Entry information : StPrx29(Soltu.DM.05G018830)
Entry ID 1932
Creation 2006-08-31 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2006-08-31 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2021-10-27 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: StPrx29(Soltu.DM.05G018830)
Name StPrx29(Soltu.DM.05G018830)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx007]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Solanum tuberosum (Potato)    [TaxId: 4113 ]
Cellular localisation N/D
Tissue types Flowers
Roots
Sprouting eyes
Stolons
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value StPrx29
start..stop
S start..stop
StPrx49 664 0 1..328 1..328
LePrx100 635 0 1..328 1..328
LePrx33 633 0 1..327 1..327
LePrx12 617 0 1..328 1..328
Literature and cross-references StPrx29(Soltu.DM.05G018830)
Protein sequence: StPrx29(Soltu.DM.05G018830)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   327 (306)
PWM (Da):   %s   35773.1 (33455.9) Transmb domain:   %s   i5-22o
PI (pH):   %s   7.72 (7.75) Peptide Signal:   %s   cut: 22 range:22-327
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MATFGYLSPL ILLCILVSSH AQLQQNFYAK SCPKAEKIIL EYVHKHIPNA PSLAAALIRM HFHDCFVRGC DASVLLNFTS STGNQTEKFG IPNLTLRGFS FIDNVKKIIE DECPGVVSCA  DIVALVARDS VVVTGGPSWS VPTGRRDGRI SNASETLTDI PAPTSNFSTL QNDFSRKGLD LKDLVLLSGA HTIGISHCSS FSTRLYNFTG TFGTQDPSLD SEYAANLKAN KCKSINDNTT 
IVEMDPGSFR TFDLSYYKLL LKRRGLFQSD AALTTSTTTK SYIDQLVAGS LKEFYVEFAQ SMEKMGRIEV KTGSDGEIRK HCAVVNS* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Tandem duplication
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTACAT TTGGGTATTT GAGCCCTCTA ATATTGTTGT GTATCTTAGT GTCTAGCCAT GCTCAATTAC AACAAAACTT CTATGCCAAG AGTTGTCCAA AAGCAGAAAA GATCATTTTA  GAATATGTCC ACAAACACAT TCCAAATGCT CCATCTCTTG CTGCTGCCTT AATCAGAATG CATTTCCATG ATTGTTTTGT CAGGGTATGT AATTATTAAT TACTTTCACT ATTTCAATCT  ACGTGAATTA CTTTCCTTTT CAGTTTGTTT CAAAATGAAT GTGACTTTCT ATATTTCATA TTGACTCTTT TAATCCCTAA TATCTCACGT AACATGTTTA AGTTTACAAA ATTCAAGGAC  ACTTTCACAG TACATTTTTA GTTTAAGATC ACAACATTCA AAAATATTGC ATAGTTGATA TAATTCTTTT TTTTTTTTTT TTTGTGGTGA TTGTAGGGAT GTGATGCATC TGTGTTGTTG  AATTTCACTT CAAGTACAGG AAACCAAACT GAAAAATTTG GTATCCCAAA TCTAACACTT AGAGGTTTCT CATTCATTGA TAATGTGAAG AAAATAATTG AAGATGAATG CCCTGGAGTT  GTCTCTTGTG CTGATATTGT TGCCTTAGTT GCTAGAGACT CTGTTGTGGT CACAGTAAGC CAATTCAACT TGAACTTTAC AATATATTTT ATTTGTTATG TATGACCATT TTAATTCATA  TATTTTTGGG CATGATATAT AGGGAGGTCC TTCATGGAGT GTACCAACAG GAAGAAGAGA TGGAAGAATC TCTAATGCTT CAGAAACCTT AACAGACATT CCAGCTCCAA CTAGTAACTT  TTCCACTCTC CAAAATGATT TTTCTAGGAA GGGTCTTGAC CTTAAAGACT TGGTCCTATT ATCTGGTAAG TCTAAATTAT TACGTCCTCT GTTTCATTTT ATGTGACAAG TTTGACTCAG  TATAGAATTT CAAGTCTTGA CAATAATTAT CATGGACGAT ATTTCAGGTG CTCACACTAT TGGAATCTCT CATTGCTCAT CATTCTCAAC GCGTTTGTAT AATTTTACTG GAACTTTTGG  TACTCAAGAT CCATCTCTAG ACAGTGAATA TGCAGCTAAC CTTAAGGCCA ATAAATGCAA ATCAATCAAC GATAACACAA CAATAGTTGA AATGGACCCA GGGAGTTTCA GGACATTTGA  TCTTAGCTAT TACAAGCTTT TACTCAAAAG GAGAGGACTC TTCCAATCCG ATGCAGCCTT GACAACAAGT ACAACAACAA AGTCATACAT TGACCAACTT GTCGCGGGAT CACTTAAAGA 
GTTTTATGTT GAATTTGCTC AATCGATGGA GAAAATGGGA AGGATTGAAG TTAAAACAGG TTCCGATGGT GAAATTAGGA AGCATTGTGC GGTTGTGAAT AGTTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTACAT TTGGGTATTT GAGCCCTCTA ATATTGTTGT GTATCTTAGT GTCTAGCCAT GCTCAATTAC AACAAAACTT CTATGCCAAG AGTTGTCCAA AAGCAGAAAA GATCATTTTA  GAATATGTCC ACAAACACAT TCCAAATGCT CCATCTCTTG CTGCTGCCTT AATCAGAATG CATTTCCATG ATTGTTTTGT CAGGGGATGT GATGCATCTG TGTTGTTGAA TTTCACTTCA  AGTACAGGAA ACCAAACTGA AAAATTTGGT ATCCCAAATC TAACACTTAG AGGTTTCTCA TTCATTGATA ATGTGAAGAA AATAATTGAA GATGAATGCC CTGGAGTTGT CTCTTGTGCT  GATATTGTTG CCTTAGTTGC TAGAGACTCT GTTGTGGTCA CAGGAGGTCC TTCATGGAGT GTACCAACAG GAAGAAGAGA TGGAAGAATC TCTAATGCTT CAGAAACCTT AACAGACATT  CCAGCTCCAA CTAGTAACTT TTCCACTCTC CAAAATGATT TTTCTAGGAA GGGTCTTGAC CTTAAAGACT TGGTCCTATT ATCTGGTGCT CACACTATTG GAATCTCTCA TTGCTCATCA  TTCTCAACGC GTTTGTATAA TTTTACTGGA ACTTTTGGTA CTCAAGATCC ATCTCTAGAC AGTGAATATG CAGCTAACCT TAAGGCCAAT AAATGCAAAT CAATCAACGA TAACACAACA  ATAGTTGAAA TGGACCCAGG GAGTTTCAGG ACATTTGATC TTAGCTATTA CAAGCTTTTA CTCAAAAGGA GAGGACTCTT CCAATCCGAT GCAGCCTTGA CAACAAGTAC AACAACAAAG  TCATACATTG ACCAACTTGT CGCGGGATCA CTTAAAGAGT TTTATGTTGA ATTTGCTCAA TCGATGGAGA AAATGGGAAG GATTGAAGTT AAAACAGGTT CCGATGGTGA AATTAGGAAG 
CATTGTGCGG TTGTGAATAG TTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATAACACAAA CACAATAAAG AAAAAAATAT AGTTTCTATC TATTTTGAAG ATAAAGAAAC AAAATGGCTA CATTTGGGTA TTTGAGCCCT CTAATATTGT TGTGTATCTT AGTGTCTAGC  CATGCTCAAT TACAACAAAA CTTCTATGCC AAGAGTTGTC CAAAAGCAGA AAAGATCATT TTAGAATATG TCCACAAACA CATTCCAAAT GCTCCATCTC TTGCTGCTGC CTTAATCAGA  ATGCATTTCC ATGATTGTTT TGTCAGGGGA TGTGATGCAT CTGTGTTGTT GAATTTCACT TCAAGTACAG GAAACCAAAC TGAAAAATTT GGTATCCCAA ATCTAACACT TAGAGGTTTC  TCATTCATTG ATAATGTGAA GAAAATAATT GAAGATGAAT GCCCTGGAGT TGTCTCTTGT GCTGATATTG TTGCCTTAGT TGCTAGAGAC TCTGTTGTGG TCACAGGAGG TCCTTCATGG  AGTGTACCAA CAGGAAGAAG AGATGGAAGA ATCTCTAATG CTTCAGAAAC CTTAACAGAC ATTCCAGCTC CAACTAGTAA CTTTTCCACT CTCCAAAATG ATTTTTCTAG GAAGGGTCTT  GACCTTAAAG ACTTGGTCCT ATTATCTGGT GCTCACACTA TTGGAATCTC TCATTGCTCA TCATTCTCAA CGCGTTTGTA TAATTTTACT GGAACTTTTG GTACTCAAGA TCCATCTCTA  GACAGTGAAT ATGCAGCTAA CCTTAAGGCC AATAAATGCA AATCAATCAA CGATAACACA ACAATAGTTG AAATGGACCC AGGGAGTTTC AGGACATTTG ATCTTAGCTA TTACAAGCTT  TTACTCAAAA GGAGAGGACT CTTCCAATCC GATGCAGCCT TGACAACAAG TACAACAACA AAGTCATACA TTGACCAACT TGTCGCGGGA TCACTTAAAG AGTTTTATGT TGAATTTGCT  CAATCGATGG AGAAAATGGG AAGGATTGAA GTTAAAACAG GTTCCGATGG TGAAATTAGG AAGCATTGTG CGGTTGTGAA TAGTTAAGAG GAGTCTTTGG CTCTTTTGGT TCCATGATTT  TGAGTTGCTA TATGTATCAT TGTTTCTTTT GCATTCTGTT TCTTCATCGT GTTCATTTTG TAATTAGTCC TTTTTTTGTT TGTTTGTAAT ATTCCGTTCT ATTTCGTAAC TTGATGGTTG 
TTTAAATAAA GGCAGCCCTT TAAATTTATT CAATTTTTTA TTTGGACACT TCAA 

Retrieve as FASTA