Entry information : GgaPOX01 (EPO-like)
| Entry ID | 4039 |
|---|---|
| Creation | 2007-01-02 (Filippo Passardi) |
| Last sequence changes | 2011-02-01 (Christophe Dunand) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Not yet reviewed |
| Last annotation changes | 2011-02-01 (Christophe Dunand) |
Peroxidase information: GgaPOX01 (EPO-like)
| Name (synonym) | GgaPOX01 (EPO-like) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Class | Non mammalian vertebrate peroxidase [Orthogroup: POX001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Metazoa Chordata Aves Phasianidae Gallus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Gallus gallus [TaxId: 9031 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
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| Tissue types | Head Ovaries Testis |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '4039' 'join(1..7,831..908,1626..1719,2260..2435,4363..4486,5541..5670,6623..6739,6826..7141,7843..8003,8176..8428,9622..9792,10928..11165,11619..11841) ' |
Exons►
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Literature and cross-references GgaPOX01 (EPO-like)
| Literature | Zamocky, M. et al. (2007) Phylogenetic relationship in the peroxidase-cyclooxygenase superfamily (in preparation). This record is predicted by automated computational analysis. |
|---|---|
| DNA ref. | GenBank: NW_001471508.1 (390716..402839) |
| mRNA ref. | GenBank: XM_415715.2 |
| Cluster/Prediction ref. | UniGene: Gga.32214 |
Protein sequence: GgaPOX01 (EPO-like)
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic (chromo 19), 1 mRNA and ESTs. Annotated as "similar to myeloperoxidase" BUT important sequence & structural deviation from myeloperoxidase (Marcel). Positions: 234-782 heme peroxidase domain | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
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