Entry information : LbiKat01 (LbCAT)
| Entry ID | 6529 |
|---|---|
| Creation | 2009-01-30 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2012-04-06 (Catherine Mathe (Scipio)) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Christophe Dunand |
| Last annotation changes | 2012-05-10 (Christophe Dunand) |
Peroxidase information: LbiKat01 (LbCAT)
| Name (synonym) | LbiKat01 (LbCAT) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Catalase [Orthogroup: Kat001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Fungi Basidiomycota Agaricomycetes Tricholomataceae Laccaria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Laccaria bicolor [TaxId: 29883 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
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| Tissue types | Mycelium Sporocarp (fruiting body) |
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| Inducer | Infected host |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '6529' 'join(135733..135856,135907..135965,136020..136349,136401..136580,136638..136751,136804..136953,137012..137360,137415..137540,137596..137753)' |
Exons►
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Literature and cross-references LbiKat01 (LbCAT)
| Literature | Martin,F., et al. The genome of Laccaria bicolor provides insights into mycorrhizal symbiosis. Nature 452 (7183), 88-92 (2008). |
|---|---|
| Protein ref. | GenBank: 6085152 |
| DNA ref. | JGI genome: scaffold_20 (135733..137753) |
| mRNA ref. | GenBank: XM_001889460 |
| EST ref. | GenBank: EX789580.1 [5' end] EX799114.1 [3' end] EX800483.1 [Fragment] |
Protein sequence: LbiKat01 (LbCAT)
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic (8 introns) and 9 ESTs. Strain="S238N-H82". |
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| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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