Entry information : SmAPx02-2_60 (SmAPx02b_60)
| Entry ID | 7204 |
|---|---|
| Creation | 2010-02-10 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2010-02-10 (Christophe Dunand) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Not yet reviewed |
| Last annotation changes | 2011-01-25 (Toky Ramarohetra (Scipio)) |
Peroxidase information: SmAPx02-2_60 (SmAPx02b_60)
| Name (synonym) | SmAPx02-2_60 (SmAPx02b_60) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Ascorbate peroxidase [Orthogroup: APx2003] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Isoetopsida Selaginellaceae Selaginella | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Selaginella moellendorffii [TaxId: 88036 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tissue type | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Inducer | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repressor | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Best BLASTp hits |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '7204' 'complement(join(294207..294437,294511..294613,294676..294755,294819..294901,294970..295018,295076..295141,295207..295256,295307..295431,295482..295594))' |
Exons►
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Literature and cross-references SmAPx02-2_60 (SmAPx02b_60)
| DNA ref. | Phytozome 12: scaffold_60 (295594..294207) |
|---|---|
| mRNA ref. | JGI transcript: 271672 |
| EST ref. | GenBank: FE467531.1 [3' end] |
| Cluster/Prediction ref. | UniGene: Smo.4450 |
Protein sequence: SmAPx02-2_60 (SmAPx02b_60)
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
|
||||||||||||
| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
|
||||||||||||
| Remarks | Complete sequence from genomic (8 introns) and 13 ESTs. ESTs from two varaiants are compiled in the same unigene. | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
|
||||||||||||
| CDS► Send to BLAST |
|
||||||||||||
