Entry information : AnLDS03
| Entry ID | 5306 |
|---|---|
| Creation | 2007-05-01 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2012-04-23 (Catherine Mathe (Scipio)) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Marcel Zamocky |
| Last annotation changes | 2013-09-04 (Catherine Mathe (Scipio)) |
Peroxidase information: AnLDS03
| Name | AnLDS03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Class | Linoleate diol synthase (PGHS like) [Orthogroup: LDS001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Fungi Ascomycota Eurotiomycetes Trichocomaceae Aspergillus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Aspergillus niger [TaxId: 5061 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
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| Tissue type | N/D |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '5306' 'complement(join(2012746..2012807,2012864..2013143,2013192..2013428,2013481..2013895,2013949..2014436,2014489..2014832,2014882..2015212,2015264..2015354,2015410..2015550,2015605..2015809,2015863..2016104,2016161..2016258,2016323..2016721))' |
Exons►
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Literature and cross-references AnLDS03
| Literature | Hoernsten L., Su C., Osbourn A.E., Garosi P., Hellman U., Wernstedt C., Oliw E.H. Cloning of linoleate diol synthase reveals homology with prostaglandin H synthases. J. Biol. Chem. 274:28219-28224(1999). |
|---|---|
| Protein ref. | UniProtKB: A2QDQ5 |
| DNA ref. | JGI genome: chr_4_2 (2016721..2012746) |
| EST ref. | GenBank: EY248257.1 [5' end] EY227996.1 [3' end] |
Protein sequence: AnLDS03
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic (12 introns) and 7 ESTs. Strain="CBS 513.88". Fusion of peroxidase domain with CypX (cytochrome P450). | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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