Entry information : PpaKat01
| Entry ID | 393 |
|---|---|
| Creation | 2008-11-26 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2008-11-26 (Christophe Dunand) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Not yet reviewed |
| Last annotation changes | 2011-01-25 (Toky Ramarohetra (Scipio)) |
Peroxidase information: PpaKat01
| Name | PpaKat01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Catalase [Orthogroup: Kat001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Funariaceae Physcomitrella | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Physcomitrella patens [TaxId: 3218 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
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| Tissue types | Chloronemata Gametophore Protonema |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '393' 'complement(join(2107860..2108013,2108164..2108231,2108410..2108499,2108675..2108938,2109295..2109564,2109697..2109879,2110114..2110451,2110576..2110672,2111624..2111638))' |
Exons►
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Literature and cross-references PpaKat01
| Literature | Rensing S.A., et al., The physcomitrella genome reveals evolutionary insights into the conquest of land by plants. Science 319:64-69(2008). |
|---|---|
| Protein ref. | UniProtKB: A9RDR1 |
| DNA ref. | Phytozome 12: scaffold_3 (2111638..2107860) |
| Cluster/Prediction ref. | UniGene: Ppa.3891 |
Protein sequence: PpaKat01
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic (8 introns) and 113 ESTs. | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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