Entry information : HsGPx06
Entry ID 3605
Creation 2006-08-23 (Marcia Pinheiro Margis)
Last sequence changes 2016-06-28 (Harold Duruflé)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2016-06-28 (Harold Duruflé)
Peroxidase information: HsGPx06
Name HsGPx06
Class Animal glutathione peroxidase    [Orthogroup: Gpx1006]
Taxonomy Eukaryota Metazoa Chordata Mammalia Hominidae Homo
Organism Homo sapiens (human)    [TaxId: 9606 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Testis
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HsGPx06
start..stop
S start..stop
PtroGPx06 441 2.28e-160 1..221 1..221
MmulGPx06 430 3.85e-156 1..221 1..221
BtGPx06 380 1.58e-136 1..220 1..220
RnoGPx06 347 2.53e-123 1..221 1..221
Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '3605' 'join(1..87,4840..4993,9315..9432,9942..10041,11246..11452)' Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 1..87 85 N° 2 4840..4993 152 N° 3 9315..9432 116 N° 4 9942..10041 98
N° 5 11246..11452 205  
join(1..87,4840..4993,9315..9432,9942..10041,11246..11452)


exon

Literature and cross-references HsGPx06
Literature Kryukov G.V., Castellano S., Novoselov S.V., Lobanov A.V., Zehtab O., Guigo R., Gladyshev V.N.Characterization of mammalian selenoproteomes. Science 300:1439-1443(2003).
Protein ref. UniProtKB:   P59796
DNA ref. GenBank:   NC_000006.11 (28483520..28472072)
mRNA ref. GenBank:   AY324826
Cluster/Prediction ref. Genebank:   257202 UniGene:   Hs.448570
Protein sequence: HsGPx06
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   221 (202)
PWM (Da):   %s   24667.48 (22490.4)  
PI (pH):   %s   6.5 (6.51) Peptide Signal:   %s   cut: 20 range:20-221
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MFQQFQASCLVLFFLVGFAQQTLKPQNRKVDCNKGVTGTIYEYGALTLNGEEYIQFKQFAGKHVLFVNVAAYUGLAAQYPELNALQEELKNFGVIVLAFPCNQFGKQEPGTNSEILLGLK
YVCPGSGFVPSFQLFEKGDVNGEKEQKVFTFLKNSCPPTSDLLGSSSQLFWEPMKVHDIRWNFEKFLVGPDGVPVMHWFHQAPVSTVKSDILEYLKQFNTH

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo 6, introns 4), 3 cDNA and 1 EST.
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GAAGGGCTAG CGACTGACAG AAATAACTAC CCTGTCTCCC ACCTGCAGGA ATGTCTAACA AAGCATCCAT CTTCCTCCTT CTTTGCTCCA CACTCGTGCC TACCCAGCCT CCTGATGACC  AAACCATCCT GTACTACCCA AGCACCTGCT TAGCATGTGT GTGTAGCTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTATGGATAT GTAGAATTGT ATTTGTTGGT ATATGCATAG GTGTATGTAT  GGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTT TGAAGATTAA GGAAAAGAAC ACCTATCTCT CCAACTCTCT GATCCTGAAA TATCTATTCC AAAGGAAAAT CATATTTTAG GGTAGATGAA  TCAGACTATC CTGTGTCCCT AAAAAAGCAA TCCCGAGAAG TTGTGACATC TATCCCTTCC CCTTCCTGAA AGTTTTAAAG AAAGCAGGAG CTGGCCGCAA GACTCTAGGC CTCCTTCATA  GCCTCTCTCC TCTAAGATAG GCATGCATTG TTAAACTCTT TTCTCCTTAA TTCTCCTTTA TTCCCCTGCC ACCCAGTAGT TCTCATGTAG GACCTCTGAA GGCAGAGTGA GAGCAGAAAC  CCCACCTCAC ATGAAGGGAA GGGCATCTCC ATGATGGTGG ATCCCAAAAC CCCTCTGGGT CGCACCCTGC CAGAGCCTTC CTTGGTGCCT GTCCCTTAGT GCATTCAGGT CATGGCACCT  GGGCAGGGGT GTCCCTGTAT TCTGAATGAT GGGCTTTCTC CTCACCCTGA GCCTCCTCAA CTTTAAGCTT ATTTTGATCA CTGTCTCAAA TTTAAAAATT CTGCAGCAAC CTGGCTCTGT  GTGGTGTTTT CCCAGTCCCA TATTATGTCC AGTCATACTT CTTCTTTCTC TGTCACTTTG TCCCTGCTTT CTTGATTCCC TTGTCTTGTT CTTCAGTATT TTGTTTTTCT CAAAAATGCT  CTAGAACTTT CCTTGGCACA TATAAAAGCA CGGCTGGAAC TGGTTGCTCA GAGCTGCTGT GACCGTGAGC ACAGATCTCT TCGTGTCAGG TCCCTCTGCA CCCTCCCGTT CAGGTCTCTT  GACCAGGCCC CTACATGACA GGAATCCTTG CCTCTCAAAG AATCCTCTCT CTCTCTCTAC AACAAATATG CATATGTTTG TTTTTTTTTT TAAGTATTTA TTGATCATTC TTGGGTGTTT  CTCAGAGAGG GGGATTTGGC AGGGTCATAG GACAATAGTG GAGGGAAGGT CAGCAGACAA ACATGTGAAC AAAGGTCTCT GGTTTTCCTA GGCAGAGGGC CCTGCTGCCT TCTGCACTGT  TTTTGTCGCT GGGTAGTTGA GATTAGGGAG TGGTGATGAC TCTTAACCAG TATGCTGCCT TCAAGCATCT GTTTAACAAA GCACATCGTG CACCGCCCTT AATCCATTTA ACCCTTAGTG  GACACAGCAC ATGTTTCAGA GAGCACAGGG TTGGGGGTAA GGTTATAGAT TAACAGCATC CCAAGGCAGA AGAATTTTTC CTAGTACAGA ACAAAATGGA GTCTCCTATG TCTACTTCTG  TCTACACAGA CACAATAACA ATCTGATCTC TCTTTCTTTT CCCCACATTT CCCCCTTTTC TATTCGACAA AACCGCCATT GTCATCATGG CCCGTTCTCA ATGAGCTGTT GGGTACACCT  CCCAGACGGC GTGGCGGCCG AGCAGAGGGG CTCCTCACTT CCCAGACAGG GCTGCCGGGC AGAGGGGCCC CCCCACCTCC CAGACGGGGC GGCGGCCGGG CAGAGGGGCT CCCCACTTCC  CAGACCGGGC AGCTGGGCAG AGGCGCCCCC CACCTCCCGG ACTGGGCGGC TGGCCGGGCA GAGGCTGCCC CCCACCTCCC GGACGGGGCG GCTGCCGGGC GGAGACACTC CTCACTTCCC 
AGACGGGGCG GCTGCCGGGC GGAGGGGCTC CCCACTTCCC AGACCAGGCG GCTGCTGGGC GGAGGGGGTC CTCACTTCTC 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AGAATGTGGG AACACCAAAA CCTATGAAGT TGGGGTTTTA GGCCATTTGA CCTACTGATG AGGTCCATAA TGAAATGTCT CCTTACCTCT CAAGGGCTCA TTACTACAAG GTGAGCAAAT  GTAAATTGTC CCAGATAGTA AAGATTTCAT CACAGTAATT ATGATCCAAA TGGAACCAGA GCAAGAGCTC TGGAGTAGGA CGCAGAAGTT GCCTTCATTT CACTGTTACC CACCTTGTGA  CTTTTTATAT GTTATCTCTC TCTCTGAGCT TCAGTTTTCT CATACATGAA ACTATGTGAA TACAGTTCTA GTTGTTTACC ATTGTCAGGC CATGTGGTAA GTGCTTTATA GTTATTATCA  CATTTAATTG TTACAGCAGC CCTACAAGGT AGATAATATT ATTATTCTGA TTTCACAGAT GAGAAAACTG GGGACAGACA CATTAACTTT GATTTCAGAT TCAAGGAGCT AGTCAGTGGC  ACTGACAGGT ATTGAATTCA ATGGTCTTTA TAGCCTCGTA GTCAAAGTTT CAGCCATTTT TTTGAGCTAA AAGCAGGAGA AGGGTAAAGA ACTTGGGAAT GTGTGTAGGT CTGTTCCATA  AGAGGCAAGC ATCTGACCTG CTGCCTTAAG GAGCTGCATA GCTGGATCAG GTATCAGTGA TCAGGACATA GATTATAGGC TTTTGAAAAG AGTTCAGAAA TCTGAGATAA CTAAAAGCTT  GTCTTTCAAG AGAGTTCATA AGAACTCAAC CCCACCCAGA CTTTAGTTTC AAGAGGCAGA GAATGCCTTT TGTGTGAAGC TGGCAGAGGC AACGCAGGTG GAGCAGGCTC GATGGTGAGG  GGTTTACAAC TGAAGAGGAA GGGGGTGTGT GTAGGGAGTG GAGGTGGGTG TGTATGAATG CCACTCTGCG ATTGGAGGGT GCTTCTTCAA ATTGGTCCCT GCCAGGGGCT CAAAAGGGGC 
TGAAATCCTG GGGACCTCAG AGTCGTCTAA AACTCCTAGC C 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGTTCCAGCAGTTCCAGGCCTCCTGTCTTGTCCTGTTTTTCCTGGTTGGCTTTGCTCAGCAGACCCTAAAGCCTCAAAATAGGAAGAGGTGAGCATGGGGCAGGGGATCCGAGCTGATT
CCAGCACGTGATGACCAACCTGGCTGCCAGAGTTGCAAGGAGTTCTCTACTCTCCCCTTTCGAAGGACAAGATCTGCATTCCCAGCCCTTCTTCACAAATCCTGACATTGCTATCCTTAG
CAGGCTCTCCCTAAATCCACTGTCTCTTACTTGCATCTTTTCCTCTGCACCTAGTAGCTCTTTGAACTGAATGTATGTGGAGTGGGGTTGGGGGGCTGCCTCAGCACATTCCCCTTTGCC
ACTTCCCCCTGGTGGCCCCTTGATAGCCTAGAGCCTGTCCCCTTCATGCTGGTCCATAACTTGGAGTAGCGCTGTGGATCCCAACAAATGAGGCATGAAGTCGCAAATGGATTGACAGGG
AGGCTGCCCTGGTTACTCCTGGAGAGGCTGCTCAGCCAGAAACCCAGAGGGAGAGGTGAGAGAATCTGGGCTTGCGATCTGCACTAGGAGTTTCTAGGTCACAGAAAGAGGAGCTCCCCA
CCACCACACCCCTAGAAAAATAAAATGCATAAGGCCAATATGGTTGTCCACTAATATTAATTTTAGGGAAGGTCATGAGGTGAGGTAGAGACAAAGCTCAGCTCAGAGTAGGCTTTGTTC
TCAGATCTTGGTGTTGCTCCCAAATCTCCTGATGCCATTTAGAAAAGTCCCCCCACTGGATGTCCATAGTCACCCCTGTGAAAGATGTGTATATATGTCTTAGGATGCGGACTGAGCAGA
TCACCTGAGGCACCCGCAAATTTTAACTTTAAAATCAGATGAATTTATTCAAAAGCAGCCTCAGTGGTGGCCATATGCCAATTATATATCTTTTGTTAGTTCCTTTCTGTCCTCTATAAA
AGGTGGCGTACAATGCCTATCATATAATGCAGTGATTCCCAGACTTGAGCTTACCTAAGAGATAGCTGGTTAAAGCACAATTGCTGGGCCCCACCCAAGACTTTCTGATTCAGTAAGTTT
TAGGGGGAGCCCAGGAATTTGCATTTCTAAAATGCTTCCGGTTGATACTCATGCAGGTCTCCACACCTGAAGCTTTGAGCTTTAATCTCTGTTACTGGATTCATATGAAGTGTAAGATGG
TGCCTATTACAAGCCATAAGACAGCTTACTTACTTACTTTCCAGAAAGGTAACAGATCACTTGAACGGACAACCTCCAAGGGTCATCAGATCTATGTCAGCCACTGCTGCCTGGTTGGGT
GTGGAATTCTCGATGTAAAATAGCATCTTGTGAATTAAAAGCTGTGTTCTAGGGTATTCTGTCTTCTTCAAACAGATGTAAGCAAACTAGAGCAGAACTGAAAACTGGGTAGGAAGGATT
GAGCTCTTCGAGTCTGCAGTTTTCGTGGGATTCTGCATCTCATTTCACAGAGTGACATCCTCATGAGAACCAAATCTTTGGAAGTTGTTGCACCCAGAGCTAAGGTAGCACAAAGGCAAG
AAAATGGAGGCATACAAATGACAGCTCACATGGTGATTTCCGTGTGACTTTTTATTATAGTAGCAAGAAAGACAAATGCTGGAAATTATTTAGCTCAGACGTAAGGTGTCATGAAGGCAA
AACGAATGCAGGCATATAGATGATAACTCCATCATAGTGGGTTTCTTAGGCTAATGTTCCCAAATATTGTGACTAATGTATATGCACAGATGTGTACAGAAATATGGACTTGAAAGGGCT
TGCCCCTTGGTCAAGCCTCCTTCTCTCCAAGGATAATGAAGGAGAAGCTGTGGCCTTGTGTCGTGGTAACAGACTCAGAAGATGATAAAGAGTTTCTTGCCCCACTCTGCCCACAGTAGC
TCACCCACAGGCAATTCCTTCCCTGCATGGGGTATGCTTTTATGGACTGAGATCCTGTGAAGCCCAGTTTAAATTACTCTAAAATTCTATGATTTTTCTTCATATGGCCAGGACTTATAG
CCTCTCTTACCACATAACATGTTAGCCTTTTGTTCCAGGTTCTGTATGCCTTTTATTCTTGGCATGCTTGTGGGTAGAAAAGTTTTTCCGCTCTGTGCTATTTTATGAACTTTAATTCAT
GAGCAGTTCAGGCTGTTTCACCACAATATAAAGAAGTGGGTGCCAAGGATGAGTTTTCAAGGTACCAGCGAAACCGGAAAAGTTCCCTTGTCCCTCTCACAAGGCATGCGACGGGGCGTG
TGGCTCGCTGCTTCAGTTCCCCGCCGCTCAAACCTGTACGGGAGCAGAGGGGGAGCATACAAACTAGCAGATTGTGGAGCTCCAACCTTAAGGCAGTGTCTAGGAGTGAATGTTTACAAC
TGAAGCCCCAGTGGGCGTGTGTTACAGGGTGCTCTTAGTTCAGCCACCCATAGGCAGCTTGTGTTAGCTCCATTAGACCCCTGCCTTATCACAAAGACAGAGGACTTTCTGTATCCCAGG
GATCTTGCCTTGGTTTACGAGAAGAATCGGATCACACGTGGGCATGGAGAATAAGTGCAAGGTTTTATTAAGTGGAAGTAGCTCTCATCAGATGGGGGAGCCAAAAGAGAGATGGTTTTT
CCCTGGAGCCCGGCCAAACTCCATGTCCTTCCGCTGTCAATGGCCTTCCAGTGTGCTCCTACTGTGTTCAAAATTGGTGGGTTTTTGGCCTCACTGACTTCAAGAATGAAACCCAGTTCT
TTAAGGCAGCGTGTCCAGAATTTGTTCCTTCTGATGTTCGGATGTGTTCAGAGTTTGTTCCTTCTGGCGGGTTTGTGGTCTTGCTGGCTCAAGAGTGAAGCTGCAGAGGCTCAAGAGTGA
AGCTGCAAAGCCTCGCGGTCAGTGTTACAGCTCTTAAGGCAGCGCGTCTGGAGTTGTTCATTCCTCCCGGTGGGTTCGTGGTCTCGCTGGCTTCAGGAGTGAAGCTGTAGACCTTCACGG
TGAGTGTTACAGCTTGTAAAGGCAGTGTGGACCCCAAGAATGAGCAGCAGCAAGACTTATTGCAAAGAGCGAAAGAACAAAGCTCCCACAGTGTGGAAGGGGACCCACGGGGGCTGCCAC
TGCTGGCTCCGGCAGCCGCCTTTTATTCTTATCTGGCCACACCCACATCCTGCTGATTGGTCCATTTTACAGAGAGCCGAGTGGTCTGTTTTGACAGGGTGCGGATTGGTGCCTTTACAA
TCCCTGAGCTAGACACAAAAGTGCTCCACTTCCCCACTAGATTAGCTAGATACAGAGTGTCCACACAAAGGTTCTCCATGTCCCCACCAGAGCAGCTAGATACAGAGTGTCAACTGGTGC
ATTCACAAACCCTGAGCTAGACACAGGGTGCTGATTGGTGTGTTTACAAACCTTGAGCTAGATACAGAGTGCCGATTGGTGTATTTACAATCCCTTAGCTAGACATAAAGGTTCTCCCAG
TCCCCACCAGACTCAGGAGCCCAGCTGGCTTCAGCCAGTGGATGCCGCACCACGGCCGCAGGCCGAGCTGCCTGCCAGTCCCGCGCCCTGCGCCCGCACTCCTCAGCCCTTGGGTGGCCG
ATGGGACTGGGCGGCGTGGAGCAGGGGGCGGTGCTCGTCGGGGAGGCTCGGGCCGCGCAGGAGCCCACGGAGCGGGAGGAGGCTCAGGCATGGCGGGCTGCAGGTCCCAAGCCCTGCCCC
GCGGGGTGGCAGCTAAGGCCCAGCGAGAAGTCGAGCACAGCAGCTGCTGGCCTTGGTGCTAAGCTCCTCAGTGCCCGGGGCCGGCTGGCCGCTCCGAGTGCGGGGCCCGCTGAGCCCACT
CCCACGTGGAATTCGCGCTGGCCCGCAAGTGCCACGCGCAGCCCTGGTTCCCTCCAGCGCCTCTCCCTCCACAACTCCTCGGAAGCTGAGGGGGCCGGCTCCGGCCTTGGCCAGCCCAGA
AGGGGGCTCCCACAGTGCAGCCGCGGGCTGAAGGGCCTCTTAAGCGCGACCAGAGTGGGCGCCAAGGCCGAGGAGGCGCGGAGAGCGAGCAAAGGCTGTGAGGGCTGCTAGCATGTTGTC
ACCTCTCACCACGATGGTGCATTGCTCTCCACGTCCAGCCAGTTGAGTGTGTTCCTCCGCTGATGTGCTTCTCTCCACATCCAGCGCCAGTGCCTCTGGCTGCTAGGGTCTCAGAGTTTT
TATAGGCACAGACCCATTTGAGTGAGAAGGCAGGAGTGCCTGTCCTCATGTAGGTCCGTAGGCACAGGCCCGAGGGTGGAGCCCTAGTTAGGTACCCGCCTTTCTCTACCCAGCACTTCC
CGGCCGCCCCTCCCCCATCACCAGTGATTACCCCATTGGCAAGCCTGGAAAGGCCCTTCAGTGGCATCTGGAGAAGTTATGGGCCTGATTTTGGGGGACAGGAATTACAATATAAGAACA
TGTAGATGAGAAGTTTGTGCAAAACTTACTTATGAGAAATCCTGCAAAATCTGTTAAGAGTATCTGAGAGAGGACGGCATGACTTGAACGGAGTGTTAGGATGTCGGGGGAGAATGCAGT
GTCAGGGAACAGAGGTAAATGTTATTAATCTTCTGGAAACGGGAAGAATATTATGAAATGCTTGTCTTGCCACACACACAAAAAAATGGCTTGTAATTTAGAAGACATAAATTCTAGCTA
TGGCATCAGCTCTAACTAAAAATTTTACTTGGAAAGATCCCTTCAGTTCTTAGAATTTCAAGATATTACATGAAGGGTCTTCGAGTGTTTTGAAAAAGTCCACAAATGTTGGGAATTATT
TTTTATCTTATATCGTTATGGTTATTTTTGTAAAATTCCAGGTGGATTGCAACAAAGGGGTAACAGGCACCATCTATGAGTATGGAGCCCTCACCCTCAACGGCGAGGAGTACATCCAAT
TCAAGCAGTTTGCAGGCAAGCACGTCCTGTTTGTCAATGTGGCCGCCTATTGAGGCTTGGCAGCTCAGTATCCTG
TGGTAAGAACTCACGTTTCAACTCTTTTGGAAGCAGCATTGCCAG
ATAGCCATATTCTAATTCCAGAAGGTTTTACCAATGTGTTATTGGAGGATGCGATGGGAGAACTGATCAGGTGACTCTACCTCCCTAAATGCTGCTCCTGCTCTGCTCCTTAGAATATCA
GGATAATTATTTCCAGATTTGAGAACTAAGACCTTCCCAAAGACTTAAAGACCACCAGGAGCACACTTGCAGTTGAACAAGTTGAATGTGTTACTCGGTACCCTGAAGGAGAACATGTTC
TATAGAGAACCATGGGGTTTCTTAATAAGAAAGTATTAGAAAGGACTTACTATAGAATCTGAACTTTTGTTACGTGATTTGGAGACGAGTTCAAGGAATTGAAGTTCTGTTCTGGATTGG
ATGCCATCAAGAACTGTGAGCAATTATATGATTTGGTGTCTTAATCAATCATATCTACATGGGGAGAGAAACGAAGACTAAAGCTGTAACTGGTAAAGAAGCAGCAGTCACTCATATTGG
CAAGAATAGGGTGGTACCTGGTCATTGTTGCGATTTGGACAATGTTCGTGCTTTGTCTATGTTCAGTTACAATTATGCAGTGGCCTTGTTTTTGCCTTGATTCATCATGATCACATGTTA
TGTGATATTGTTTGTATGAAACTGTTCTATGAAGTTGTTTATGTTTCCTAGCAGAGTGCTAAAGCCTAGCTGTGACTCCCAGGCCAGATACCTGGCTTTCAAGGACTGATTTTATGCTTC
TCATCGGTTACTTCTGATAAAAACAGGAGAGATGAGTGATCTTTGATATTCTGGAAAATGCCCTTGGGTTCTGTAGGCACCTGCAAATGACCAAGAGGGAAATGAAGTTTTCTGTCTGGG
CAGCCTTTGATTGGTACAAGGGCTGTGTAGTGTGACTGGCAATGTAGAAGAATGCTCCATCTCGCCAACCTTGGCCTAACCTTCTGTGGTAGCTGAGGTGTGTTTCCATTTTCTTTGTGC
CCTTATTGGAGAAGAGTTTTGCATTACTGTTGGTCCAGAAAAGGTTATTTAAAATTTTAGATCAATTATACTAGAGATAGATACAGCTTTGGACGGGCCAAGAACTTTATTTTATGCTTT
TAAAAAATGGCTCAAGATAAATTTAAAAGATTTATTGCACCAAATGCCACAGAGAAGTGGATCAAAATAATACATGAACAAATTTTGTTTTGTTTTGAGACAGTCTCGCTCTGTCGCCCA
GGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTAGGTTCAAGTGATTCTTGTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGTGATTACAGGCATGCACCACTATATCTAGC
TAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCATTTTTAGCAGAGGCAGTGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAATGATCCACAAGTCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGG
GATTACAGGCATGAGCCACCGCACCTGGTCTATACAAAAACAAGTTTTAAGAAAAATTTTCCACACATTGACACTATTATCTGTTCAGCTGATCAAAAATATATAAACCCTATCAATTTT
TCTTAATGGATTTTCAGTAATAAAAATCCCAGAATTTTAGCCCTTTTAAGTAACACTTAAAGTCAAGCATATTGTAATCTCATGTCTAAAAGATCTGGCTCACCAAATTTTGACATTTTA
AAATTAACATTCAGAGGATGCTACATGATTTAAGCCAAAATTCTAATAAAATTCCGGCTCCTCCAAAGTACAAATGGCTCACATTTACCAAGAGTAGCTGAATACTTTTCCAATTTAATG
GTAAAATTATGCATAAAAAGATGCTCTCAAAAGTACAGATTAGGATAAGAATCACACATTTAAAATAATTTGGGGGTCCCTTTGTTATTACTATTATTTTTGAGACAGGGTCTTGCTCTG
TCGCCCAGGCTGGAGTGCAGGGGCACAATCTTGGCTCACTGTAACCTCTGCCTCTGGGATTCAAGCTATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCAAATAGCTGGGACTACAGGTGCATATCACCTC
GCCCAGCTAATTTTTTTTTTTTTTAATAGAGACTGGGTTTCACTATGTTGGTCAGGCTGCTCTCGAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCAACTGCTTCAATCTCCCAAAGTGCTGGGATTAT
AGGCATGAGCCACCACACCCGGCCTCAATTTTTTTATTTTTATGTACACTCAAGTCTAGGGAAAACCTGAAAAGCTACAGACTAAATTTTTATTATAAGAGCCCAAACAACAATTTAGTA
TCATTTAGTAAGTGAGAAAGTTAAAAGAACTTGCCAAAGGAATAGAATCAAGTTCTGCCAATTGTGTCTACTATAGGACCTCAGGACCTAGGTATTAGAGCCCAAACGACAGTTTTGTAT
CATTTAGCAGGCAAGAATTCTCCTCCCTTCAAAAAGTTAAATTTGAAAAATATGGTAAATTTTAAAAGTTGTGATGTGTAAACGCAGTTCCATGGAATGTGAAGCTGCTCTTAAATTTGT
TTTAATTTAATTTAATTTTAACTTAAATTTGCTACATATTGAATAGGCAATATACTTCCAACATTCAAAATTCAAGAGATATAAAAAGGTTTAACAGTGGCACTTGCCATGTTCCCTTCT
CTTTAGGCAACCATTATTATCAGTTTATGGTGTATATTTCCAGAAATCTGTTATGCATATACAAGCAAACATTTCTCTCTCACTTTCTTTCTCTCAAGCACATACACATACACAAACATA
CACACAGAAATGATTATGCACATTGCTTTTTCACATATATCACATACAGTGGGGACAGGAGTGGTGGCTCACACCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGACCAAGGTAATCCCAGCACTTTG
GGAGACCAAGGTGGCCGGATCACTCTTGAACATCAGGAGTTTCAGACCAGCCTTGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTGTACTAAAATTACAAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCACATGC
CTGTAATCCCAACTACTCAGGAGGCTAAAGCATGAGAATCTCTTGAACCTGGGAGGCGGAGATTGCAGTGAGCTGAAATCCTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGAGACTCTGT
CTAAAAACAAAACAAAAAAACATGGTGAGCTTCCTCATTCATTTTAAGGCATAGTATTCCATTGTGTTGCTGTGATATAATTTATTAAATTAGTTCATGAGAATTTTAAAGAGCACCTCA
TTCAAATTTTACTCCAGATGAGAAAATTGAGAGAATTAAAGAAACTTGCCAAAGGAATAGAATCAAGGTCTGTTAAGTGTGTCTGCTATAGAAAGGAAATATTCTTGATGGCCAAAGATA
AGAGAGAGATGAGTTTCGATAGCAACCGAAGAACTATAGAAAAACAGGAAGGCACTCTCTATTTAAGAGGAGGTTCTTAGGGGACATTCCAGCAGGCAGAGCTGAATCTGAATGACAATG
GCCAGTACAAGTTCTGAGGTCTGAATAAATCTTACCTGAAAATAGCTGAAGATGGAAATTATGATTCAAGTCTAAACAGACAAGCTGGAAGGTTCCTGACAGTAGTAAAGAGCAATTTGG
AGTTTATGGCCTGGCGTCCCAGGGAGTGTTCCAGGGCATGTTGCAGCATCAGTTAGGTCACTGGAATTGAGGAGAGGGTACAGAATACTGTAGAGGATAGCCTTGGAATTTCTCTTTCTC
TACCACTCCCAGGGTGGAGCACCAAGGAGTACTCCTGGGAATGGGACTGGAACTGGAGTGTCTGGTTGTGTCACCATGGGACATTGTATGAGTGGGGCCGGGGGGATGCAGGGATAGGTG
GGTAGGATTTCCATTTTGTTTGCTTTTTCCTTACAATTTTTTTTGATCAATTCATCAACTAAGGAAGACAGTGGCATTCAAATCTGACTTCTCTTTAGAGTCAAACAGGACTCCCACACA
AGGCTACCAACGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTAAAAAAAAAAATAAGAGTTCTCATTGGATGGTAAAGTGTAGCCAGGCATGGGAGCTACTGTATAAGAAAAACAGCAG
CCATTCAGATGCATTTCTGGAAACGTGTGCTCTAGTCTTTTTTTTTTTTCTCTACTCCTTTGATCTCTGTAACCTTGAATCTTTCCCTTCTTAGTCCTCGGTTTATTCATGTGATAAATG
GATACATTCAGTGATCTTTCACTGCTTGAGGTAGGCCTCCTGACCAGCCCACCCCTGCTATTCATTGTCCACTTACAGAACTGAATGCACTACAGGAGGAGCTGAAGAATTTTGGTGTCA
TTGTGTTGGCCTTTCCCTGCAACCAGTTTGGAAAACAAGAACCAGGAACAAACTCAGAAATACTTCTTGGTCTCAA
AAGTGAGTGCTTGCATGGGACCCTGCAGATGCCCTGTCGGGATT
TCCATTCCTCATTCCACCTAGATGCCTGCCTATTCTGGAAACTTCTGGGATAGGCCATAGATACATGGGTTGAAGCATATCCTTATGATGTTTTGAATTCAATCTATTCTATTCACAGTG
CTCAAATATTCTCTTTACTTTTGAATTATTTGATGGTGAGGCTAAGGGAAGATTGAATGGAAAAGAAGCATAGAGAAAAGAAGGGAGTATAAGAAATAAGAAATGGAAGTGAAGCAGGAA
ACCTAAGCTCAAAATATTGCCTTCCAATTTTCTTAGAATTCTCTATTGGCGCCATAAAGCCTATTGCATAAAATCCTGCTTCCCACAGACTATCTTTTCTTATCTTCCCTGTGCACAGCC
TCTTCCCTTTATCTTGAATTTCCTGTGGTAGTGAATTGGTGGTGGCCATTATTTTCCATCCATGTCTTAATTTGTATCTTGCTGGGAACAACTTTGGTTCACTGCAGGTATGTGTGTCCA
GGTAGTGGCTTTGTCCCCAGTTTCCAGCTCTTTGAGAAAGGGGATGTGAATGGAGAAAAAGAACAGAAGGTCTTTACTTTCCTGAAG
AGGTGCATGAGTATAAACCTGGCATGGATGGGT
TAGCTAGAAATGCTCTGAAAGCAGTGGGGCTCATGTCTAGGGTTGTGGTTGGACTCCTTGGAAAAGAGATGCTCAGATAAGTTCAAGGCTCATGGCAATATCTGCTGTGATGCTTTAGCT
TTAAGTAGAGGAAACCCATGATGGACAATAGCTCTGACATGGACTACCCTCCTGTATTGAATGGAATGATTCATTCATTCAGCAATCATTTATCAGATCTCCAGTATGTGCTATATGAGT
TAACAAACATTAATAGCGCATAGTCTGTTCCCTGAAGGAACTCACATTTAATCAGGAGACAGACATGGATGATACAGAATACCATGTGGTAAATGCTTTTAGAGTCACAGAGTGGTAAAA
ATACAGAATACCAGGATAGAAGGACCCCCGAGGGTCTCTTTGTCTACTCAGCCCGAAATGCTGGTCTGCAGAACAATGCTGGTCCTGCTGAAATTTTCACTCATCCACAGCAAACAAGGG
AAAAAAGACAATGCAGAATTTTTCATAAAGCTCAACTTATTGAATATAAGACCAACATTTATTCTGACATTAAATTACTATTACGTTTACCCATATAAATTGCCCTTTACTTACTCAAAA
ATGGTGCTATAATCAATTTTATGTGGTACAACTGAGTATTTAAAAATCCCTTAATTTTTAAATGTGTGCTTACAGTAGACTTTTAATTTTTCTTATTGGCAAAATGAGTATTAGTGATTC
TACGTTAATATCCAAGGAAATAGTTATTGAAATTTTACTGGCTTATGAAGCCTATGAAGCCCCAAACTCTGCGAGCCACTACTCTAAATCAATCTCTTTTTTTTTCTGCTAAGGAAACGA
ACTGTAGAAATGATATGACTTGCCCAAGGAAACAGAAAATAGTCTTTTACTGAATCATCGTGATAAAACCATGGAAATAGAGGAAAGACAGGGAAAGGAGGAATGCTTTCTATTTACCAT
TATACTCTCTAACTCTCGGTTATTTGGTAGTTGGTGTATTGGTATTGATACATTGCAGTGTCTGTGGTTGATTGGAAGCATGCAAAGTAGTTAATATATTAAAATACATAATGGTGAGTA
GACTCTCTAGTCTGGAGATAAAACTGTACCACACAGAAGTAGAAATAAAGTAGAAATAAATGTATATCTCTACTTTCTATATCTCTGCTCCAGAACTCCTGCCCTCCGACCTCTGATCTT
TTGGGCTCATCAAGCCAACTCTTCTGGGAGCCCATGAAGGTCCATGATATCCGCTGGAACTTTGAGAAATTTCTGGTGGGGCCCGATGGAGTCCCTGTCATGCATTGGTTCCACCAGGCT
CCAGTCAGCACAGTCAAGTCAGACATCCTGGAGTACCTAAAGCAGTTCAATACCCACTAG

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGTTCCAGCAGTTCCAGGCCTCCTGTCTTGTCCTGTTTTTCCTGGTTGGCTTTGCTCAGCAGACCCTAAAGCCTCAAAATAGGAAGGTGGATTGCAACAAAGGGGTAACAGGCACCATC
TATGAGTATGGAGCCCTCACCCTCAACGGCGAGGAGTACATCCAATTCAAGCAGTTTGCAGGCAAGCACGTCCTGTTTGTCAATGTGGCCGCCTATTGAGGCTTGGCAGCTCAGTATCCT
G
AACTGAATGCACTACAGGAGGAGCTGAAGAATTTTGGTGTCATTGTGTTGGCCTTTCCCTGCAACCAGTTTGGAAAACAAGAACCAGGAACAAACTCAGAAATACTTCTTGGTCTCAAG
TATGTGTGTCCAGGTAGTGGCTTTGTCCCCAGTTTCCAGCTCTTTGAGAAAGGGGATGTGAATGGAGAAAAAGAACAGAAGGTCTTTACTTTCCTGAAG
AACTCCTGCCCTCCGACCTCT
GATCTTTTGGGCTCATCAAGCCAACTCTTCTGGGAGCCCATGAAGGTCCATGATATCCGCTGGAACTTTGAGAAATTTCTGGTGGGGCCCGATGGAGTCCCTGTCATGCATTGGTTCCAC
CAGGCTCCAGTCAGCACAGTCAAGTCAGACATCCTGGAGTACCTAAAGCAGTTCAATACCCACTAG

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