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Entry information : HaAPx03 (HanXRQChr17g0544251)
Entry ID 2600
Creation 2006-01-23 (Nenad Bakalovic)
Last sequence changes 2016-04-27 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: HaAPx03 (HanXRQChr17g0544251)
Name (synonym) HaAPx03 (HanXRQChr17g0544251)
Class Ascorbate peroxidase    [Orthogroup: APx2003]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation Peroxisomal
Tissue type Germinating seeds
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaAPx03
start..stop		 S start..stop
LsaAPx02 553 0 1..285 1..285
CiAPx02 541 0 1..282 1..282
GhyAPx02 516 0 1..284 1..285
HargAPx03 508 0 1..285 1..284
Gene structure Fichier Exons►
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 36695910..36696022 111 N° 2 36696091..36696215 123 N° 3 36697803..36697852 48 N° 4 36698024..36698089 64
N° 5 36698315..36698363 47 N° 6 36699584..36699666 81 N° 7 36699768..36699847 78 N° 8 36699939..36700041 101
N° 9 36700807..36700995 187  
join(36695910..36696022,36696091..36696215,36697803..36697852,36698024..36698089 ,36698315..36698363,36699584..36699666,36699768..36699847,36699939..36700041,367 00807..36700995)


exon

Literature and cross-references HaAPx03 (HanXRQChr17g0544251)
Literature Kozik,A. et al., Lettuce and Sunflower ESTs from the Compositae Genome Project, unpublished
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr17 (36695910..36700995)
EST ref. GenBank:   BU032190.1 Heliagene:   HaT13l001732
Cluster/Prediction ref. HanXRQ:   HanXRQChr17g0544251 UniGene:   Han.4445
Protein sequence: HaAPx03 (HanXRQChr17g0544251)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   285 (262)
PWM (Da):   %s   31302.16 (28022.1) Transmb domain:   %s   o256-278i
PI (pH):   %s   6.64 (6.62) Peptide Signal:   %s   cut: 20 range:20-281
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MAMPIVDTEYLKQIDKARRELRAFIANKNCAPIMLRLAWHDAGTYDVNTKTGGPNGSIRTEEEYSHGSNNGLKIAIDFEEIKSKHPRITYADLYLAGVVAVEVTGGPTVDFVPGRQDSTVSPKEGRLPNATKGAPHLRDIFYRMGLSDKDIVALSGG
HTGRAHPERSGFEGPWTREPLKFDNSYFIELLKGESEGLLKLPTDIALLDDPAFRPYVDLYADEDAFFNDYALSHKKLSELGFTPSSKTVIKDGVVLAQSAVGVLVTAAVVILSYLYEAR
KKTK*

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and 10 ESTs.
DNA ►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCGATGCCTATTGTAGACACCGAATACCTTAAACAGATTGATAAAGCTCGTCGGGAGCTTCGTGCTTTTATCGCCAACAAGAATTGCGCACCAATCATGCTTCGATTAGCGCGTAAG
TCTTAAACATACATACATGCATGTATGACTGTATTGAAATTGATTATGATGATGTTGTTGTAGGTGGCATGATGCTGGAACATACGATGTGAATACGAAAACCGGAGGTCCCAACGGTTC
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TGGCGCTTAGGGTCCAGGCCAGGCCTATGCACCTTGAGTGTGCCTTTACGCCATGACAACATAGGGGTGGACAAGGGGCTTCATAGCTTATTGGTCTATAGTGAAGAACTTAAAGTTACT
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AGATTTGCTGTGTTATCTATAAAGAGAAAAGATATATACTTGAATAAACTACTTCTCCTGTTTGTTGCTTTAATGTGTATCCTCTTTCTTACCGCAGAGGAAATAAAGTCCAAACATCCA
AGGATTACTTATGCAGATCTATATCAGAGGTGCATTCATTGATGCTAAAGAAGTTTGTATTGATACATTTAGACATAGGGGTTTCTAGTTTATTGTTTTGTGGTAACTTAACTCCTATTG
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CTGTTGACTTTGTTCCTGGTAGACAGAGGTATCATGATTTATCACATTAGTTTTTCAAGTTTTTCTGTCAAGGTTCATTTCTTTTATTTTTCTTGCTTCTCTCCTGCACGACTGGTCACA
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TCTTTTTTTCTAGGACTCAACGGTCTCTCCCAAGGAAGGCAGACTCCCAAATGCTACCAAAGAGGTTTTTGATCCTTATTTTATTCTTAATAAAATCTTTTATAAGAACTGAGGCCTATT
TTAAATAGTGTCTCGGTAGTTACAAGATGATTCTTCGATCAGCGTCTCGTTCCTGATCTGAAACAGTTATATCGTTGACACGATTAATGAGTTTATAATTATAACTGTAATGACATCACT
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ATTTTGTTAAATACAGACACCGGAAATGTTGAGAGAAAATTTGTAAGATGGTTGTTTGTGATTGCATTATAAAGATCTCTTGCTGATCCTACTGTACAGTTCAGCATCTGTTGTTTTCCC
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TGATGAGGTAATATTGGTTAAAACCCCAATGCCTCTCAGGAAAGCATCGCCTCTTGTGTTGAGCAATTTATCCGTTTCCCCTTGATCAACAAGGGTGTTTTGGACATTTTGCTATGGTAC
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TACTTTATCTTCTAGAAGCAATTGTATTTTGCAAAACTCATGCCAACATAATCAAGTGAAACAATTGAAATACCTATGAATCTATGATGAATATTGACATGAACACTTGTTATATGCTAA
AGTCAAACAAATACTGTTACTTATTTACCAACAATCATTTTCATTTCGTATTACTTTCTACAAAGCTCAACTTGTCTGTGAAGGATTTCACAAGGTCAAGTGTCCACTGGGAACTTTGTG
TTATTGTTTACGTATTAATGTATTATACTCGTTACTTTCATCAATATGATAGGTTTTTAATTTTTCTAACATGTACTGATTTAGGTGCACCACACTTGCGGGACATATTTTACCGCATGG
GTTTATCTGACAAGGATATTGTAGCCCTATCTGGAGGACACACCCTTTTGTACGTTGCTAGTTTCTTGTTAGACGAATACCTTAATAATACTCTTTTTTCCATTCATGTTAATGTTTTTC
TTGTTTCTTGCTGAATTTTTGACGTTGCAGGGAAGAGCACATCCTGAAAGATCGGGCTTCGAAGGCCCTTGGACTAGGGAGCCACTGAAATTCGATAACTCATACTTCATATGTAAAACT
GGATGAAGCTTCACTATCATTCTCATTTATACTAAAATAATCATTTTCTATATACTAATACGACACTAATACTGTGAAACCAGTGAACTTCTGAAAGGCGAATCAGAGGGGCTACTAAAA
CTTCCTACAGACATCGCATTGCTGGATGATCCTGCGTTCCGTCCTTACGTTGACCTGTACGCCAAGAGGTATACCGTTTTCTTGTGTGGACGAGTTTGACTCAGTTAACAACACAATTTT
CGACTCAATAAGTTGCGACAACAATGGCGGATATGTAAACCTAACTAGAAACTTTTACTATTTAACCATAATAACTTTAAAGTTTAAAGTTTAAACAACCAGCCCCCACACGCACCACCC
CAACAGACATCCTTTAATAGGGTAGGAACCTACCTTAACGACTAAAATGGGAACCTATAACCAAACAAACATTAAAGCCAAATACAGTTGTGTGTTTGGTTTTGCCTAGATTGACAGTTG
GGACCCTCTCTGGACTCTGACTAATGGTCTGCTCCCATTATCTGTCCCCACCCACCCTAACCTCCATTTCAACTTGCAAATAATAATAAAACACACTCACCTGTTGCCAACAACCTTTGC
ACAGATTGTGCTCTTATTCAGGTACATTGTAAGTCATATGAAACTAAATCCTCCTGGCTGCAACATGACTTAGGTTCCTTCCTTCTTACACTAATTTTAAACTAATACTTGTACAGTACA
TTCTCTTAATGCCACAATTAATCTCATTTGACTTTTTTATTTGATTGGTTGTTAACACATCTTTTTCCAAATTTATACCTTATTATTATATGGGATGACTAAAATGGTATTTTATGAGTT
GGTAGGCGTCCTTTTCATTATATATTAAATATATTGATTTAACTGTACGTTTTTTCCATGTTCTGCTTAATTATTGAACATTATTTATTTATTTTTTTATATTTTATTTTCAGGATGAAG
ATGCATTCTTTAATGACTATGCATTATCACACAAGAAACTCTCTGAATTAGGATTTACACCAAGCTCTAAAACAGTAATTAAGGACGGAGTCGTATTGGCGCAAAGCGCTGTTGGTGTTT
TGGTTACTGCTGCTGTGGTGATTCTGAGCTACCTCTATGAAGCCCGCAAAAAGACCAAGTGA

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCGATGCCTATTGTAGACACCGAATACCTTAAACAGATTGATAAAGCTCGTCGGGAGCTTCGTGCTTTTATCGCCAACAAGAATTGCGCACCAATCATGCTTCGATTAGCGTGGCAT
GATGCTGGAACATACGATGTGAATACGAAAACCGGAGGTCCCAACGGTTCGATTAGAACAGAGGAGGAGTATAGTCATGGCTCTAACAATGGATTGAAGATTGCTATCGATTTTTGCGAG
GAAATAAAGTCCAAACATCCAAGGATTACTTATGCAGATCTATATCAGCTTGCGGGAGTTGTTGCTGTGGAGGTTACTGGTGGCCCTACTGTTGACTTTGTTCCTGGTAGACAGGACTCA
ACGGTCTCTCCCAAGGAAGGCAGACTCCCAAATGCTACCAAAGGTGCACCACACTTGCGGGACATATTTTACCGCATGGGTTTATCTGACAAGGATATTGTAGCCCTATCTGGAGGACAC
ACCCTTGGAAGAGCACATCCTGAAAGATCGGGCTTCGAAGGCCCTTGGACTAGGGAGCCACTGAAATTCGATAACTCATACTTCATTGAACTTCTGAAAGGCGAATCAGAGGGGCTACTA
AAACTTCCTACAGACATCGCATTGCTGGATGATCCTGCGTTCCGTCCTTACGTTGACCTGTACGCCAAGGATGAAGATGCATTCTTTAATGACTATGCATTATCACACAAGAAACTCTCT
GAATTAGGATTTACACCAAGCTCTAAAACAGTAATTAAGGACGGAGTCGTATTGGCGCAAAGCGCTGTTGGTGTTTTGGTTACTGCTGCTGTGGTGATTCTGAGCTACCTCTATGAAGCC
CGCAAAAAGACCAAGTGA

Retrieve as FASTA  
cDNA►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
CTGTGGAGAT GAAGGTCAAA CACACAAACC AATGAACTCG ACCACAGAAG ATCACTTCTT CTGTTTTTAG CCTATCCATC TATAATATCT TCAGTGGTGT GTGTGCTCTT CCCAAGACTC  CACAGACACT CGCACTTTCA CCTTCACTGT GTGCATAATC AATGGCGATG CCTATTGTAG ACACCGAATA CCTTAAACAG ATTGATAAAG CTCGTCGGGA GCTTCGTGCT TTTATCGCCA  ACAAGAATTG CGCACCAATC ATGCTTCGAT TAGCGTGGCA TGATGCTGGA ACATACGATG TGAATACGAA AACCGGAGGT CCCAACGGTT CGATTAGAAC AGAGGAGGAG TATAGTCATG  GCTCTAACAA TGGATTGAAG ATTGCTATCG ATTTTTGCGA GGAAATAAAG TCCAAACATC CAAGGATTAC TTATGCAGAT CTATATCAGC TTGCGGGAGT TGTTGCTGTG GAGGTTACTG  GTGGCCCTAC TGTTGACTTT GTTCCTGGTA GACAGGACTC AACGGTCTCT CCCAAGGAAG GCAGACTCCC AAATGCTACC AAAGGTGCAC CACACTTGCG GGACATATTT TACCGCATGG  GTTTATCTGA CAAGGATATT GTAGCCCTAT CTGGAGGACA CACCCTTGGA AGAGCACATC CTGAAAGATC GGGCTTCGAA GGCCCTTGGA CTAGGGAGCC ACTGAAATTC GATAACTCAT  ACTTCATTGA ACTTCTGAAA GGCGAATCAG AGGGGCTACT AAAACTTCCT ACAGACATCG CATTGCTGGA TGATCCTGCG TTCCGTCCTT ACGTTGACCT GTACGCCAAG GATGAAGATG  CATTCTTTAA TGACTATGCA TTATCACACA AGAAACTCTC TGAATTAGGA TTTACACCAA GCTCTAAAAC AGTAATTAAG GACGGAGTCG TATTGGCGCA AAGCGCTGTT GGTGTTTTGG  TTACTGCTGC TGTGGTGATT CTGAGCTACC TCTATGAAGC CCGCAAAAAG ACCAAGTGAT TAAAATGTCA AACATGAAAC AAGGTACAAC TTTCTATGCA GGGGATACAG GTTACTGTGC  TATTATTGTT ATGTTCTAAA CTCCAGACAA CTTGACTTTG GGTTTGATTA GTTAATGGAC TCATACACAA TATACTAATG TGTACGTACT TAAATTCCTT TGTGTTGGGT TTATTAATAT 
AACCTAGTTT TAAATCTGGC AAAAAAAA 

Retrieve as FASTA