1. Browse the Database
  2. View Redoxidase
Entry information : ZmRboh13(Zm00001d009248 / GRMZM2G022547 / ZmRbohX)
Entry ID 5556
Creation 2007-11-09 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2007-11-09 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2023-01-19 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: ZmRboh13(Zm00001d009248 / GRMZM2G022547 / ZmRbohX)
Name ZmRboh13(Zm00001d009248 / GRMZM2G022547 / ZmRbohX)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Monocotyledons Poaceae Zea
Organism Zea mays    [TaxId: 4577 ]
Cellular localisation N/D
Tissue types Inflorescences
Meristems
Mixed tissues
Pericarps
Roots
Seeds
Shoots
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value ZmRboh13
start..stop		 S start..stop
SbRboh01 1696 0 1..897 13..908
ZmRboh04 1680 0 6..898 2..894
OsRboh01 1631 0 6..897 11..905
TaRboh05-1B 1575 0 1..897 6..900
Literature and cross-references ZmRboh13(Zm00001d009248 / GRMZM2G022547 / ZmRbohX)
Literature Chen,H.D., Zhang,X., Zhou,R.L., Arias L,A.C., Shendelman, J.M.,Zazubovits,N., Borsuk,L.A., Emrich,S.J., Ashlock,D.A., Scanlon,M.J. and Schnable,P.S. Expressed Sequence Tags from B73 Maize Shoot Apical Meristems
DNA ref. GenBank:   AC199701
Cluster/Prediction ref. UniGene:   Zm.13659
Protein sequence: ZmRboh13(Zm00001d009248 / GRMZM2G022547 / ZmRbohX)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   897
PWM (Da):   %s   101206.29 Transmb domain:   %s   o348-367i488-510o530-552i713-730o
PI (pH):   %s   9.63
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAATEAATDT GSSRRSQDDT TTLVPHSGNL GEPIQKGVKT TRFKDDDEVV EITIVQRDSV AIEDVRVVDD GGSGHSNGFD GLSLVSPSSS RSGKLSSKIR QVKNGLKMKN SSTKAPQTQL  GKNMRKRLDR SKSGAAVALK GLQFVTAKVG HDGWAVVEKR FNELQVDGVL LRSRFGKCIG MDGSDEFAVQ LFDSLARKRG ITKQVLTKDE LKDFWEQLSD QGFDNRLQIF FDMVDKNADG  RITEEEVKEI ITLSASANKL SKLKERADEY TALIMEELDR DSLGYIELED LKALLLQSPS QVVARSTTHS SKLSKALSMK LASNKDTGPF YHYWQEFMYF LEENWKRIWV MTLWLSICIG  LFIWKFIQYR NRAVFHIMGY CVTTAKGAAE TLKFNMALVL FPVCRNTITW IRSKTKIGAV VPFNDNINFH KVIAAGVAVG VVLHAGAHLT CDFPLLLHAS DAAYEPMKPF FGDKRPPNYW  WFVKGTEGWT GVVMVVLMTI AFVLAQPWFR RNKLKDSNPL KKMTGFNAFW FTHHLFVIVY ALLIVHGTCL YLSRKWYKKT TWMYLAVPVL LYVSERILRL FRSHDAVRIQ KVAVYPGNVL  ALYMSKPPGF RYRSGQYIFI KCSDVSPYEW HPFSITSAPG DDYLSVHIRT RGDWTSRLRT VFSEACRPPS DGESGLLRAD PSKGITETNA RFPKLLIDGP YGAPAQDYQE YDVLLLIGLG  IGATPLISIV KDVLNHIQLG GSVAGTEPEG SGKAKKRPFM TKRAYFYWVT REEGSFEWFR GVMNEVAEKD KDGVIELHNH CSSVHQEGDV RSALIVMLQE LQHAKKGVDI LSGTSVKTHF 
ARPNWRSVFK HVAVNHENQR IGVFYCGEPV LVPQLRQLSA DFTHKTNTKF EFHKENF* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo 8) and 40 ESTs. Cultivar="inbred B73", "Ohio43".
DNA ►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAGCCA CTGAAGCTGC CACGGACACA GGCAGTTCAA GGAGGTCACA AGATGACACT ACAACATTAG TCCCACACAG TGGGAATTTG GGAGAACCAA TCCAGAAGGG CGTGAAGACC  ACCAGATTCA AAGATGATGA CGAGGTTGTG GAAATCACCA TTGTACAGCG CGATTCAGTG GCAATCGAAG ATGTCAGGGT AGTCGATGAT GGTGGCTCAG GGCATAGTAA TGGGTTTGAT  GGCCTGTCAC TTGTGTCACC TTCCTCATCA AGGAGCGGCA AGCTATCATC AAAGATTAGG CAAGTGAAAA ATGGACTAAA GATGAAGAAC TCAAGCACTA AGGCGCCACA GACACAGTTG  GGAAAGAACA TGAGGAAGAG ATTGGACAGA AGCAAGAGCG GGGCTGCTGT AGCGCTCAAG GGCTTGCAGT TTGTGACTGC AAAAGTTGGT CATGATGGCT GGGCTGTAGT GGAGAAACGG  TTCAACGAGC TACAGGTTGA TGGTGTGCTG CTACGTTCAA GATTTGGGAA ATGCATTGGT AATTATAGCG GTTCTATTGA ATGTGTATCT CCATAGAGCC ATTTGAACAG TGCTAATACA  ATCATTGCTT TGGTTCTGCA GGGATGGATG GATCTGATGA GTTTGCAGTG CAATTGTTTG ATTCATTAGC AAGAAAGAGA GGGATAACAA AGCAGGTGCT GACTAAAGAT GAGCTCAAAG  ATTTCTGGGA GCAACTCAGT GATCAGGGTT TTGACAACCG TTTACAGATA TTCTTTGACA TGTTAGTATT TTTGATGAAT ATCTGGTTTC CTTCATGCAT AACTGTATGT GATGAGTTAT  TGAAATCCAG CTCCACATAA AAAAATACTT GGCCTTACTA ACATGTTATT TTAAAAAATG AAGCAAACTA TTGTAATAAG TTTACATGCT GCTGTTGTGT ATTCCATAAT TTCATTTGGC  ACTTAGCATT GTTAATTTTT TTTCTGTCCA GGGTTGATAA GAATGCCGAT GGAAGAATCA CAGAAGAGGA GGTTAAGGAG GTCTGTCAGA AGAATCTATA ATTGAAAATC TAATATGTTC  ATGTTGTACG TTGTTAGATT CTAAGTTAGT GATAGTACGC TCTTGCAGAT TATTACCCTC AGTGCATCAG CAAACAAACT TTCCAAGCTC AAGGAACGAG CTGATGAGTA CACGGCACTC  ATAATGGAAG AACTTGACCG TGACAGCCTT GGATACATTG AGGTCTGCCC AATGCCCCAA TCTTACTCAT AAAAATAACA ATTTTGGCTG TCAATGAACT AACTCATGCT AAACGATTAA  CAGCTTGAGG ATCTGAAGGC ACTTTTGCTG CAATCACCTT CTCAAGTTGT TGCAAGATCA ACAACGCATA GCTCGAAACT TAGCAAAGCT CTTAGCATGA AGCTTGCATC AAACAAGGAC  ACAGGTCCAT TTTACCACTA CTGGCAAGAG TTCATGTACT TCCTTGAGGA GAACTGGAAG CGCATTTGGG TTATGACTCT CTGGCTCTCA ATCTGCATTG GCCTCTTTAT TTGGAAGTTC  ATCCAATACC GTAATCGAGC AGTATTTCAC ATCATGGGTT ATTGTGTGAC CACTGCAAAA GGTGCTGCAG AGACCCTCAA ATTCAATATG GCCCTGGTTC TTTTTCCTGT TTGCCGAAAT  ACAATCACAT GGATTCGATC AAAGACAAAG ATCGGTGCTG TTGTGCCCTT CAATGACAAC ATAAACTTCC ATAAGGTAAG ACTATATGTA CTCAGTATCG AACACAGGAT GATTCTTTCC  ATTCTGTGGG AGTATCTGTT CCAATTGAAA CATAGTTCTC TCTTTTTTTA TCCTAGAGGA CCAATGAGAA TGAATTGTTA ACCTTCCCAT CTGATAGTTA CACTTGCTAA TGTGGAAGTT  ACATTATGTA ATATGTATGG AATTATTGTG CAGGTAATAG CAGCAGGTGT TGCAGTTGGT GTTGTTTTGC ATGCAGGTGC TCACCTGACA TGTGATTTTC CTCTGCTGCT GCATGCAAGT  GATGCTGCCT ATGAACCAAT GAAGCCTTTC TTTGGAGACA AAAGGCCACC AAATTACTGG TGGTTTGTAA AGGGAACTGA AGGGTGGACA GGTGTGGTCA TGGTTGTACT TATGACTATA  GCTTTCGTAT TGGCCCAGCC ATGGTTTCGG CGTAATAAGC TCAAGGATTC TAATCCCCTC AAGAAAATGA CTGGCTTCAA TGCCTTTTGG TTTACTCACC ACTTATTTGT TATTGTGTAT  GCACTGCTCA TTGTCCATGG GACCTGTTTA TATCTAAGCA GGAAATGGTA CAAGAAAACG GTAAACATCT GTACCCTCAT TGGCTAGGGA GTATCTGATT TCTGGAAGTT ATTACTTACA  CAGCATCTCA ACCGTTGCAG ACATGGATGT ACCTTGCTGT CCCTGTGCTC TTGTATGTAA GTGAGCGCAT TCTTCGGCTA TTTAGGAGCC ATGATGCTGT TAGGATTCAG AAGGTACATA  CAATTCCGTT CCTTTGGTTT TGCTTGTATA TTTCAACTTG CATATGATGA GAACAAAACA AAGTCAGACA GTAGGAGGTG TGCACTACTC CCTCCGTTCC CTATCTTAAG GCCACGAAGG  TATGTTCTAA GTCAATTTTT TTCAACTTTG ACCAGTAATA ACAAAATATT CATAAATATT TACTAAATAA AATGAAATAT TATATTTATT ATTAAAACAT CTACCACTAT ATATAATTTT  TGTAATTTAA AAATAATTAT TTTTATAGAT ATTGTTGGTC AAAGTTTCAA AACATTGACT TAGGACAACC TTCGTCACCT TAAGATAAGG AACGGAGGGA GTATGCTATA CAGCCTTCAC  CCAACTTCTG TGTTGAACTC GAATTTCCGT GTCTATTTTC TTTCATTCTA CAAAGATACC TACTTACTCT GTAGTATTTT CATTTTATTT ATTTATGAAA AGTCATTTTT GAAAGTTTTG  GTTTCCCTCT TTGACTTTTA ATTTTGTGCC CTCTCAATAG GTTGCAGTAT ATCCAGGGAA TGTTTTGGCT CTCTATATGT CCAAGCCACC TGGATTCAGG TATCGGAGTG GGCAGTATAT  CTTCATAAAA TGCAGTGATG TCTCTCCATA CGAATGGTAG GCACTTACAC CCTTCCTCAT GGAAAGTGAT AATCAGTAGA TGACTGAAGT GCATAAATTC TCTCTCTTGC AGGCACCCAT  TTTCGATTAC ATCAGCACCA GGAGATGATT ATCTTAGTGT CCACATTCGC ACAAGGGGTG ATTGGACTTC ACGTCTTAGG ACTGTCTTCT CTGAGGTGAT TTGGCTCTTA GGTTGAGTTT  TTATTGGCCC AATAGGATCC TTCTAGAAAG ACTCAACAAC TCTTAGAGGA CGGTGAATGC AACTTGTGAA ATTTGTTATT TGTGAATTGT GATATCTGAT GCAATTGCTT TTGTTGTTGG  AACTGACAAT TACGTAAACA TGAACCAGGC ATGCCGCCCT CCATCTGATG GAGAAAGTGG ACTCCTTAGA GCTGACCCTT CCAAGGGGAT CACCGAGACC AACGCGAGGT AGAATTTGTA  TAATTTCTTT TGAAATGTAG TACAGTAAAG TATACATTTC TTAGATTCAT CTGACCCTGA ATTTTGACAT GGTCTAGGTT CCCGAAACTC TTGATTGATG GACCATACGG TGCTCCAGCG  CAAGACTATC AGGAATATGA TGTGCTCCTG CTCATTGGAC TGGGCATTGG AGCCACACCA TTGATTAGCA TTGTGAAGGA TGTACTTAAC CACATCCAGC TTGGAGGATC TGTTGCAGGC  ACGGAGCCTG AGGGCAGTGG CAAGGCCAAG AAGAGGCCAT TCATGACAAA GAGGGCCTAC TTCTACTGGG TGACCAGGGA AGAGGGGTCC TTTGAATGGT TCCGAGGGGT CATGAATGAG  GTGGCTGAGA AGGACAAGGA TGGAGTCATT GAACTCCACA ACCACTGCTC GAGTGTGCAC CAGGAAGGGG ATGTACGTTC TGCCCTCATT GTCATGCTCC AGGAGCTCCA GCACGCGAAG  AAGGGAGTCG ACATCTTGTC TGGAACTAGT GTCAAGACGC ATTTTGCACG GCCGAATTGG CGAAGCGTCT TCAAACATGT TGCAGTGAAC CACGAGAACC AACGCATCGG TATGTCACGT  CCTTTGTGTC ATCTTCCTAT CATGTCAGAA GCACTACAAA CATTCTATGC CACCTTCCTA CTGTGTTCAA GCACTAGAAA CGTCAATTGA CTTCATCATC TACTAACATT TGATGGCTGT 
CCAGGAGTTT TCTACTGTGG TGAGCCCGTC CTTGTGCCAC AGCTACGGCA GCTGTCAGCG GACTTCACCC ACAAGACAAA TACTAAGTTC GAGTTCCACA AGGAGAACTT CTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAGCCA CTGAAGCTGC CACGGACACA GGCAGTTCAA GGAGGTCACA AGATGACACT ACAACATTAG TCCCACACAG TGGGAATTTG GGAGAACCAA TCCAGAAGGG CGTGAAGACC  ACCAGATTCA AAGATGATGA CGAGGTTGTG GAAATCACCA TTGTACAGCG CGATTCAGTG GCAATCGAAG ATGTCAGGGT AGTCGATGAT GGTGGCTCAG GGCATAGTAA TGGGTTTGAT  GGCCTGTCAC TTGTGTCACC TTCCTCATCA AGGAGCGGCA AGCTATCATC AAAGATTAGG CAAGTGAAAA ATGGACTAAA GATGAAGAAC TCAAGCACTA AGGCGCCACA GACACAGTTG  GGAAAGAACA TGAGGAAGAG ATTGGACAGA AGCAAGAGCG GGGCTGCTGT AGCGCTCAAG GGCTTGCAGT TTGTGACTGC AAAAGTTGGT CATGATGGCT GGGCTGTAGT GGAGAAACGG  TTCAACGAGC TACAGGTTGA TGGTGTGCTG CTACGTTCAA GATTTGGGAA ATGCATTGGG ATGGATGGAT CTGATGAGTT TGCAGTGCAA TTGTTTGATT CATTAGCAAG AAAGAGAGGG  ATAACAAAGC AGGTGCTGAC TAAAGATGAG CTCAAAGATT TCTGGGAGCA ACTCAGTGAT CAGGGTTTTG ACAACCGTTT ACAGATATTC TTTGACATGG TTGATAAGAA TGCCGATGGA  AGAATCACAG AAGAGGAGGT TAAGGAGATT ATTACCCTCA GTGCATCAGC AAACAAACTT TCCAAGCTCA AGGAACGAGC TGATGAGTAC ACGGCACTCA TAATGGAAGA ACTTGACCGT  GACAGCCTTG GATACATTGA GCTTGAGGAT CTGAAGGCAC TTTTGCTGCA ATCACCTTCT CAAGTTGTTG CAAGATCAAC AACGCATAGC TCGAAACTTA GCAAAGCTCT TAGCATGAAG  CTTGCATCAA ACAAGGACAC AGGTCCATTT TACCACTACT GGCAAGAGTT CATGTACTTC CTTGAGGAGA ACTGGAAGCG CATTTGGGTT ATGACTCTCT GGCTCTCAAT CTGCATTGGC  CTCTTTATTT GGAAGTTCAT CCAATACCGT AATCGAGCAG TATTTCACAT CATGGGTTAT TGTGTGACCA CTGCAAAAGG TGCTGCAGAG ACCCTCAAAT TCAATATGGC CCTGGTTCTT  TTTCCTGTTT GCCGAAATAC AATCACATGG ATTCGATCAA AGACAAAGAT CGGTGCTGTT GTGCCCTTCA ATGACAACAT AAACTTCCAT AAGGTAATAG CAGCAGGTGT TGCAGTTGGT  GTTGTTTTGC ATGCAGGTGC TCACCTGACA TGTGATTTTC CTCTGCTGCT GCATGCAAGT GATGCTGCCT ATGAACCAAT GAAGCCTTTC TTTGGAGACA AAAGGCCACC AAATTACTGG  TGGTTTGTAA AGGGAACTGA AGGGTGGACA GGTGTGGTCA TGGTTGTACT TATGACTATA GCTTTCGTAT TGGCCCAGCC ATGGTTTCGG CGTAATAAGC TCAAGGATTC TAATCCCCTC  AAGAAAATGA CTGGCTTCAA TGCCTTTTGG TTTACTCACC ACTTATTTGT TATTGTGTAT GCACTGCTCA TTGTCCATGG GACCTGTTTA TATCTAAGCA GGAAATGGTA CAAGAAAACG  ACATGGATGT ACCTTGCTGT CCCTGTGCTC TTGTATGTAA GTGAGCGCAT TCTTCGGCTA TTTAGGAGCC ATGATGCTGT TAGGATTCAG AAGGTTGCAG TATATCCAGG GAATGTTTTG  GCTCTCTATA TGTCCAAGCC ACCTGGATTC AGGTATCGGA GTGGGCAGTA TATCTTCATA AAATGCAGTG ATGTCTCTCC ATACGAATGG CACCCATTTT CGATTACATC AGCACCAGGA  GATGATTATC TTAGTGTCCA CATTCGCACA AGGGGTGATT GGACTTCACG TCTTAGGACT GTCTTCTCTG AGGCATGCCG CCCTCCATCT GATGGAGAAA GTGGACTCCT TAGAGCTGAC  CCTTCCAAGG GGATCACCGA GACCAACGCG AGGTTCCCGA AACTCTTGAT TGATGGACCA TACGGTGCTC CAGCGCAAGA CTATCAGGAA TATGATGTGC TCCTGCTCAT TGGACTGGGC  ATTGGAGCCA CACCATTGAT TAGCATTGTG AAGGATGTAC TTAACCACAT CCAGCTTGGA GGATCTGTTG CAGGCACGGA GCCTGAGGGC AGTGGCAAGG CCAAGAAGAG GCCATTCATG  ACAAAGAGGG CCTACTTCTA CTGGGTGACC AGGGAAGAGG GGTCCTTTGA ATGGTTCCGA GGGGTCATGA ATGAGGTGGC TGAGAAGGAC AAGGATGGAG TCATTGAACT CCACAACCAC  TGCTCGAGTG TGCACCAGGA AGGGGATGTA CGTTCTGCCC TCATTGTCAT GCTCCAGGAG CTCCAGCACG CGAAGAAGGG AGTCGACATC TTGTCTGGAA CTAGTGTCAA GACGCATTTT  GCACGGCCGA ATTGGCGAAG CGTCTTCAAA CATGTTGCAG TGAACCACGA GAACCAACGC ATCGGAGTTT TCTACTGTGG TGAGCCCGTC CTTGTGCCAC AGCTACGGCA GCTGTCAGCG 
GACTTCACCC ACAAGACAAA TACTAAGTTC GAGTTCCACA AGGAGAACTT CTAA 

Retrieve as FASTA