Entry information : PcCcP (PhaneroCcP)
| Entry ID | 2821 |
|---|---|
| Creation | 2006-02-23 (Marcel Zamocky) |
| Last sequence changes | 2011-12-14 (Christophe Dunand) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Not yet reviewed |
| Last annotation changes | 2012-03-28 (Catherine Mathe (Scipio)) |
Peroxidase information: PcCcP (PhaneroCcP)
| Name (synonym) | PcCcP (PhaneroCcP) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Cytochrome C peroxidase [Orthogroup: CcP001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Fungi Basidiomycota Agaricomycetes Corticiaceae Phanerochaete | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Phanerochaete chrysosporium [TaxId: 5306 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | Mitochondria |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tissue type | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Inducer | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repressor | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Best BLASTp hits |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '2821' 'join(489414..489722,489779..489833,489889..489970,490026..490613,490672..490807)' |
Exons►
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Literature and cross-references PcCcP (PhaneroCcP)
| Literature | Martinez,D.,Larrondo,L.F., Putnam,N., Sollewijn Gelpke,M.D.,Huang,K., REFERENCE 1 Chapman,J.,Helfenbein,K.G., Ramaiya,P., Detter,J.C.,
Larimer,F.,Coutinho,P.M., Henrissat,B., Berka,R., Cullen,D. and Rokhsar,D. Genome sequence of the lignocellulose degrading fungus Phanerochaete chrysosporium strain RP78. Nat. Biotechnol. 22 (6), 695-700 (2004) REFERENCE 2 Zamocky M. Divergent evolutionary lines of cytochrome c peroxidases (2006 in preparation) |
|---|---|
| DNA ref. | JGI genome: scaffold_6 (489414..490807) |
| Cluster/Prediction ref. | JGI gene: 123914 |
Protein sequence: PcCcP (PhaneroCcP)
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
|
||||||||||||
| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
|
||||||||||||
| Remarks | Complete sequence from genomic (6 introns). No EST. Strain="RP-78". | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
|
||||||||||||
| CDS► Send to BLAST |
|
||||||||||||
