Entry information : OsRboh02(LOC_Os01g53294 / OsNox02 / RbohAOsp / OsRbohA)
Entry ID | 5567 |
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Creation | 2007-07-19 (Christophe Dunand) |
Last sequence changes | 2010-08-04 (Christophe Dunand) |
Sequence status | complete |
Reviewer | Christophe Dunand |
Last annotation changes | 2022-02-28 (Christophe Dunand) |
Peroxidase information: OsRboh02(LOC_Os01g53294 / OsNox02 / RbohAOsp / OsRbohA)
Name | OsRboh02(LOC_Os01g53294 / OsNox02 / RbohAOsp / OsRbohA) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Class | Respiratory burst oxidase homolog [Orthogroup: Rboh002] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Taxonomy | Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism | Oryza sativa ssp japonica cv Nipponbare [TaxId: 39947 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular localisation | N/D |
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Tissue types | Callus Inflorescences Roots Stems |
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Inducer | N/D |
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Repressor | N/D |
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Best BLASTp hits |
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Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '5567' 'join(30615335..30615980,30616072..30616231,30616350..30616398,30617561..30617674,30623848..30624270,30624523..30624906,30624991..30625086,30625161..30625276,30625431..30625598,30625685..30625844,30625999..30626196,30626304..30626432,30626595..30626673,30627010..30627119)' |
Exons►
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Literature and cross-references OsRboh02(LOC_Os01g53294 / OsNox02 / RbohAOsp / OsRbohA)
Cluster/Prediction ref. | UniGene: Os.3427 |
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Protein sequence: OsRboh02(LOC_Os01g53294 / OsNox02 / RbohAOsp / OsRbohA)
Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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Remarks | Complete sequence from genomic (chromo 1, 10 introns), 4 mRNA and 12 ESTs. Incorrect prediction from Phytozome (first 216 AA are msiing). O48539 (partial mRNA, 5'end missing), O24214 (partial mRNA, 5'end missing), Q0JJJ9 (partial prediction, 5'end missing), A2ZXJ9 (partial prediction, 5'end missing), Q5JL59 (partial prediction, 5'end missing), A2ZXJ8 (partial prediction, short 5'end). |
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DNA ► Send to BLAST |
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CDS► Send to BLAST |
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