Entry information : HsPGHS01 (PGHS-1 / COX-1)
| Entry ID | 3320 |
|---|---|
| Creation | 2006-07-19 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2010-10-18 (Myriam Duval (Scipio)) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Filippo Passardi |
| Last annotation changes | 2010-12-03 (Myriam Duval (Scipio)) |
Peroxidase information: HsPGHS01 (PGHS-1 / COX-1)
| Name (synonym) | HsPGHS01 (PGHS-1 / COX-1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | H synthase [Orthogroup: PGHS001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Metazoa Chordata Mammalia Hominidae Homo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Homo sapiens (human) [TaxId: 9606 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | Apoplastic |
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| Tissue type | N/D |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '3320' 'join(125133364..125133370,125133465..125133551,125140178..125140294,125140712..125140852,125141054..125141197,125143650..125143831,125143943..125144026,125145788..125146034,125148725..125149011,125152477..125152624,125154468..125154823)' |
Exons►
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Literature and cross-references HsPGHS01 (PGHS-1 / COX-1)
| Literature | Funk C.D., Funk L.B., Kennedy M.E., Pong A.S., Fitzgerald G.A. Human platelet/erythroleukemia cell prostaglandin G/H synthase: cDNA cloning, expression, and gene chromosomal assignment. FASEB J. 5:2304-2312(1991). |
|---|---|
| Protein ref. | UniProtKB: P23219 |
| DNA ref. | GenBank: NC_000009.1 (125133364..125154823) |
| mRNA ref. | GenBank: NM_000962.2 |
| Cluster/Prediction ref. | UniGene: Hs.201978 |
Protein sequence: HsPGHS01 (PGHS-1 / COX-1)
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic (chromo 9, 10 introns) and 220 ESTs. Various splicing variants, need to be enter in the base | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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