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Entry information : MtPrx15 (Medtr2g029850.1 [4.0] / Medtr2g029850.1[3.5])
Entry ID 342
Creation 2005-09-13 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2010-09-16 (Haythem Mhadhbi)
Sequence status complete
Reviewer Catherine Mathe
Last annotation changes 2016-05-25 (Catherine Mathe)
Peroxidase information: MtPrx15 (Medtr2g029850.1 [4.0] / Medtr2g029850.1[3.5])
Name (synonym) MtPrx15 (Medtr2g029850.1 [4.0] / Medtr2g029850.1[3.5])
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx048]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Fabaceae Medicago
Organism Medicago truncatula (barrel medic)    [TaxId: 3880 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value MtPrx15
start..stop		 S start..stop
MsPrx15 689 0 3..352 4..353
GmPrx260 561 0 19..351 15..348
LjPrx09 556 0 6..351 4..349
GmPrx69 556 0 19..351 14..346
Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '342' 'join(11170841..11171062,11171174..11171365,11172358..11172523,11172672..11173150)' Exons►
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 11170841..11171062 220 N° 2 11171174..11171365 190 N° 3 11172358..11172523 164 N° 4 11172672..11173150 477
join(11170841..11171062,11171174..11171365,11172358..11172523,11172672..11173150 )


exon

Literature and cross-references MtPrx15 (Medtr2g029850.1 [4.0] / Medtr2g029850.1[3.5])
Literature Torrez-Jerez,I. et al., unpublished.
DNA ref. Phytozome 12:   chr2 (11170841..11173150)
Cluster/Prediction ref. Phytozome Gene 12:   31065145
Omic ref. Gene atlas:   Mtr.40130.1.S1_at Legoo:   Mtr.40130.1.S1_at
Protein sequence: MtPrx15 (Medtr2g029850.1 [4.0] / Medtr2g029850.1[3.5])
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   352 (325)
PWM (Da):   %s   37769.93 (35062.6) Transmb domain:   %s   o5-27i
PI (pH):   %s   6.11 (6.12) Peptide Signal:   %s   cut: 28 range:28-352
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MNSFNLSLAALCCVVVVLGGLPFSSNAQLDNSFYRDTCPNVHSIV
REVLRNVSKTDPRILASLIRLHFHDCFVQGCDASILLNTTSTITSEQTAFGNNNSIRGLDVVNQIKTAVENACPNTVSCADILALAAEISSVLANGPDWKVPLGRRDSLTANLTLANINLPSPAFNLTQLKSNFDNQGLDATDLVALSG
AHTIGRGQCRFFVDRLYNFSNTGNPDPTLNTTYLQTLRTICPNGGPGSTLTDLDPATPDTFDSAYYSNLRIQKGLFQSDQVLSSTSGADTIAIVNSFNNNQTLFFEAFKASMIKMSRIKV
LTGSQGEIRKQCNFVNGNSGLATKVTRESSEDGIVSSY

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from 160 ESTs and genomic (chromo 2, 3 introns).
DNA ►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGAACTCTTTCAATCTCTCTTTGGCAGCTTTGTGCTGTGTAGTAGTTGTGCTTGGAGGGTTACCCTTCTCATCAAATGCACAACTTGATAATTCCTTCTATAGGGACACTTGTCCTAAT
GTTCATTCCATTGTTCGTGAAGTACTAAGAAATGTTTCTAAGACAGATCCTCGTATACTTGCTAGTTTGATAAGGCTTCACTTCCATGATTGCTTTGTTCAAAAGTAAGTATTATTCATC
ATTTTTAAAACTCGGTATCTGATCAAGGACCGACTGATCCGTAAAACATTTTTGGTATTTGTAGCTCATATATTTTATATCTATGTTTATGAAAGGGTTGTGATGCATCAATCTTGTTGA
ATACCACTTCTACGATCACAAGTGAGCAAACAGCTTTTGGAAATAACAACTCAATAAGAGGTTTAGATGTTGTGAATCAAATCAAAACAGCAGTGGAAAATGCTTGTCCTAACACTGTTT
CTTGTGCTGATATTCTTGCTCTTGCTGCTGAAATTTCCTCTGTTCTGTGGTATGTTCCATATCTTCTTTGTTCCATTTCCATTTTTTCTAGTTCTAGTTTGCAAAAACAACAACACTGTA
ATAAAAAAGCAGTCAAAGATGAGTTGAGAATCCTTGCCATAAAAAAAAGTTATGTTGGAAGAACTATTTTCTTCTTTGTTTTTAACATGAAAGTGACATAAAAAAAGGAAAAAAAAAAGT
ATTAAAGTGTCATACTACAAACACAAAATTATTTGTCGGTTTTTCCTCACGGAAAATTATTTGTACAATTTAATTGTTATTCTTTCGATCTCATAATGAGTTTCTTAGATTTTTTATTGT
TTATTTTCAAACACCTAGGAACAAACTTCTTAATCCATTTCATAATGAGATGTTTTAAAAAAAATAAAAAATTGTTTTAAAATAATACCACTTTACATTTTTGATATAATTTTTTTTCCA
ACTTTACCATTAATAAATACTTCAATTTTTCTCTTTCTCACTATTTCCAATGTAACTTTAAGTTTGTCTTTTTCGCATAAAGTTAGGATAATTTAGTAAAAGTGTTATGTCTATTGATTA
TTTTATTCAATTTCTTAATTTGTGCGTCAAAACCTTAAATGACACTCGTTGTAAAACTGAGTGAGTATATAAAAGAAAATGAATAAAATTATACTAAATTATGTTAGTAAGCATTGGTGC
AAATTTTTTCTTACAAGGTTGACATTTTTTTTTTCATTAAATATTTTCTTTGTGAAGAATTTTTAACATGTGTCTTAAGGGCACATGGACTTAACATGACCCTTATCATAAATGCAAATA
AAAAATAATACTAATAATTTATAAGCAATACATAATTAGAGGGTATAATTAAAAAATAATAATAATTTAATTTACAATAAGAATTAAAAATAACATTCATTTTAGGTTAGTTGTTTACAA
ATGTAAACTTTATTTTATCTTTCCTTTCTTTTACTCTTTATTTAGCTCAATCCTCATTTATTCTAGTAACATAATTTGCAGGCTAATGGTCCTGATTGGAAAGTGCCATTAGGAAGAAGA
GATAGTTTAACAGCAAATCTAACCCTTGCTAATATAAATCTTCCAAGTCCAGCTTTCAACCTTACTCAACTGAAATCTAACTTTGATAATCAAGGTCTCGACGCTACAGATCTAGTTGCA
CTTTCAGAGGTATAGAAATGTTTCCTAAATTAGAGAAATTATTATTAATACACCATTTTACAAATGAGATTTGAACTCGGTTCGTTAAGGGTGATATACCTCATGATGTATGTATATGTG
TGTATCTAATTGTATATATGTTTTGGTAAATTTTTAGGTGCTCATACAATCGGTAGAGGTCAATGCAGATTCTTCGTTGATCGATTATACAATTTCAGCAATACTGGAAATCCCGATCCA
ACTCTCAACACAACCTACTTACAAACATTGAGAACTATATGTCCCAATGGTGGACCTGGTAGCACCCTAACCGATCTGGACCCAGCCACTCCAGATACATTCGACTCGGCCTACTACTCA
AACCTAAGGATTCAAAAAGGCTTGTTTCAGAGTGACCAAGTATTGTCTTCCACAAGTGGCGCGGACACGATTGCCATTGTCAACAGTTTCAACAACAACCAAACTCTTTTCTTTGAAGCT
TTTAAGGCCTCGATGATTAAAATGAGTAGAATTAAAGTGTTAACTGGATCTCAAGGTGAAATTAGAAAACAATGTAACTTTGTTAATGGAAATTCTGGCCTTGCCACAAAAGTCACAAGA
GAGTCGTCAGAGGATGGTATTGTTAGCTCATACTAA

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGAACTCTTTCAATCTCTCTTTGGCAGCTTTGTGCTGTGTAGTAGTTGTGCTTGGAGGGTTACCCTTCTCATCAAATGCACAACTTGATAATTCCTTCTATAGGGACACTTGTCCTAAT
GTTCATTCCATTGTTCGTGAAGTACTAAGAAATGTTTCTAAGACAGATCCTCGTATACTTGCTAGTTTGATAAGGCTTCACTTCCATGATTGCTTTGTTCAAGGTTGTGATGCATCAATC
TTGTTGAATACCACTTCTACGATCACAAGTGAGCAAACAGCTTTTGGAAATAACAACTCAATAAGAGGTTTAGATGTTGTGAATCAAATCAAAACAGCAGTGGAAAATGCTTGTCCTAAC
ACTGTTTCTTGTGCTGATATTCTTGCTCTTGCTGCTGAAATTTCCTCTGTTCTGGCTAATGGTCCTGATTGGAAAGTGCCATTAGGAAGAAGAGATAGTTTAACAGCAAATCTAACCCTT
GCTAATATAAATCTTCCAAGTCCAGCTTTCAACCTTACTCAACTGAAATCTAACTTTGATAATCAAGGTCTCGACGCTACAGATCTAGTTGCACTTTCAGGTGCTCATACAATCGGTAGA
GGTCAATGCAGATTCTTCGTTGATCGATTATACAATTTCAGCAATACTGGAAATCCCGATCCAACTCTCAACACAACCTACTTACAAACATTGAGAACTATATGTCCCAATGGTGGACCT
GGTAGCACCCTAACCGATCTGGACCCAGCCACTCCAGATACATTCGACTCGGCCTACTACTCAAACCTAAGGATTCAAAAAGGCTTGTTTCAGAGTGACCAAGTATTGTCTTCCACAAGT
GGCGCGGACACGATTGCCATTGTCAACAGTTTCAACAACAACCAAACTCTTTTCTTTGAAGCTTTTAAGGCCTCGATGATTAAAATGAGTAGAATTAAAGTGTTAACTGGATCTCAAGGT
GAAATTAGAAAACAATGTAACTTTGTTAATGGAAATTCTGGCCTTGCCACAAAAGTCACAAGAGAGTCGTCAGAGGATGGTATTGTTAGCTCATACTAA

Retrieve as FASTA  
cDNA►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
GGACACTTAA GTCTAAGCTC AAAACAAGAG AAAAATAATG AACTCTTTCA ATCTCTCTTT GGCAGCTTTG TGCTGTGTAG TAGTTGTGCT TGGAGGGTTA CCCTTCTCAT CAAATGCACA  ACTTGATAAT TCCTTCTATA GGGACACTTG TCCTAATGTT CATTCCATTG TTCGTGAAGT ACTAAGAAAT GTTTCTAAGA CAGATCCTCG TATACTTGCT AGTTTGATAA GGCTTCACTT  CCATGATTGC TTTGTTCAAG GTTGTGATGC ATCAATCTTG TTGAATACCA CTTCTACGAT CACAAGTGAG CAAACAGCTT TTGGAAATAA CAACTCAATA AGAGGTTTAG ATGTTGTGAA  TCAAATCAAA ACAGCAGTGG AAAATGCTTG TCCTAACACT GTTTCTTGTG CTGATATTCT TGCTCTTGCT GCTGAAATTT CCTCTGTTCT GGCTAATGGT CCTGATTGGA AAGTGCCATT  AGGAAGAAGA GATAGTTTAA CAGCAAATCT AACCCTTGCT AATATAAATC TTCCAAGTCC AGCTTTCAAC CTTACTCAAC TGAAATCTAA CTTTGATAAT CAAGGTCTCG ACGCTACAGA  TCTAGTTGCA CTTTCAGGTG CTCATACAAT CGGTAGAGGT CAATGCAGAT TCTTCGTTGA TCGATTATAC AATTTCAGCA ATACTGGAAA TCCCGATCCA ACTCTCAACA CAACCTACTT  ACAAACATTG AGAACTATAT GTCCCAATGG TGGACCTGGT AGCACCCTAA CCGATCTGGA CCCAGCCACT CCAGATACAT TCGACTCGGC CTACTACTCA AACCTAAGGA TTCAAAAAGG  CTTGTTTCAG AGTGACCAAG TATTGTCTTC CACAAGTGGC GCGGACACGA TTGCCATTGT CAACAGTTTC AACAACAACC AAACTCTTTT CTTTGAAGCT TTTAAGGCCT CGATGATTAA  AATGAGTAGA ATTAAAGTGT TAACTGGATC TCAAGGTGAA ATTAGAAAAC AATGTAACTT TGTTAATGGA AATTCTGGCC TTGCCACAAA AGTCACAAGA GAGTCGTCAG AGGATGGTAT  TGTTAGCTCA TACTAAGTAA TTTAATACAA GTTGCATAAG AAAGGTACCT AATAAAGAGT GTGTTCTAGA GGCACATACA TGTTGTGCTC TTGTGGTGGA TGGCGATAGG TTTCTACTTT  GTAAACTATG GCCATTGATG TAGTGTTTGT ATTAACTATT TTCCTCTATT ATGATAATTA TGTTTCTTAT ATTATTGATA ATGATGATGA GATATGGTAG GGATATTGAA GTATTTAGGC 
TT 

Retrieve as FASTA