Entry information : PoVP06_IS-1 (mnp3)
| Entry ID | 2391 |
|---|---|
| Creation | 2006-09-21 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2012-10-29 (Christophe Dunand) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Not yet reviewed |
| Last annotation changes | 2012-10-29 (Christophe Dunand) |
Peroxidase information: PoVP06_IS-1 (mnp3)
| Name (synonym) | PoVP06_IS-1 (mnp3) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Versatile peroxidase [Orthogroup: VP001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Fungi Basidiomycota Agaricomycetes Pleurotaceae Pleurotus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Pleurotus ostreatus (Oyster mushroom) [TaxId: 5322 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tissue type | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Inducer | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repressor | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Best BLASTp hits |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene structure Fichier |
Exons►
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Literature and cross-references PoVP06_IS-1 (mnp3)
| Literature | Irie T., Honda Y., Ha H.-C., Watanabe T., Kuwahara M. Isolation of cDNA and genomic fragments encoding the major manganese peroxidase isozyme from the white rot basidiomycete Pleurotus ostreatus. J. Wood Sci. 41:230-233(2000). |
|---|---|
| Protein ref. | UniProtKB: O74640 O74179 [Incorrect splicing] |
| DNA ref. | GenBank: AB016519 |
| mRNA ref. | GenBank: AB011546 |
Protein sequence: PoVP06_IS-1 (mnp3)
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
|
||||||||||||
| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
|
||||||||||||
| Remarks | Complete sequence from genomic (10 introns) and mRNA. Incorrect prediction of the last exon in one swiss prot entries O74179 (CASTPF is missing ). Strain="IS-1". |
||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
|
||||||||||||
| CDS► Send to BLAST |
|
||||||||||||
