Entry information : PoVP06_IS-1 (mnp3)
| Entry ID | 2391 |
|---|---|
| Creation | 2006-09-21 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2012-10-29 (Christophe Dunand) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Not yet reviewed |
| Last annotation changes | 2012-10-29 (Christophe Dunand) |
Peroxidase information: PoVP06_IS-1 (mnp3)
| Name (synonym) | PoVP06_IS-1 (mnp3) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Versatile peroxidase [Orthogroup: VP001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Fungi Basidiomycota Agaricomycetes Pleurotaceae Pleurotus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Pleurotus ostreatus (Oyster mushroom) [TaxId: 5322 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
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| Tissue type | N/D |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '2391' 'join(22..269,326..460,510..634,686..761,822..947,999..1068,1124..1133,1185..1220,1276..1448,1520..1566,1597..1627)' |
Exons►
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Literature and cross-references PoVP06_IS-1 (mnp3)
| Literature | Irie T., Honda Y., Ha H.-C., Watanabe T., Kuwahara M. Isolation of cDNA and genomic fragments encoding the major manganese peroxidase isozyme from the white rot basidiomycete Pleurotus ostreatus. J. Wood Sci. 41:230-233(2000). |
|---|---|
| Protein ref. | UniProtKB: O74640 O74179 [Incorrect splicing] |
| DNA ref. | GenBank: AB016519 |
| mRNA ref. | GenBank: AB011546 |
Protein sequence: PoVP06_IS-1 (mnp3)
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic (10 introns) and mRNA. Incorrect prediction of the last exon in one swiss prot entries O74179 (CASTPF is missing ). Strain="IS-1". |
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| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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