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Entry information : MtPrx10 (Medtr2g029800.1[4.0] / Medtr2g029800.2[3.5])
Entry ID 337
Creation 2005-09-13 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2010-09-14 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Catherine Mathe
Last annotation changes 2016-05-20 (Catherine Mathe)
Peroxidase information: MtPrx10 (Medtr2g029800.1[4.0] / Medtr2g029800.2[3.5])
Name (synonym) MtPrx10 (Medtr2g029800.1[4.0] / Medtr2g029800.2[3.5])
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx048]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Fabaceae Medicago
Organism Medicago truncatula (barrel medic)    [TaxId: 3880 ]
Cellular localisation N/D
Tissue types Root tips
Roots
Inducers Glucose treatment
Sinorhizobium inoculation
Repressor Glomus intraradices infection
Best BLASTp hits
Perox score E-value MtPrx10
start..stop		 S start..stop
PsPrx29 624 0 1..353 1..350
MtPrx11 618 0 1..353 1..355
MsPrx02 617 0 1..353 1..355
PsPrx09 592 0 19..353 17..353
Gene structure Fichier Exons►
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 11135619..11135840 220 N° 2 11136950..11137141 190 N° 3 11137230..11137395 164 N° 4 11137491..11137972 480
join(11135619..11135840,11136950..11137141,11137230..11137395,11137491..11137972 )


exon

Literature and cross-references MtPrx10 (Medtr2g029800.1[4.0] / Medtr2g029800.2[3.5])
Literature Journet,E.P. et al., unpublished, Torres-Jerez,I. et al., unpublished.
DNA ref. Phytozome 12:   chr2 (11135619..11137972)
Cluster/Prediction ref. Phytozome Gene 12:   31062558
Omic ref. Gene atlas:   Mtr.10370.1.S1_at Legoo:   Mtr.10370.1.S1_at
Protein sequence: MtPrx10 (Medtr2g029800.1[4.0] / Medtr2g029800.2[3.5])
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   353 (326)
PWM (Da):   %s   37919.18 (35223.8) Transmb domain:   %s   i7-25o
PI (pH):   %s   7.64 (7.99) Peptide Signal:   %s   cut: 28 range:28-353
Sequence
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Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MNSFGLTLTALCCVVVVLGGLPFSSDAQLDPSFYRDTCPKVHSII
REVIRNVSKTDPRMLASLVRLHFHDCFVLGCDASVLLNKTDTIVSEQEAFPNINSLRGLDVVNQIKTAVEKACPNTVSCADILALSAQISSILADGPNWKVPLGRRDGLTANQSLANQNLPAPFNSLDQLKSAFAAQGLSTTDLVALSG
AHTFGRARCTFITDRLYNFSSTGKPDPTLNTTYLQELRKICPNGGPPNNLANFDPTTPDKFDKNYYSNLQGKKGLLQSDQELFSTSGADTISIVNKFSADKNAFFDSFEAAMIKMGNIGV
LTGKKGEIRKHCNFVNSKSVELGLVNVASTDSSGMVSSI

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from 85 ESTs and genomic (chromo 2, 3 introns).
DNA ►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGAACTCCTTTGGTCTCACGTTGACTGCTCTATGCTGTGTAGTGGTTGTTCTTGGAGGGTTACCCTTCTCCTCAGATGCACAACTTGATCCTTCCTTCTATAGGGACACTTGTCCAAAG
GTTCATTCCATTATTCGTGAAGTCATAAGGAACGTCTCTAAGACTGATCCTCGCATGCTTGCTAGTCTCGTCAGACTTCACTTTCATGACTGTTTTGTTCTGTGGTATATACTCTCTCCA
TATTCATTCTTTCCCATGTCTTTTGTGTCTACTCATACTCATGTATGTAGAACTAGCACCGACATGTCAAACTAAACATGTTTTGATATTCGTCACTAATACTAAACATTTATACATATA
ATTATTTATAATATTTAAGTTTTTCAAATTGTTACTAATATAAACGTGTAGTGTTAGGTCTGATGTCCATGTTAATATTTGTGTTGGATATTTTACTCGTGTAGAATCACTCATAGTTCT
TTACTTGAATTGCTTCTATTTGATATATCTAATATTGTTAGTTTTAGTTTTATATTGAATTTAACTTAATCTAAAATATTGATTTGGGCTAAAGGTTATAAGAGTAAGAGATTTGAAATT
TAAATTCAGACAAAAGAGAAAAAAAATGATATTCATCTAACTACTATTATAATTATTGTCCATTTCGTTGAGCTTGGTAACACAAACTTGTGACTTTAGTTGGGGTATAAAAGGCACGGA
TCCTCTTCTGTGAGGAATTAATTGGAGGACATCCAGTGCTAAATCTTACCGTTCATTTTTTTAAAACAATTTAAATTGAATAATTTAAACAAAAAGTGAGTGGAGGAGATTCCATTGGAT
GACACTTTTACGGGAGACAATCCCCACCCGGGTAATAAGATGTTGAAAGAGGTCTTTTGACGTGTGCCAAAATAAAATATTGTCCATTTCGGGAAAAAATTCTACAAAATACGTTTAGAG
TTTGTTCTATTGGTCACGTATATTGTCCAAAATAAAATATTGTCCATTTTGGAAAAAAACGCTATACCAAATACAAGATACATGACCAATAGAACAACAATGATACAAAAGTACAATCCA
AAGTCACACTTGCACTTCCACAACATGTTTGCATAATGGATCCACTTTTACACTCAACCGTTGAAATTGGAGAGTTACCTAAAGGGGTAAATATGATTTACTCATGGTCACTACTACAGT
GGATACATGTCATTATGACATCATTTTGGTTTCTTTTCCATATTATTTTGAAGTTCTAACAACAATTTTTTTATTACTAGTAAATAAATTTTGATTTTTAATATTTGTATTATGTTGTCT
ATGATTGTAACAGGGTTGTGATGCATCAGTTTTATTGAACAAAACTGATACCATTGTGAGTGAACAAGAAGCTTTCCCAAATATCAACTCTCTACGAGGTTTGGATGTTGTGAATCAAAT
CAAAACAGCAGTGGAAAAGGCTTGTCCTAACACAGTTTCTTGTGCTGATATTCTTGCCCTTTCTGCACAAATTTCCTCAATTTTGTGGTATGCCTCATCCTAACATGATTAATAACAACT
ATCATTTTAATTATTAGTGATGATTAATTAAATTAATACATGTATGTATTGACAGGCAGATGGTCCTAATTGGAAGGTTCCCTTAGGAAGAAGGGATGGTTTAACCGCCAACCAATCGCT
CGCTAATCAAAATCTTCCGGCTCCATTCAATTCGTTGGATCAACTTAAATCTGCATTTGCTGCTCAAGGCCTCAGTACTACTGATCTAGTTGCTCTCTCAGAGGTATGCAATGTTTTCTA
ATTAAAAGTGCTCGAATCACTTCGTTATCATGTATATAATAACAAATTATAAGGCTAATATATATGCTTCAAATGTAGGTGCTCATACATTCGGAAGAGCACGTTGCACTTTCATCACTG
ATCGATTATACAACTTCAGCAGTACAGGAAAACCTGATCCAACTCTTAATACAACTTATTTACAAGAATTACGTAAAATATGTCCTAATGGTGGACCACCAAATAACCTCGCCAATTTTG
ACCCAACGACTCCTGATAAATTTGACAAGAACTACTACTCCAATCTTCAGGGTAAAAAGGGTTTGCTTCAGAGTGACCAAGAGCTTTTCTCGACATCTGGTGCTGATACCATTAGCATTG
TCAACAAGTTCAGTGCTGACAAAAATGCTTTCTTTGATAGCTTTGAAGCCGCCATGATTAAAATGGGTAATATTGGTGTGCTGACCGGGAAAAAAGGAGAGATTAGAAAACATTGCAATT
TTGTTAATTCAAAATCAGTTGAACTTGGTCTAGTGAATGTGGCTTCCACAGATTCATCGGGTATGGTTAGCTCAATTTAA

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGAACTCCTTTGGTCTCACGTTGACTGCTCTATGCTGTGTAGTGGTTGTTCTTGGAGGGTTACCCTTCTCCTCAGATGCACAACTTGATCCTTCCTTCTATAGGGACACTTGTCCAAAG
GTTCATTCCATTATTCGTGAAGTCATAAGGAACGTCTCTAAGACTGATCCTCGCATGCTTGCTAGTCTCGTCAGACTTCACTTTCATGACTGTTTTGTTCTGGGTTGTGATGCATCAGTT
TTATTGAACAAAACTGATACCATTGTGAGTGAACAAGAAGCTTTCCCAAATATCAACTCTCTACGAGGTTTGGATGTTGTGAATCAAATCAAAACAGCAGTGGAAAAGGCTTGTCCTAAC
ACAGTTTCTTGTGCTGATATTCTTGCCCTTTCTGCACAAATTTCCTCAATTTTGGCAGATGGTCCTAATTGGAAGGTTCCCTTAGGAAGAAGGGATGGTTTAACCGCCAACCAATCGCTC
GCTAATCAAAATCTTCCGGCTCCATTCAATTCGTTGGATCAACTTAAATCTGCATTTGCTGCTCAAGGCCTCAGTACTACTGATCTAGTTGCTCTCTCAGGTGCTCATACATTCGGAAGA
GCACGTTGCACTTTCATCACTGATCGATTATACAACTTCAGCAGTACAGGAAAACCTGATCCAACTCTTAATACAACTTATTTACAAGAATTACGTAAAATATGTCCTAATGGTGGACCA
CCAAATAACCTCGCCAATTTTGACCCAACGACTCCTGATAAATTTGACAAGAACTACTACTCCAATCTTCAGGGTAAAAAGGGTTTGCTTCAGAGTGACCAAGAGCTTTTCTCGACATCT
GGTGCTGATACCATTAGCATTGTCAACAAGTTCAGTGCTGACAAAAATGCTTTCTTTGATAGCTTTGAAGCCGCCATGATTAAAATGGGTAATATTGGTGTGCTGACCGGGAAAAAAGGA
GAGATTAGAAAACATTGCAATTTTGTTAATTCAAAATCAGTTGAACTTGGTCTAGTGAATGTGGCTTCCACAGATTCATCGGGTATGGTTAGCTCAATTTAA

Retrieve as FASTA  
cDNA►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
GGATACTCAT AACAACAAAA TGAACTCCTT TGGTCTCACG TTGACTGCTC TATGCTGTGT AGTGGTTGTT CTTGGAGGGT TACCCTTCTC CTCAGATGCA CAACTTGATC CTTCCTTCTA  TAGGGACACT TGTCCAAAGG TTCATTCCAT TATTCGTGAA GTCATAAGGA ACGTCTCTAA GACTGATCCT CGCATGCTTG CTAGTCTCGT CAGACTTCAC TTTCATGACT GTTTTGTTCT  GGGTTGTGAT GCATCAGTTT TATTGAACAA AACTGATACC ATTGTGAGTG AACAAGAAGC TTTCCCAAAT ATCAACTCTC TACGAGGTTT GGATGTTGTG AATCAAATCA AAACAGCAGT  GGAAAAGGCT TGTCCTAACA CAGTTTCTTG TGCTGATATT CTTGCCCTTT CTGCACAAAT TTCCTCAATT TTGGCAGATG GTCCTAATTG GAAGGTTCCC TTAGGAAGAA GGGATGGTTT  AACCGCCAAC CAATCGCTCG CTAATCAAAA TCTTCCGGCT CCATTCAATT CGTTGGATCA ACTTAAATCT GCATTTGCTG CTCAAGGCCT CAGTACTACT GATCTAGTTG CTCTCTCAGG  TGCTCATACA TTCGGAAGAG CACGTTGCAC TTTCATCACT GATCGATTAT ACAACTTCAG CAGTACAGGA AAACCTGATC CAACTCTTAA TACAACTTAT TTACAAGAAT TACGTAAAAT  ATGTCCTAAT GGTGGACCAC CAAATAACCT CGCCAATTTT GACCCAACGA CTCCTGATAA ATTTGACAAG AACTACTACT CCAATCTTCA GGGTAAAAAG GGTTTGCTTC AGAGTGACCA  AGAGCTTTTC TCGACATCTG GTGCTGATAC CATTAGCATT GTCAACAAGT TCAGTGCTGA CAAAAATGCT TTCTTTGATA GCTTTGAAGC CGCCATGATT AAAATGGGTA ATATTGGTGT  GCTGACCGGG AAAAAAGGAG AGATTAGAAA ACATTGCAAT TTTGTTAATT CAAAATCAGT TGAACTTGGT CTAGTGAATG TGGCTTCCAC AGATTCATCG GGTATGGTTA GCTCAATTTA  AGTACTTTAG GGTCACTAGT TTCAAATGTA GTGATTGGAG ACCATAAATA AAGATGTTAT GACTAGGCAC ATTTGTGACT TGTGTCACAT AGTTACTAGG TGCTTTGTGA GGGAAGACTT 
TTTGTATTTG AAGTATTTCT TTGGGTTGTG TTCATAATCA AATTTTCTCT ATCTTATTTT GGACTTGTTT TGGCG 

Retrieve as FASTA