Entry information : PoVP02_Florida (mnp2)
| Entry ID | 2392 |
|---|---|
| Creation | 2006-08-31 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2011-11-17 (Christophe Dunand) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Not yet reviewed |
| Last annotation changes | 2011-11-17 (Christophe Dunand) |
Peroxidase information: PoVP02_Florida (mnp2)
| Name (synonym) | PoVP02_Florida (mnp2) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Versatile peroxidase [Orthogroup: VP002] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Fungi Basidiomycota Agaricomycetes Pleurotaceae Pleurotus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Pleurotus ostreatus (Oyster mushroom) [TaxId: 5322 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tissue type | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Inducer | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repressor | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Best BLASTp hits |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '2392' 'join(630..687,743..876,931..992,1046..1195,1252..1373,1421..1496,1551..1587,1644..1651,1703..1783,1837..1906,1961..1970,2021..2056,2117..2293,2353..2388,2447..2471,2525..2537)' |
Exons►
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Literature and cross-references PoVP02_Florida (mnp2)
| Literature | REFERENCE 1 Giardina P., Palmieri G., Fontanella B., Rivieccio V., Sannia G. Manganese peroxidase isoenzymes produced by Pleurotus ostreatus grown on wood sawdust. Arch. Biochem. Biophys. 376:171-179(2000).
|
|---|---|
| Protein ref. | UniProtKB: Q9UVY8 Q96V55 [Other strain] |
| DNA ref. | GenBank: AJ243977 |
Protein sequence: PoVP02_Florida (mnp2)
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
|
||||||||||||
| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
|
||||||||||||
| Remarks | Complete sequence from genomic (15 introns). mRNA accession gives a slightly different sequence (aigvSncag instead of aigvTncag). The authors of the mRNA sequencing (Cohen et al., Environ. Microbiol. 2001, p.312) write that their mRNA sequence is truly mnp2. Strain="Florida 6". | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
|
||||||||||||
| CDS► Send to BLAST |
|
||||||||||||
