACTTTTGTG TATATATATA TTACCTTTTG GTCAATTCTA TTAATTGCTT GGTGCCGAAT GCTGAATAGG  ATTTAAGAAA GAAAGTAATC AGTTCACAGT TTCTTCTTAT CTAATTGAAA GCGATTGCAT GAGGGAAAGT GCCTTGCGTG CTACACAAAT GTGCACAGGG ACAAGATTAG AAAGTCGCTA  GGTTTTGATT GTTGGGTATC AATAAAATGA TTCTGTTGGG AGATCCTTTA ATTTGTTAAC ATTTGTTAAA GTGTGTCTGG TTTAAGCGAT TGCAGATCCC CAAAAGCATC TTGGATCTTT  GATTCGGTAA TTTATTAGCT ATATGCTTAT AATTTGGCTT TCAGAACAGA AAGTTGGTCA GAATCTAGAA GTTTAAATGT TGCATTATGA ACATCTGTCG ATACTGGATG ATCCCACTCT  TTAATGATCA TCAACTTTCT TCACAACAAA TCTTTAGAAA ACAACTTCCA CTAGAATTAT GTGTATTGTG ATATAAGTTC TTAATTAATA ATTGATATTT TTCTGTCATT TCATTCACTA  TCCATAGGAT TTTTTGTCAT TGACTTTATT ATGATTGACT TGTAGGTGCC CTGCTTGCAG AAATTATAAG GTATTACTTG TTTTTGTACA TTAATCTCAT TTCATGGTTT CAGACTCTTC  TTGTTAGTAA CTGGTGCCAT TATTTTTAGC CTCATTACGA GAGGGTGGCT AGGCTATTTA ACGGACCTGG GGCAGTACAT CCTGGCATCA TTCTTATGAC AAGGGTGGAT TGTGCATTAA  AGGTACTGTC ACATCTTTGT TACTTTCAGT GGGTTGTGTT TGTAGTTGAG TCAGAATTTT CAAATATCTT TTCTCTTAAT ATAAGCCAAA GTAGTGAGCC TTAATTTTGA GGACAGGTAC  ATCATTTCCT TTCCTTCTTC TTTACGAGAG TCTTTTCTTA CCAAAAGGTA TAAATTATAT TTGATGCTTT TTAGATTTAG GAATTGTTGC GAAGTGCCCT ATCTAGTTCA GGTCTCTGGT  GCATTTTGCT GCAAAATGAC TTTAGCTTAG GAATTTATTG CTTTGACATT GATATTTTAA ATGTAGACAA TATTTCAGCA TTTCTCAATA CCGTTTCAGC ATGTTCAGCT TTCTATATCT  ATGTTTCAAT GATTCTCTAT GATAATTCAA CTGCTCTAGA AGTTCTTTTT GGTTTACCAG AAGCTATATT TACTTTTCAG CTTTCTATAT CTATGTTTCA ATGATTCTCT GTGATAATTC  AACTGCTTTA GAAGTTCTTT TTGGTTTACC AGAAGCTATA TTTACTAACT ATATATCTTT CTATACATAC TGAGTAGAAC CTTTATAGAC GTTTCCATGT GGAATGTCCT ATAGTCTACA  GAAATGCCTG TCACGTTACC CCATCCGCAA CATATGATAG CTTTTGGAGT AACATAGGAT TATTCTGTTA GCAATAGGAC TGTAGAAAAA TCCTCCCTTA AAAAATTCTG GTAATTGATT  CGCTCTTATT TCACTTCACC GACAGCACAG ATAAATACAA AGCTCTGTGA TAAATTCTCT GTGGGCCACT ATCCAATGCT GTTCTGGGGA CCTCCATCCA AATTTGTAGG TGGTAGTTGG  AAACCTCAGC AGAAGAAAGG CGACATATCT GTCATTGATG ATGGACGGAC TGCTGATCGT TTGCTTAATT GGATAGACAA GAAAATAGGC AGGTGAGGTA TCAGCATTCT TTCCAAAATT  TGCAGTTACT GTGGGAGCGA AAATTGCCCA CTAGCAAATA AAGCTCTCTG TACGAATAAT CTTTTAAATA AATCCTATTA AATTTGAAAG TGAGTGAGGT GATTAGAGTG AACGGACAGA  GGTACACCTG AGTTTTTTTT CCATATTTCC ATACTGATTC CAGTGTTGAG GTCATGATCC GTTTAATCTA ATTTGACAGC TCATATGGAT TGGATGATCA GAAATTTGAA GGGTCTCATG  TGTCGGCAAA TGTGTCAGAT CTTGAGCAGG TGATGCATAG AACTCGCCTT ACAGGGGGAT ATCCACATAA TTGTATATCT TTTACATAGC TTGTAACTAA CCCTTTCAGT TTGTATCATC  AAAGATTGTT AGGGCGTTAT ATGATATTGA GGAGGCAACA TCCACTGCTT TTGATATCGT TGTAGCACAC AAGGTAGGAA AACATCTTTT TGTTGCCTAT GCAACTATTT TGCTGGCCTA  TCTGATGCTC TTGTGAGCTC GAATGTTCTT CAGATGATCA AATCAGATAC TCGAGCTGCA CTTATTACAT TTCTTCAACT TTTGGTGGCT CATCACCCTT CTTGGAGGTG AAGTCCAACA  ATGCATATTT TAGCTTCAAA TATGTGCTTC TCCATCTTAT CTGAGAAATT TCTCTCAGGT GCCGAAAGGG AAGTGCTGGA ATACTTGTGA ACTTTGATGA CTTGTACCCA TCAGATCCAT  TGTCCTCTAA TGAAAAGGAC TCTACTGGCC CACAGGGTGG TTTGGTGGAC AATTTCCAAG TTTGTGGGAA AGAAGTGCCT CATGGTTATT GGGTCAGTAC TTATATTACT AGGCTTGTTC  TTTGATGGGT GACTATTCTG GAGCCGAATT CTTGTTTTTC TTGGATCTCA AAGAAACTAT CAATAGTTTT CTTATTTTAT GGAAAGGGCA TGTCATTGCC AGAGTATCAA TCACACAATA  AGTCTTAGCT TGTTTCGGAG TACTGAGAGT GCATTCTTAA ATGTATTTGA TTCTTCATCT TAACCTGGCT ATATAAACTT TACCAACTGA TTTTGACTGC AAGTTTTAGT CTACAACTGT  CGGCAACTCT TCTGTGGACT GAGTCTACCA CTTGCCTCGT ACATAATTTT TAATTTGCAC ATGTCACTCA TTTTTTTACT TCTCTTGAAA TTTCTTTTGT GAATTGGGAT AGAAGTTACT  GATTTGTTAT CTTGATGTTC TTTGCCTATT GTTTTTATCG TCAAATGTAT TGTGTCATGC TTCTTTCCTT GTTTATCCTC GTAATTGTTT TATTTTCTTC ATGTGAGCTA ACGCTTTTGC  CTGTTGTTAG GGATAGTCTT ATAAATACTA GCAAGTGGAT GATCAGGGCA AAAGAATTAT TGTATTAGGC TATTAGTTGA AAAATGAAAT TATGAGTAAA TAATTGGAAA TTTCAGATAT  TGAACCAGTG CCCAAGAGCT GGATTAGCAA TGTTCCTGAG TCAATTGTAA TTCGTTTAAC CACTAAATAA TCCTCTCTGT ATGTTTAAAT CACATTTCAC TATGGTCATT TATTATTCGT  TCGCTTGTCT ATATCTTCCT GTGCAGGTAT TTTGTCGAGG AAGTAGGAAT GAGACTAGAG GATTCAGGTA GTGGCTGCTG TCCTTATTTT CTTGTCATTT TTTCCCATAA AACTGGTCAT  TATTCTCTGA AATGTAGCTA GCACGTTGGT AGTTGAAAAG CTACGAGCTA ATTGTTTTAC AATACAAAAT GTTTGCATTG AAATTTTTTA AATTTTGCTA TCTTTTCTGT CTGGGGAGAC  CGGAAGAATC AGAATCTTAC AATTATTCTT TGTTAGCAAA AAGGATAAAG AATAATTTTT TTTTTTGGAT TTTATTCTAA TATGTAACAA AATCTACTTG CAGCTGTGGT TTGTGGCTCC  TGCTGCACTC GCTCTCTGTG AGGATCGAAA ATGAGGAAAG CCAGTTTGCA TTCAGGGCTA CTTGTGATTT TATTCACAAC TTTTTTGTCT GTGAGGAGTG TCGAGAACAT TTTTATGAGA  TGTGCTCGAG GTAGAGCTTA TTATTGCTGA ATCTCATCCA TCATTAACCA CTGTTGAAGA CTTGGGATTT GAGACATTGC CTAACTGAAT CTTTGTTTTT GTTCTACAGT GTAACTAGTC  CATTCACCAA ATCACGTGAC TTTGCCATTT GGCTATGGGA TGCACATAAT AAAGTGAATG AGAGGCTGAT GAAAGAAGAA GCTTCTCTGG GAACCGGTGA TCCTAAATTC CCAAAGATCA  TTTGGCCTCC AGAGCAGCTC TGTCCTTCAT GCTTTATTTC TCAGAGTCGA AAAAGAAATG GAGCCAATCG CATTGAGTGG GACCATGATG AGGTGTTCAA ATTCTTGTGT GGCTATTACG  GGGTAAAGCT CATGTCTCTT TACAAAGACA AGGGTGTTGT GAAAGGAGGA ATCAAACTCA TGGCCGGGGG AGGAACAGGT GGGGATGCCG ATGATACAGC AGTCTCGACA CATGCAGTTG  TAGTTCCTGT TGGAGCTGCC TTGGCGATTG CGTTTGCTAG CTGTGCATTT GGAGTGTTGG CCTGGTTTTG GCGTTCACAA CAGAAGAATC GGAAGTATGC ACATCATCTA CACTCTTTTA 
AAGAAACATG A 

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCTCGGT TATTTTTTGT AATATTATTT GTATTGAGCG TCGGAGTTCG AACGACGTCC TCCGTCGGAT CGTGGAGGTC AATTCTTCGA GCAATCGATG AGAAAACCTA CAACGCTGTT  CATCATCCTG ATGTGGGCGT TGAACTTAAT GCCACGGATT TTGATTCTGT GCTTGGGGGC ACCTTGGCTA CTCATGCTAT TGTTGAGTTC TTCGCTCACT GGTGCCCTGC TTGCAGAAAT  TATAAGCCTC ATTACGAGAG GGTGGCTAGG CTATTTAACG GACCTGGGGC AGTACATCCT GGCATCATTC TTATGACAAG GGTGGATTGT GCATTAAAGA TAAATACAAA GCTCTGTGAT  AAATTCTCTG TGGGCCACTA TCCAATGCTG TTCTGGGGAC CTCCATCCAA ATTTGTAGGT GGTAGTTGGA AACCTCAGCA GAAGAAAGGC GACATATCTG TCATTGATGA TGGACGGACT  GCTGATCGTT TGCTTAATTG GATAGACAAG AAAATAGGCA GCTCATATGG ATTGGATGAT CAGAAATTTG AAGGGTCTCA TGTGTCGGCA AATGTGTCAG ATCTTGAGCA GATTGTTAGG  GCGTTATATG ATATTGAGGA GGCAACATCC ACTGCTTTTG ATATCGTTGT AGCACACAAG ATGATCAAAT CAGATACTCG AGCTGCACTT ATTACATTTC TTCAACTTTT GGTGGCTCAT  CACCCTTCTT GGAGGTGCCG AAAGGGAAGT GCTGGAATAC TTGTGAACTT TGATGACTTG TACCCATCAG ATCCATTGTC CTCTAATGAA AAGGACTCTA CTGGCCCACA GGGTGGTTTG  GTGGACAATT TCCAAGTTTG TGGGAAAGAA GTGCCTCATG GTTATTGGGT ATTTTGTCGA GGAAGTAGGA ATGAGACTAG AGGATTCAGC TGTGGTTTGT GGCTCCTGCT GCACTCGCTC  TCTGTGAGGA TCGAAAATGA GGAAAGCCAG TTTGCATTCA GGGCTACTTG TGATTTTATT CACAACTTTT TTGTCTGTGA GGAGTGTCGA GAACATTTTT ATGAGATGTG CTCGAGTGTA  ACTAGTCCAT TCACCAAATC ACGTGACTTT GCCATTTGGC TATGGGATGC ACATAATAAA GTGAATGAGA GGCTGATGAA AGAAGAAGCT TCTCTGGGAA CCGGTGATCC TAAATTCCCA  AAGATCATTT GGCCTCCAGA GCAGCTCTGT CCTTCATGCT TTATTTCTCA GAGTCGAAAA AGAAATGGAG CCAATCGCAT TGAGTGGGAC CATGATGAGG TGTTCAAATT CTTGTGTGGC  TATTACGGGG TAAAGCTCAT GTCTCTTTAC AAAGACAAGG GTGTTGTGAA AGGAGGAATC AAACTCATGG CCGGGGGAGG AACAGGTGGG GATGCCGATG ATACAGCAGT CTCGACACAT  GCAGTTGTAG TTCCTGTTGG AGCTGCCTTG GCGATTGCGT TTGCTAGCTG TGCATTTGGA GTGTTGGCCT GGTTTTGGCG TTCACAACAG AAGAATCGGA AGTATGCACA TCATCTACAC 
TCTTTTAAAG AAACATGA 

Retrieve as FASTA