Entry information : OsRboh07(LOC_Os09g26660 / OsNox07 / OsRbohG)
Entry ID | 5571 |
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Creation | 2007-07-19 (Christophe Dunand) |
Last sequence changes | 2007-07-19 (Christophe Dunand) |
Sequence status | complete |
Reviewer | Christophe Dunand |
Last annotation changes | 2022-02-28 (Christophe Dunand) |
Peroxidase information: OsRboh07(LOC_Os09g26660 / OsNox07 / OsRbohG)
Name | OsRboh07(LOC_Os09g26660 / OsNox07 / OsRbohG) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Class | Respiratory burst oxidase homolog [Orthogroup: Rboh002] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Taxonomy | Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism | Oryza sativa ssp japonica cv Nipponbare [TaxId: 39947 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular localisation | N/D |
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Tissue types | Callus Flowers Inflorescences Leaves Roots |
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Inducer | N/D |
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Repressor | N/D |
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Best BLASTp hits |
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Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '5571' 'join(16131779..16132475,16132609..16132768,16132944..16132992,16133158..16133271,16133434..16133958,16135538..16135969,16139530..16139625,16140610..16140725,16140822..16140992,16141080..16141239,16141328..16141513,16141624..16141752,16141837..16141915,16142034..16142143)' |
Exons►
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Literature and cross-references OsRboh07(LOC_Os09g26660 / OsNox07 / OsRbohG)
Literature | IRGSP(International Rice Genome Sequencing Project). Oryza sativa nipponbare(GA3) genomic DNA, chromosome 9. Unpublished. |
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Protein ref. | UniProtKB: Q69LJ6 Q69LJ7 UniProtKB_Uniparc: A3BZ74 |
DNA ref. | GenBank: NC_008402.1 (16131779..16142140) |
Cluster/Prediction ref. | UniGene: Os.39734 |
Protein sequence: OsRboh07(LOC_Os09g26660 / OsNox07 / OsRbohG)
Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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Remarks | Complete sequence from genomic (chromo 9, 13 introns), 3 mRNA and 15 ESTs. Q69LJ7, A3BZ74 (uncorrect prediction, extra sequence not confirmed from ESTs), Q69LJ6 (uncorrect 3'end prediction). | ||||||||||||
DNA ► Send to BLAST |
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CDS► Send to BLAST |
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