Entry information : AtRboh06 (At1g64060 / AtRbohF / RBOHF / RBOHAP108)
Entry ID | 3289 |
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Creation | 2006-06-17 (Christophe Dunand) |
Last sequence changes | 2015-06-02 (Christophe Dunand) |
Sequence status | complete |
Reviewer | Achraf Jemmat |
Last annotation changes | 2015-11-12 (Achraf Jemmat) |
Peroxidase information: AtRboh06 (At1g64060 / AtRbohF / RBOHF / RBOHAP108)
Name (synonym) | AtRboh06 (At1g64060 / AtRbohF / RBOHF / RBOHAP108) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Class | Respiratory burst oxidase homolog [Orthogroup: Rboh002] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Taxonomy | Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Arabidopsis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism | Arabidopsis thaliana [TaxId: 3702 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular localisation | Plasma membrane |
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Tissue type | Roots |
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Inducer | N/D |
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Repressor | N/D |
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Best BLASTp hits |
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Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '3289' 'join(23770266..23770929,23771017..23771176,23771500..23771548,23772043..23772156,23772717..23773139,23774049..23774435,23774517..23774612,23774710..23774825,23774897..23775064,23775139..23775298,23775387..23775566,23775666..23775794,23775920..23775998,23776208..23776317)' |
Exons►
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Literature and cross-references AtRboh06 (At1g64060 / AtRbohF / RBOHF / RBOHAP108)
DNA ref. | Phytozome 12: Chr1 (23770266..23776317) |
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mRNA ref. | GenBank: NM_105079 |
Cluster/Prediction ref. | Phytozome Gene 12: 19652508 UniGene: At.235 |
Omic ref. | AtProteome: At1g64060 ATTED-II: At1g64060 e-FP Browser: At1g64060 ePlant: At1g64060 Genevestigator: At1g64060 TAIR: At1g64060 |
Protein sequence: AtRboh06 (At1g64060 / AtRbohF / RBOHF / RBOHAP108)
Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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Remarks | Complete sequence from genomic (13 introns) and 13 ESTs. | ||||||||||||
Promoter► Send to BLAST Send to cis Analysis |
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Terminator +► Send to BLAST Send to cis Analysis |
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DNA ► Send to BLAST |
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CDS► Send to BLAST |
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cDNA► Send to BLAST |
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