Entry information : GmAPx03 (Glyma12g03610)
Entry ID 2228
Creation 2007-02-14 (Felipe Teixeira)
Last sequence changes 2007-02-14 (Felipe Teixeira)
Sequence status complete
Reviewer Qiang Li
Last annotation changes 2011-12-13 (Qiang Li)
Peroxidase information: GmAPx03 (Glyma12g03610)
Name (synonym) GmAPx03 (Glyma12g03610)
Class Ascorbate peroxidase    [Orthogroup: APx2003]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Fabaceae Glycine
Organism Glycine max (soybean)    [TaxId: 3847 ]
Cellular localisation Peroxisomal
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value GmAPx03
start..stop
S start..stop
GmAPx04 540 0 1..287 1..287
VuAPx02 524 0 1..287 1..287
LjAPx02 509 0 1..287 1..287
MtAPx02 498 1.04e-180 1..287 1..287
Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '2228' 'complement(join(2417292..2417483,2417974..2418076,2418210..2418289,2418379..2418461,2418604..2418652,2418741..2418806,2421747..2421796,2422146..2422270,2422420..2422535))' Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 2422420..2422535 114 N° 2 2422146..2422270 123 N° 3 2421747..2421796 48 N° 4 2418741..2418806 64
N° 5 2418604..2418652 47 N° 6 2418379..2418461 81 N° 7 2418210..2418289 78 N° 8 2417974..2418076 101
N° 9 2417292..2417483 190  
complement(join(2417292..2417483,2417974..2418076,2418210..2418289,2418379..2418 461,2418604..2418652,2418741..2418806,2421747..2421796,2422146..2422270,2422420. .2422535))


exon

Literature and cross-references GmAPx03 (Glyma12g03610)
Literature Shoemaker,R., Keim,P., Vodkin,L., Erpelding,J., Coryell,V., Khanna ,A., Bolla,B., Marra,M., Hillier,L., Kucaba,T., Martin,J., Beck,C., Wylie,T., Underwood,K., Steptoe,M., Theising,B., Allen,M., Bowers ,Y., Person,B., Swaller,T., Gibbons,M., Pape,D., Harvey,N., Schurk ,R., Ritter,E., Kohn,S., Shin,T., Jackson,Y., Cardenas,M., McCann ,R., Waterston,R. and Wilson,R. Public Soybean EST Project.
DNA ref. Phytozome 12:   Gm12 (2422535..2417292)
EST ref. GenBank:   AI495918
Cluster/Prediction ref. UniGene:   Gma.6091
Protein sequence: GmAPx03 (Glyma12g03610)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   287
PWM (Da):   %s   31616.34 Transmb domain:   %s   o258-280i
PI (pH):   %s   6.52
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MALPVVVDAEYLKEVDKARRDLRALIANRNCAPLMLRLAWHDAGTYDAKTKTGGPNGSIRNEEEYSHGANNGLKKAIDFEEVKEKHPKITYADLYLAGVVAVEVTGGPTIDFAPGRRDSK
ISPNEGRLPDAKK
GVSHLHDIFYRMGLTDRDIVALSGGHTGRAHPERSGFDGPWTEDPLKFDNSYFVELLKEDSAGLLKLPTDKALLEDAEFRRYVELYADEDAFFRDYAESHKKLSELG
FVPSSKPISIKDGTILAQGAVGVVVTAAVVIISYLYEVRKRGK*

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete from genomic and 47 ESTs. ESTs from GmAPx03 and GmAPx04 have been compile in the same Unigene Gma.6091.
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCCTTGCCAGTGGTCGTCGACGCAGAGTACCTCAAAGAGGTCGACAAGGCTCGCCGCGATCTCCGCGCACTCATCGCTAACAGGAACTGCGCTCCTCTCATGCTTCGATTGGCGTAT
GTACTTCTTCTTCTCTCTCTATCGCTTTTATTTTTTCTTTAGTCGAACAATTTCATGTTAATTCTTAGATTTCGAGTTGGTCAACGCTGCGATCGTGCTATTGTGTTTAGTTTTTCTGTG
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GTATGCTTTTTCTTAATTGAGTTAATTCCTTCGCTTTTATCTTTTCCTAAAATTATCATTCAATAATCGTTTTCATTTTGCTAGCTAG
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GCTTATTTTCTGATGTCACAGAGAGGAAGTGAAGGAAAAACATCCTAAAATTACATATGCAGATCTCTACCAGGTGATCATTTGTTTTCATTCAGTTGCTATGAAAGTCTGTAGTGAATC
TGATAATTTTGTAATGAATTCATTAGGTGAAAATTGTAGAATGGGGTCAATGGACTTTCAAACTTGTCTGGCATGTGCATGATAGTTGATTACGGGTTCCATTTTCGTCCACTATCAATT
CAAATGACTCTTTTTGTACACTGTTTTTAACTCAAATCTCATGGATGCTGCTGAGGCTTTGGTTTTCCCGTAGTGTTAGGTGGGATTAGTTTATGACTCTTGTTTCTATTTTGTTCCCTG
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GTCAACTCTGATTACTTATGGTTTCAAATTGTGGACCACATCCGATGATGCGGCCACAATAATGTGGGACTTGTTGTTGTAGTTGTGTTCACAATCACATCACACCTTTTGATGTGTTTG
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TTCTTGTACTTATTTATCTCTATCCTCTAAGAAAATCCCTTTTCTTTCCAAAGACAGCATGGGTTGCTTGTTCTATTTAATTGGATACAGGTTTGCTTTTCTTGGCCTTGTACCTTATCT
GTGAGGTTCCAAGGTTTTTGAAAAGTTGTCAAGGAATTATGCTATGCCTTGAATTTGGGTAAGGGGGCTGTTCTGTGATGGAACCATTTTAAGGGGGAGAGCCCAACTTGATTGCTCTTC
TATAGACTTCATTTTTTGAGCTATTTGTTTGGTTAGTTGCTTTATGTGATTCGAGAGCATATGCATTTTGATGAGATTTTGCTATTGATATTAATAACATGAATTAAAGGAATACAAGTA
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TAACTCTTACAAGTTTACAAGTCCACTTACTCTCTGCGAGTTGACTCATGTGCAAACACTCTTTTTAGTAGACTCGGCGTAGACTCAATGCAAACTCGGTAAACTCTTTAGTTTACCATC
GAACTAGCGAGTCAGTAAGTTAAAGAAATTAGACCAAAACACAAGTCGTTTTGGGTTGTTTACTGTACGTTTAGGATTCAACATACCTCTATTTAGTGTGTTGCTTCTAAATTGAAGAAC
CCTCTCCTCTAACAACATCAAACTTTTATTCTCCAACAACATCAAATCCTCGACGAGAATGCTCTACCACTATTATCATCTCTGCAAGTTATTATCTAGTAGTGATGCATCACTACACTT
GGTTATTTAAGTATTGTGGAATTTATGATTTACTGTTTTATTTATTATGTTGTTGATATGTTTAATTAGTATGTTATTTATAAGTATTTTGTTATTATTTTTATATGAAGTAGACTCTTA
CGAGTCTACGAGTTAAGTTTGTGTCCATGAGTTTCAATAGACTCTCAAGTTTGATAACCTTGGCTCCTATTTAACAGATTCCCCTTTCTCTCTCTGTAACTACTTTCTCTATAACAACCT
TCCCCTTAACTTCTAATTTCTGCCAACAGGCATGTTGGGCTTAAGAGTTTTGGGCCTCTAGGTATAAACCTGGAAAGGCCTACCTATTGTTGATTGCTGGATCCTATCACATTTGCATTC
CCCTTAATCAAATTCTAGCCCTGCCTCCCAATTATTTAAAAGGAACTCATGATCTGTTTCATTCTGCCCAGTGCCCACAAATCTCTATCAGCTCAAAAGGGAGGGGGAACAAATCCCTAA
AACAAGAATTCTGGGTAGCTATATCTATTTTGTATTAGTAGCAGTAATACACCTAGAGGTTGCTAGTTAAGGAGTGTACAGGAGTACAATTGAAGTTCAAGCTTCTATGTAAGTTAATGC
AATGAGTTTCAAGTTTTAATAGCTTAAGCATTTACCTGGTTGTGGTCCAATTCTTTTGTAGCTAGTTTTTGAAATGCATATAGTTAACTTAGTGCCTAGGATTTCTACAATAAAGGTGAA
TACCGTTTGATTTTCTTATACACTAATGTACTAATGTTAAAGGTTAGCAAATATCAGCAATTTGATATTCTGAAAATCAAAATTTTCCTTAAGATTACTGAAATAATTTATATCAAAATC
AAGCATTTACTGGATTTTTGTGTATATCACATACAAGCCATTTAAATCCAATGAGTGCATGAGTCCAGATTCTGTTGAAACAGAGAGGGAGGAGATTATCACTCATTGACAAATAAAAAA
ATAAAAAAAATTGATAGGTCATACCTTGTTTAAAACAAGATTTGCATTCATAAGTAGAAACGGACTTAAACTAACTGCCATATAGATTATACAAATCTGATTAAAAATAATTTCTTTGTC
CTTGTGCTTCCAGCTCTTGCGGGTGTTGTTGCAGTTGAGGTTACCGGGGGTCCCACAATTGATTTCGCTCCTGGTAGAAGGGTATGTTGTGCCATGCCTTTGGTCAGAATATTAATTGTT
AGGAAATCATCGGATCTTGTTTTGTTAATGTAATTTTCTGTTCTTATAGGAGATTCAAAAATATCTCCTAATGAAGGGCGGCTTCCTGATGCTAAAAAAGGTGTTTTTAAATTTTTTTCA
GTGATAAAACTATTCTCTTCACCTGGACTGTGAAAGATGTTCTATTTTTTGTATTCCCTTCACAATGGACGAGGTTATGAATGCGATATGAAAGCATAAAAATATGTCAATGCTGTTGTT
AGGTGTGTTTCACATCTCCATGATATCTTTTATCGAATGGGCTTGACTGACCGAGATATTGTTGCACTATCTGGAGGACATACACTGGTAATTCTCCTTTTGTGTAATATCTTTTTATTA
CTTGCTGTGATTATGGCTAGATATTCTTATCTTACTTTCTGTGGTGATCTTATAAGGGGGGAGAGCACATCCAGAGAGATCAGGGTTTGATGGCCCTTGGACAGAGGACCCTCTGAAGTT
TGATAACTCATACTTTGT
GTAAGACTTGTGTTGTATGAATGCTATTCATTTTTGCTTTTCTACAAAGGCATTTTGTAGAGCTTCACTTTTGCCTTGCAATACCGAAAGAGTTTGATTTTT
ATCTACAACTAAATATCATCGTTAACATCAGGGGGAACTTTTGAAAGAAGATTCTGCTGGGCTGCTTAAACTTCCAACAGACAAGGCTTTATTGGAGGATGCTGAATTTCGCCGTTATGT
TGAGCTATATGCAAAG
GTAATTGAGATTAATTCAAATAACCACCGTGTGAAATTTGTTTGACGCTGTGTCCTAATTACCAATTAATGTTTCTCAATAGCATTTCATGGGTCTATTTGTTT
ACTATAAACACCATGAAGCTTGTAATCATATTGCATTAATTATTAGATCAATCTTTTGGCCTGAGGTACCCACTAGGGTTGGCTTAATGGTTGGTCAGGAATTAATAAAACTACGTACTT
TGCCAACAATTGACTAAACTTTGGTCTTTTTTCCTTCTTTAGACTAATGAAACTAAATAACATGCCTGATAGTGTTAGCACGCACTTGTATGTAGAGTTGTAGAATAACTTATCTAAGAC
ATCAGTGTGAAGTTTCTATTTTGCTCTAAAGCTATTAAAGAAAATTAAGAGCATACTGTTTTCAGCAAAGTTCTGACTGCTGTCAATGCACCATTGAATTGTGTGAATCTGTCTGCCATC
TCATTTTTATACTGTCATTCTGGCAGGAGACGAGGATGCATTTTTTCGAGATTATGCTGAATCACATAAGAAACTTTCAGAGCTAGGCTTTGTGCCAAGTTCAAAGCCGATTTCTATTAA
GGATGGGACCATACTGGCACAAGGTGCTGTAGGAGTTGTAGTTACTGCCGCAGTGGTGATCATCAGTTACTTGTATGAAGTTCGCAAAAGAGGGAAGTAA

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCCTTGCCAGTGGTCGTCGACGCAGAGTACCTCAAAGAGGTCGACAAGGCTCGCCGCGATCTCCGCGCACTCATCGCTAACAGGAACTGCGCTCCTCTCATGCTTCGATTGGCCTGG
CACGATGCCGGAACTTACGATGCTAAGACCAAGACTGGTGGACCTAACGGTTCGATCCGTAACGAGGAAGAGTATTCTCACGGCGCCAACAATGGCTTGAAGAAGGCTATTGATTTCTGT
G
AGGAAGTGAAGGAAAAACATCCTAAAATTACATATGCAGATCTCTACCAGCTTGCGGGTGTTGTTGCAGTTGAGGTTACCGGGGGTCCCACAATTGATTTCGCTCCTGGTAGAAGGGAT
TCAAAAATATCTCCTAATGAAGGGCGGCTTCCTGATGCTAAAAAAG
GTGTTTCACATCTCCATGATATCTTTTATCGAATGGGCTTGACTGACCGAGATATTGTTGCACTATCTGGAGGA
CATACACTG
GGGAGAGCACATCCAGAGAGATCAGGGTTTGATGGCCCTTGGACAGAGGACCCTCTGAAGTTTGATAACTCATACTTTGTGGAACTTTTGAAAGAAGATTCTGCTGGGCTG
CTTAAACTTCCAACAGACAAGGCTTTATTGGAGGATGCTGAATTTCGCCGTTATGTTGAGCTATATGCAAAG
GACGAGGATGCATTTTTTCGAGATTATGCTGAATCACATAAGAAACTT
TCAGAGCTAGGCTTTGTGCCAAGTTCAAAGCCGATTTCTATTAAGGATGGGACCATACTGGCACAAGGTGCTGTAGGAGTTGTAGTTACTGCCGCAGTGGTGATCATCAGTTACTTGTAT
GAAGTTCGCAAAAGAGGGAAGTAA

Retrieve as FASTA