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Entry information : NtPrx06-1B(Nitab4.5_0113654 / TOBCPI40KB)
Entry ID 61
Creation 2006-06-19 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2011-04-13 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2022-08-10 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NtPrx06-1B(Nitab4.5_0113654 / TOBCPI40KB)
Name NtPrx06-1B(Nitab4.5_0113654 / TOBCPI40KB)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx011]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Nicotiana
Organism Nicotiana tabacum    [TaxId: 4097 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Cell culture
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NtPrx06-1B
start..stop		 S start..stop
NtPrx06-1A 615 0 19..331 17..329
LePrx64 551 0 14..331 10..328
StPrx76 546 0 14..331 10..328
StPrx53 543 0 14..331 10..329
Literature and cross-references NtPrx06-1B(Nitab4.5_0113654 / TOBCPI40KB)
Literature Matsumoto,S., Narita,H., Ikura,K. and Sasaki,R.Nucleotide sequence of cationic peroxidases (Accession No.D42065,D42064) abundantly secreted by cultured tobacco cells Plant Physiol. 110, 713-714 (1996)
Protein ref. UniProtKB:   Q40487
mRNA ref. GenBank:   D42065
Cluster/Prediction ref. UniGene:   Nta.9551
Protein sequence: NtPrx06-1B(Nitab4.5_0113654 / TOBCPI40KB)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   331 (305)
PWM (Da):   %s   35930.38 (33254.9) Transmb domain:   %s   i7-29o
PI (pH):   %s   8.8 (8.91) Peptide Signal:   %s   cut: 27 range:27-331
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGTAQLLLLS NIFLVFLSIV VCGVSGAGNN VPRKNFYKST RCPNAEQFVR DITWSKAKND STLGAKLLRL HYHDCFVRGC DASILLDKVG TDQFEKEARP NLSLGGFDVI DDIKRQVEEK  CPGIVSCADI LALATRDAVS FRFKKSLWDV ATGRKDGNVS LASEVNGNLP SPFSDFATLQ QLFAKKGLNV NDLVALSGAH TIGVAHCGAF SRRLFNFTGK GDVDPSLSST YAESLKQLCP 
NPANPATTVE MDPQSSTSFD SNYFNILTQN KGLFQSDAAL LTDKKSAKVV KQLQKTNAFF SEFAKSMQKM GAIEVLTGNA GEIRKNCRVR N 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and 12 ESTs. Genomic found only in TN90, missing from K326, BX and Edward2017. Cationic peroxidase. Cultivar="Bright Yellow 2".
DNA ►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGAACTG CTCAATTACT GCTACTAAGT AATATTTTTC TTGTTTTTCT TTCTATTGTT GTTTGTGGAG TTTCGGGTGC AGGAAATAAT GTGCCACGCA AGAATTTCTA CAAGAGCACT  CGTTGTCCAA ATGCTGAACA ATTTGTTAGA GATATCACTT GGAGCAAAGC TAAGAATGAC TCCACGTTGG GTGCTAAATT GCTTCGACTC CACTACCATG ATTGTTTCGT TAGGGTACGT  ATACGAATTA GAATTACTAC ATATTATGCA CACGTTAATC TCATAGAATT TATTTTTTAT ACACGAAGAT CTTTTTTATA GTATCACTGT AATTTAATAC TATGTTATAG CATATTATTT  ATCATATTTC TTCTAACATT ATTCATTGGC ATTATTTGCT ATGCAATTTT GCAGGGATGT GATGCATCGA TATTGCTCGA TAAAGTTGGA ACAGATCAAT TTGAGAAGGA GGCCAGGCCA  AACCTCTCCT TGGGTGGTTT CGATGTAATT GATGATATCA AGCGACAAGT TGAGGAAAAA TGTCCTGGGA TTGTTTCTTG TGCAGACATT TTAGCATTAG CTACTCGTGA CGCTGTTTCT  TTTCGAGTAA GTATATAGTA TAAAGAATTC AGTATTCATA TGTATATATA TCTGTACATA ATAAAGCATG CTCTTTAATT ATTTCTTCTT CTCTGAGTTT TGCAGTTTAA GAAATCACTA  TGGGACGTGG CGACCGGAAG AAAAGACGGG AATGTTTCCC TTGCAAGTGA AGTGAATGGA AACTTACCTT CACCATTCTC AGATTTTGCC ACCCTTCAGC AACTGTTTGC AAAGAAAGGC  CTAAATGTCA ATGATCTTGT TGCATTATCA GGTAAAATAT TAATCATACA AAACGAACTG TATGCAGAGG ATTTGAATTT ATGGGTTTTA AGTTTTATGA TAGCAACATC ATATATTAAT  AACTGGATTT TGAATTTAAT TTTTATATAT ATTTACTAGA TTTCTAAATG CAAGTATAAA ATTTTACTAA TGTTACTGGG TTCGGATGAA TTTGTATGTA ACCTTTTATC TTCAACCCTG  ATTGTATAAT GGATTAGTTC ATACATTATC AAGTCCATAA AAAAGTGTGA CTAAATACAC ACTGTGAGTA TATATAAGTT AAATCCCAGA GTAATATACT TCATTCATGC ATGCAGGTGC  TCACACCATT GGTGTTGCTC ATTGTGGAGC TTTCTCTAGA AGACTCTTCA ATTTCACTGG CAAAGGTGAC GTGGATCCAT CTTTGAGTTC CACTTATGCT GAATCTTTGA AACAATTGTG  CCCTAATCCA GCCAACCCAG CCACTACAGT GGAAATGGAC CCTCAGAGCT CAACTTCATT TGACAGCAAT TATTTCAACA TCCTTACTCA GAACAAAGGG TTGTTCCAAT CTGATGCAGC  CCTCCTCACA GACAAAAAAT CAGCTAAAGT TGTAAAACAA CTGCAAAAAA CTAATGCCTT TTTTTCTGAG TTTGCTAAAT CCATGCAGAA AATGGGAGCT ATTGAAGTTC TTACTGGAAA 
TGCTGGAGAA ATCAGGAAGA ATTGCCGCGT CAGAAACTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGAACTG CTCAATTACT GCTACTAAGT AATATTTTTC TTGTTTTTCT TTCTATTGTT GTTTGTGGAG TTTCGGGTGC AGGAAATAAT GTGCCACGCA AGAATTTCTA CAAGAGCACT  CGTTGTCCAA ATGCTGAACA ATTTGTTAGA GATATCACTT GGAGCAAAGC TAAGAATGAC TCCACGTTGG GTGCTAAATT GCTTCGACTC CACTACCATG ATTGTTTCGT TAGGGGATGT  GATGCATCGA TATTGCTCGA TAAAGTTGGA ACAGATCAAT TTGAGAAGGA GGCCAGGCCA AACCTCTCCT TGGGTGGTTT CGATGTAATT GATGATATCA AGCGACAAGT TGAGGAAAAA  TGTCCTGGGA TTGTTTCTTG TGCAGACATT TTAGCATTAG CTACTCGTGA CGCTGTTTCT TTTCGATTTA AGAAATCACT ATGGGACGTG GCGACCGGAA GAAAAGACGG GAATGTTTCC  CTTGCAAGTG AAGTGAATGG AAACTTACCT TCACCATTCT CAGATTTTGC CACCCTTCAG CAACTGTTTG CAAAGAAAGG CCTAAATGTC AATGATCTTG TTGCATTATC AGGTGCTCAC  ACCATTGGTG TTGCTCATTG TGGAGCTTTC TCTAGAAGAC TCTTCAATTT CACTGGCAAA GGTGACGTGG ATCCATCTTT GAGTTCCACT TATGCTGAAT CTTTGAAACA ATTGTGCCCT  AATCCAGCCA ACCCAGCCAC TACAGTGGAA ATGGACCCTC AGAGCTCAAC TTCATTTGAC AGCAATTATT TCAACATCCT TACTCAGAAC AAAGGGTTGT TCCAATCTGA TGCAGCCCTC  CTCACAGACA AAAAATCAGC TAAAGTTGTA AAACAACTGC AAAAAACTAA TGCCTTTTTT TCTGAGTTTG CTAAATCCAT GCAGAAAATG GGAGCTATTG AAGTTCTTAC TGGAAATGCT 
GGAGAAATCA GGAAGAATTG CCGCGTCAGA AACTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GGAAGGAATT GACAAGTTTC TGGGAGGGTT GTATTTGCTA ACTACTACTC GTAGTATGTA TTTTAGGAGT CATATATTAG TGGGGACTTT GTGAAGATAA AGTCGACACA ACCCATAAAC  TAAGGCCAAA ATCATGTGAG CAATTATTTG TATCATCCCA CTAGCTATCG CCTTGCAGCT TTGCCTATAA AAGGAAACTT TCCTTGAAGG GTAAATCCAT TGTGCCTTAA TTCATTTGGT  TTCTCATCAT CTTATTTCTA ATTAGGTTTA AGTCCGTCGA CATTATTGTC TTGTTTTCAT TTCCTAGCAA GGAATAAAAA GAAAATGGGA ACTGCTCAAT TACTGCTACT AAGTAATATT  TTTCTTGTTT TTCTTTCTAT TGTTGTTTGT GGAGTTTCGG GTGCAGGAAA TAATGTGCCA CGCAAGAATT TCTACAAGAG CACTCGTTGT CCAAATGCTG AACAATTTGT TAGAGATATC  ACTTGGAGCA AAGCTAAGAA TGACTCCACG TTGGGTGCTA AATTGCTTCG ACTCCACTAC CATGATTGTT TCGTTAGGGG ATGTGATGCA TCGATATTGC TCGATAAAGT TGGAACAGAT  CAATTTGAGA AGGAGGCCAG GCCAAACCTC TCCTTGGGTG GTTTCGATGT AATTGATGAT ATCAAGCGAC AAGTTGAGGA AAAATGTCCT GGGATTGTTT CTTGTGCAGA CATTTTAGCA  TTAGCTACTC GTGACGCTGT TTCTTTTCGA TTTAAGAAAT CACTATGGGA CGTGGCGACC GGAAGAAAAG ACGGGAATGT TTCCCTTGCA AGTGAAGTGA ATGGAAACTT ACCTTCACCA  TTCTCAGATT TTGCCACCCT TCAGCAACTG TTTGCAAAGA AAGGCCTAAA TGTCAATGAT CTTGTTGCAT TATCAGGTGC TCACACCATT GGTGTTGCTC ATTGTGGAGC TTTCTCTAGA  AGACTCTTCA ATTTCACTGG CAAAGGTGAC GTGGATCCAT CTTTGAGTTC CACTTATGCT GAATCTTTGA AACAATTGTG CCCTAATCCA GCCAACCCAG CCACTACAGT GGAAATGGAC  CCTCAGAGCT CAACTTCATT TGACAGCAAT TATTTCAACA TCCTTACTCA GAACAAAGGG TTGTTCCAAT CTGATGCAGC CCTCCTCACA GACAAAAAAT CAGCTAAAGT TGTAAAACAA  CTGCAAAAAA CTAATGCCTT TTTTTCTGAG TTTGCTAAAT CCATGCAGAA AATGGGAGCT ATTGAAGTTC TTACTGGAAA TGCTGGAGAA ATCAGGAAGA ATTGCCGCGT CAGAAACTAA  TTCTTGAAAA CCTATGATTA ATTTTATGTC ATATATATGT AATCTCTAAA GTGTACAACA TCTGGTATTT AGTTTCTGTC TATTTGTTTC TTTTCCTTTT TGAAAGTGAT GTGTTATTTG 
TGTTGGAAAT GTATTTGACA AATTAACTTA TTTATTAATG TATTTGATCA AAAGGCTCTT TATTTTC 

Retrieve as FASTA