1. Browse the Database
  2. View Redoxidase
Entry information : BdeKat01 (BdecatX)
Entry ID 5237
Creation 2007-04-17 (Marcel Zamocky)
Last sequence changes 2012-05-07 (Catherine Mathe (Scipio))
Sequence status complete
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2012-05-07 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: BdeKat01 (BdecatX)
Name (synonym) BdeKat01 (BdecatX)
Class Catalase    [Orthogroup: Kat001]
Taxonomy Eukaryota Fungi Chytridiomycota Chytridiomycetes Batrachochytrium
Organism Batrachochytrium dendrobatidis    [TaxId: 109871 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value BdeKat01
start..stop		 S start..stop
BhaKat02_C-125 682 0 53..537 20..499
BsKat03_168 665 0 53..546 35..523
PfKat02_Pf5 447 1.35e-153 47..534 5..473
TsKat02 445 9.32e-153 53..536 17..486
Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '5237' 'join(330799..332439)' Exons►
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 330799..332439 1639  
join(330799..332439)


exon

Literature and cross-references BdeKat01 (BdecatX)
Literature Birren,B. et al., The Broad Institute Genome Sequencing Platform. The Genome Sequence of Batrachochytrium dendrobatidis JEL423. Unpublished
DNA ref. JGI genome:   scaffold_5 (330799..332439)
mRNA ref. JGI transcript:   10953
Protein sequence: BdeKat01 (BdecatX)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   546
PWM (Da):   %s   60954.96  
PI (pH):   %s   6.42
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MICPYAVMAC SNPHQGMGTA APAPAGATTP SSMIKSLDIN GKTDDSSMGI IGLTTRQGHA VPDNQNSKSA GSRGPLMLQD YHFQEKMSHF VRERIPERVV HGRGAGAHGY FEAYGSAGNE  TIGKYTRAKL FDTKGKRTPV FTRFSTVIHG GTSPETLRDP RGFAVKFYTE DGNWDLVGLN LKVFFIRDSI KFPDMVHSLK PDPVTNIQDP NRVFDFMSQT PESTHMLTFL NSPWGIPADY  RHMHGSGVNT YKWVNKEGLA HLVKYHWISK QGTKNLKQSE ADAVQSNDFN HATDDLYRSI KRGEYPEWEL NVQLLTDDEH SELDFDPLDD TKLWPESIAP MLPVGRMVLD RNPVNYYAEV  EQAAFGTGVL VDGLDFSDDK MLQGRTFSYG DAQRYRLGVN YLQLPINKPL NKVATNQRDG TMTYFVDGTD AGENPHINYE PSSRNGLVQQ PNVYPGPVHE PVLPDGTKIG RAPINRTNPF 
AQAGETYRSF EDWERDELIM NLGKALAVCN KDIQERMVHN FSQADKDYGA RVAKAIEDIS SKMMQG 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (no intron in ORF predicted). Strain="JEL423".
DNA ►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGATATGTC CCTATGCGGT AATGGCATGT TCGAATCCAC ACCAGGGTAT GGGTACGGCT GCTCCAGCAC CTGCTGGAGC TACTACACCA TCTTCAATGA TTAAATCTCT TGATATAAAC  GGTAAAACGG ATGACTCTTC TATGGGCATC ATTGGTTTGA CTACTCGTCA AGGACATGCA GTTCCAGACA ATCAAAACTC GAAATCTGCT GGAAGTCGAG GTCCTCTGAT GCTGCAAGAT  TATCATTTTC AGGAGAAAAT GTCCCATTTT GTTCGTGAAC GTATTCCAGA ACGAGTTGTG CATGGACGTG GTGCCGGTGC CCATGGATAT TTTGAAGCCT ACGGAAGCGC TGGAAACGAG  ACGATTGGCA AGTACACCAG AGCAAAGCTG TTTGACACTA AAGGCAAGCG CACACCTGTG TTTACACGGT TTTCTACTGT TATTCATGGT GGTACTTCAC CCGAAACCTT GCGTGATCCC  CGTGGATTCG CAGTCAAGTT CTATACCGAA GACGGTAACT GGGATCTTGT TGGTCTCAAT CTCAAGGTGT TTTTTATTCG TGATTCCATC AAGTTTCCCG ACATGGTTCA CAGTTTGAAA  CCCGATCCAG TCACAAACAT TCAAGATCCA AACCGTGTAT TCGACTTTAT GAGTCAAACT CCCGAGTCAA CTCATATGCT GACATTTTTG AATTCGCCAT GGGGTATTCC TGCCGACTAT  CGCCACATGC ACGGCAGTGG TGTCAACACA TACAAGTGGG TCAACAAGGA AGGCTTGGCA CACCTTGTCA AATATCACTG GATCTCCAAA CAAGGCACCA AAAACCTCAA GCAAAGCGAG  GCTGATGCAG TTCAATCCAA CGACTTCAAC CATGCTACAG ATGATCTGTA TCGGTCAATC AAGCGAGGCG AGTATCCAGA ATGGGAGTTG AATGTACAAC TGTTGACAGA TGACGAGCAC  AGTGAATTGG ATTTTGATCC TCTTGACGAT ACCAAACTGT GGCCAGAGTC GATTGCGCCA ATGCTTCCAG TTGGACGTAT GGTTCTTGAT CGTAACCCAG TCAATTACTA TGCCGAGGTA  GAGCAGGCGG CATTTGGAAC AGGAGTTTTG GTTGACGGAT TGGATTTCTC GGACGACAAG ATGTTGCAAG GTCGCACGTT CAGTTATGGT GATGCACAAC GATATCGTCT TGGTGTCAAT  TATTTACAGT TGCCAATCAA CAAACCTTTG AACAAGGTGG CAACCAATCA GCGTGACGGT ACAATGACAT ACTTTGTGGA CGGTACAGAT GCAGGCGAGA ATCCTCATAT TAACTACGAG  CCATCCAGTC GCAACGGTCT TGTGCAGCAG CCAAATGTAT ATCCAGGACC TGTGCATGAG CCTGTTTTAC CCGATGGAAC CAAGATTGGA CGCGCACCTA TTAATCGTAC GAATCCGTTT  GCTCAAGCTG GCGAGACTTA CAGGAGTTTC GAAGATTGGG AACGAGATGA GCTTATTATG AATCTTGGCA AAGCACTTGC AGTATGCAAC AAAGACATTC AAGAGCGCAT GGTGCATAAC 
TTTAGTCAAG CCGATAAAGA TTATGGTGCA CGAGTTGCCA AAGCGATTGA AGATATTTCT TCAAAGATGA TGCAAGGATA A 

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGATATGTC CCTATGCGGT AATGGCATGT TCGAATCCAC ACCAGGGTAT GGGTACGGCT GCTCCAGCAC CTGCTGGAGC TACTACACCA TCTTCAATGA TTAAATCTCT TGATATAAAC  GGTAAAACGG ATGACTCTTC TATGGGCATC ATTGGTTTGA CTACTCGTCA AGGACATGCA GTTCCAGACA ATCAAAACTC GAAATCTGCT GGAAGTCGAG GTCCTCTGAT GCTGCAAGAT  TATCATTTTC AGGAGAAAAT GTCCCATTTT GTTCGTGAAC GTATTCCAGA ACGAGTTGTG CATGGACGTG GTGCCGGTGC CCATGGATAT TTTGAAGCCT ACGGAAGCGC TGGAAACGAG  ACGATTGGCA AGTACACCAG AGCAAAGCTG TTTGACACTA AAGGCAAGCG CACACCTGTG TTTACACGGT TTTCTACTGT TATTCATGGT GGTACTTCAC CCGAAACCTT GCGTGATCCC  CGTGGATTCG CAGTCAAGTT CTATACCGAA GACGGTAACT GGGATCTTGT TGGTCTCAAT CTCAAGGTGT TTTTTATTCG TGATTCCATC AAGTTTCCCG ACATGGTTCA CAGTTTGAAA  CCCGATCCAG TCACAAACAT TCAAGATCCA AACCGTGTAT TCGACTTTAT GAGTCAAACT CCCGAGTCAA CTCATATGCT GACATTTTTG AATTCGCCAT GGGGTATTCC TGCCGACTAT  CGCCACATGC ACGGCAGTGG TGTCAACACA TACAAGTGGG TCAACAAGGA AGGCTTGGCA CACCTTGTCA AATATCACTG GATCTCCAAA CAAGGCACCA AAAACCTCAA GCAAAGCGAG  GCTGATGCAG TTCAATCCAA CGACTTCAAC CATGCTACAG ATGATCTGTA TCGGTCAATC AAGCGAGGCG AGTATCCAGA ATGGGAGTTG AATGTACAAC TGTTGACAGA TGACGAGCAC  AGTGAATTGG ATTTTGATCC TCTTGACGAT ACCAAACTGT GGCCAGAGTC GATTGCGCCA ATGCTTCCAG TTGGACGTAT GGTTCTTGAT CGTAACCCAG TCAATTACTA TGCCGAGGTA  GAGCAGGCGG CATTTGGAAC AGGAGTTTTG GTTGACGGAT TGGATTTCTC GGACGACAAG ATGTTGCAAG GTCGCACGTT CAGTTATGGT GATGCACAAC GATATCGTCT TGGTGTCAAT  TATTTACAGT TGCCAATCAA CAAACCTTTG AACAAGGTGG CAACCAATCA GCGTGACGGT ACAATGACAT ACTTTGTGGA CGGTACAGAT GCAGGCGAGA ATCCTCATAT TAACTACGAG  CCATCCAGTC GCAACGGTCT TGTGCAGCAG CCAAATGTAT ATCCAGGACC TGTGCATGAG CCTGTTTTAC CCGATGGAAC CAAGATTGGA CGCGCACCTA TTAATCGTAC GAATCCGTTT  GCTCAAGCTG GCGAGACTTA CAGGAGTTTC GAAGATTGGG AACGAGATGA GCTTATTATG AATCTTGGCA AAGCACTTGC AGTATGCAAC AAAGACATTC AAGAGCGCAT GGTGCATAAC 
TTTAGTCAAG CCGATAAAGA TTATGGTGCA CGAGTTGCCA AAGCGATTGA AGATATTTCT TCAAAGATGA TGCAAGGATA A 

Retrieve as FASTA