Entry information : CnKat03_H99 (CAT3)
Entry ID | 5222 |
---|---|
Creation | 2007-04-16 (Marcel Zamocky) |
Last sequence changes | 2012-05-23 (Marcel Zamocky) |
Sequence status | complete |
Reviewer | Christophe Dunand |
Last annotation changes | 2012-05-23 (Christophe Dunand) |
Peroxidase information: CnKat03_H99 (CAT3)
Name (synonym) | CnKat03_H99 (CAT3) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Class | Catalase [Orthogroup: Kat001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Taxonomy | Eukaryota Fungi Basidiomycota Tremellomycetes Tremellaceae Filobasidiella | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism | Cryptococcus neoformans (Filobasidiella neoformans) [TaxId: 5207 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular localisation | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue type | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Inducer | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Repressor | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Best BLASTp hits |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '5222' 'complement(join(1483468..1483884,1483936..1484310,1484361..1484777,1484836..1485282,1485386..1485417,1485474..1485615,1485665..1485798,1485850..1486008,1486055..1486076))' |
Exons►
|
Literature and cross-references CnKat03_H99 (CAT3)
Literature | Giles S.S., Stajich J.E., Nichols C., Gerrald Q.D., Alspaugh J.A., Dietrich F., Perfect J.R. The Cryptococcus neoformans catalase gene family and its role in antioxidant defense. Eukaryot. Cell 5:1447-1459(2006). |
---|---|
Protein ref. | UniProtKB: Q15EU5 |
DNA ref. | JGI genome: cneoH99_Chr1 (1486076..1483468) |
Protein sequence: CnKat03_H99 (CAT3)
Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
|
||||||||||||
Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
|
||||||||||||
Remarks | Complete sequence from genomic (8 introns). DNA contains an extra "G" => bad intron for the junction exon 5/intron 5. | ||||||||||||
DNA ► Send to BLAST |
|
||||||||||||
CDS► Send to BLAST |
|