Entry information : VvAPx06 (GSVIVT01008846001)
| Entry ID | 5172 |
|---|---|
| Creation | 2009-02-27 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2012-01-05 (Christophe Dunand) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Not yet reviewed |
| Last annotation changes | 2011-11-28 (Qiang Li) |
Peroxidase information: VvAPx06 (GSVIVT01008846001)
| Name (synonym) | VvAPx06 (GSVIVT01008846001) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Ascorbate peroxidase [Orthogroup: APx2002] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Vitaceae Vitis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Vitis vinifera (Grape) [TaxId: 29760 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | Thylakoid-bound |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tissue types | Berries Buds Cell culture Inflorescences Leaves Pedicel Roots |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Inducer | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repressor | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Best BLASTp hits |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '5172' 'join(2761329..2761493,2761583..2761741,2767075..2767195,2767265..2767365,2767458..2767545,2768405..2768472,2768561..2768647,2769814..2769888,2770003..2770080,2770182..2770286,2771673..2771747,2772038..2772190)' |
Exons►
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Literature and cross-references VvAPx06 (GSVIVT01008846001)
| Literature | REFERENCE 1 Reid,K.E., Liao,N., Peng,F., Schlosser,J., Kirkpatrick,R., Shukin ,R., Barber,S., Holt,R., Siddiqui,A., Jones,S., Marra,M., Bowen,P., Bohlmann,J., Martinez Zapater,J.M. and Lund,S.T. Expressed sequence tags from grapevine (Vitis vinifera cv. Cabernet Sauvignon)
REFERENCE 2 Velasco,R., et al.,. The first genome sequence of an elite grapevine cultivar (Pinot noir Vitis vinifera L.): coping with a highly heterozygous genome. |
|---|---|
| DNA ref. | Phytozome 12: chr18 (2761329..2772190) |
| Cluster/Prediction ref. | UniGene: Vvi.8798 |
Protein sequence: VvAPx06 (GSVIVT01008846001)
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
|
||||||||||||
| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
|
||||||||||||
| Remarks | Complete sequence from genomic (chromo 18, 11 introns, incorrect prediction with FGENESH) and 63 ESTs. Cultivar="Pinot Noir", "Chardonnay", "Cabernet Sauvignon", "PN40024" and "Thompson-seedless". | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
|
||||||||||||
| CDS► Send to BLAST |
|
||||||||||||
