Entry information : HaAPx01 (HanXRQChr05g0133141)
| Entry ID | 2599 |
|---|---|
| Creation | 2010-05-26 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2016-04-27 (Christophe Dunand) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Not yet reviewed |
| Last annotation changes | 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio)) |
Peroxidase information: HaAPx01 (HanXRQChr05g0133141)
| Name (synonym) | HaAPx01 (HanXRQChr05g0133141) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Ascorbate peroxidase [Orthogroup: APx2001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Helianthus annuus (Sunflower) [TaxId: 4232 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | Cytosolic |
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| Tissue type | Embryos |
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| Inducer | Constitutively induced |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '2599' 'join(21038441..21038559,21039358..21039532,21039611..21039676,21039799..21039847,21039976..21040061,21040143..21040222,21040293..21040395,21040472..21040530,21040628..21040643)' |
Exons►
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Literature and cross-references HaAPx01 (HanXRQChr05g0133141)
| Literature | Michelmore,R.W., Knapp,S., Rieseberg,L., Bradford,K., Kesseli,R., Boore,J., Kozik,A., Matvienko,M., Lavelle,D. and Lai,Z. Sunflower (Helianthus annuus) ESTs (set 2) from the Compositae Genome Project http://compgenomics.ucdavis.edu/. |
|---|---|
| DNA ref. | HanXRQ genome: HanXRQChr05 (21038441..21040643) |
| EST ref. | GenBank: CD854104 |
| Cluster/Prediction ref. | HanXRQ: HanXRQChr05g0133141 UniGene: Han.5838 |
Protein sequence: HaAPx01 (HanXRQChr05g0133141)
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic and 16 ESTs. Assembly by PeroxiBase Team. Strain="ANN1312". | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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| cDNA► Send to BLAST |
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