Entry information : PtroNOx05-B
Entry ID | 6042 |
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Creation | 2007-12-05 (Christophe Dunand) |
Last sequence changes | 2010-11-23 (Myriam Duval) |
Sequence status | complete |
Reviewer | Christophe Dunand |
Last annotation changes | 2016-02-11 (Christophe Dunand) |
Peroxidase information: PtroNOx05-B
Name | PtroNOx05-B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Class | NADPH oxidase V [Orthogroup: NOxV001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Taxonomy | Eukaryota Metazoa Chordata Mammalia Hominidae Pan | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism | Pan troglodytes (chimpanzee) [TaxId: 9598 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular localisation | N/D |
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Tissue type | N/D |
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Inducer | N/D |
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Repressor | N/D |
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Best BLASTp hits |
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Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '6042' 'join(1..50,11785..11908,13472..13622,16845..17055,18289..18523,20600..20753,21004..21182,22273..22455,24101..24233,28200..28342,32351..32395,32931..33055,33348..33429,34477..34576,40855..41021,42089..42220)' |
Exons►
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Literature and cross-references PtroNOx05-B
Literature | Chimpanzee Sequencing and Analysis Consortium. Initial sequence of the chimpanzee genome and comparison with the human genome. Nature 437 (7055), 69-87 (2005). |
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DNA ref. | GenBank: NC_006482.2 (66765372..66807591) |
mRNA ref. | GenBank: XM_001174856 |
EST ref. | GenBank: DC527183.1 [5' end] |
Protein sequence: PtroNOx05-B
Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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Remarks | Complete sequence from genomic (Chromo 15, 16 introns) and 1 EST. Isolate="Yerkes chimp pedigree #C0471 (Clint)". Transcript variant 2 (predicted and confirmed by EST). | ||||||||||||
DNA ► Send to BLAST |
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CDS► Send to BLAST |
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