Entry information : OsRboh04(LOC_Os05g38980 / OsNox04 / OsRbohD)
| Entry ID | 5568 |
|---|---|
| Creation | 2007-07-19 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2007-07-19 (Christophe Dunand) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Christophe Dunand |
| Last annotation changes | 2022-02-28 (Christophe Dunand) |
Peroxidase information: OsRboh04(LOC_Os05g38980 / OsNox04 / OsRbohD)
| Name | OsRboh04(LOC_Os05g38980 / OsNox04 / OsRbohD) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Class | Respiratory burst oxidase homolog [Orthogroup: Rboh003] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Oryza sativa ssp japonica cv Nipponbare [TaxId: 39947 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
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| Tissue types | Flowers Inflorescences Leaves |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '5568' 'join(22715144..22715444,22716245..22716407,22716484..22716532,22716626..22716739,22716812..22717234,22717307..22717693,22717777..22717872,22717978..22718093,22718170..22718272,22718392..22718480,22718586..22718736,22718817..22718966,22719057..22719185,22719276..22719354,22719435..22719544)' |
Exons►
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Literature and cross-references OsRboh04(LOC_Os05g38980 / OsNox04 / OsRbohD)
| Literature | IRGSP(International Rice Genome Sequencing Project). Oryza sativa nipponbare(GA3) genomic DNA, chromosome 5. Submitted (FEB-2005) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. |
|---|---|
| DNA ref. | GenBank: NC_008398.1 (22715144..22719541) |
| mRNA ref. | GenBank: AK072353 |
| Cluster/Prediction ref. | UniGene: Os.53380 |
Protein sequence: OsRboh04(LOC_Os05g38980 / OsNox04 / OsRbohD)
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic (chromo 5, introns), 2 mRNA and 17 ESTs. four SwissProt/TREMBL accessions: Q0DHH6 (DNA), A3BUB0 (uncorrect prediction confirmed with ESTs), Q6I5J8 (Partial prediction, 3' missing), Q6I5U1 (Partial prediction, 3' missing). | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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