Entry information : PnoHalPrx11
| Entry ID | 4235 |
|---|---|
| Creation | 2007-01-29 (Filippo Passardi) |
| Last sequence changes | 2007-01-29 (Filippo Passardi) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Christophe Dunand |
| Last annotation changes | 2013-09-04 (Catherine Mathe (Scipio)) |
Peroxidase information: PnoHalPrx11
| Name | PnoHalPrx11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Haloperoxidase (haem) [Orthogroup: HalPrx002] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Fungi Ascomycota Dothideomycetes Phaeosphaeriaceae Phaeosphaeria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Phaeosphaeria nodorum (Stagonospora nodorum) [TaxId: 13684 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tissue type | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Inducer | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repressor | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Best BLASTp hits |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '4235' 'join(20059..20277,20324..21247)' |
Exons►
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Literature and cross-references PnoHalPrx11
| Literature | Birren, B. et al.
Annotation of the Phaeosphaeria nodorum SN15 genome unpublished |
|---|---|
| DNA sequence | http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=62361750&itemID=5&view=gbwithparts |
| Protein ref. | GenPept: 111063033 UniProtKB: Q0UK37 |
| DNA ref. | JGI genome: scaffold_12 (20059..21247) |
Protein sequence: PnoHalPrx11
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
|
||||||||||||
| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
|
||||||||||||
| Remarks | Complete sequence Genomic. Strain="SN15". 2 exons. | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
|
||||||||||||
| CDS► Send to BLAST |
|
||||||||||||
