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Entry information : NtPrx18-1B(Nitab4.5_0001237g0050)
Entry ID 7239
Creation 2010-02-22 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2011-04-26 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2022-08-23 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NtPrx18-1B(Nitab4.5_0001237g0050)
Name NtPrx18-1B(Nitab4.5_0001237g0050)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx027]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Nicotiana
Organism Nicotiana tabacum    [TaxId: 4097 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NtPrx18-1B
start..stop		 S start..stop
NtPrx18-1A 641 0 1..327 1..327
InPrx84 518 0 1..327 1..327
LePrx46 514 0 1..327 1..322
StPrx08 514 0 1..327 1..322
Literature and cross-references NtPrx18-1B(Nitab4.5_0001237g0050)
EST ref. GenBank:   FS393379.1 [5' end]  AM847206.1 [3' end]
Cluster/Prediction ref. UniGene:   Nta.25851 [5' end]
Protein sequence: NtPrx18-1B(Nitab4.5_0001237g0050)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   327 (301)
PWM (Da):   %s   35687.37 (32779.8) Transmb domain:   %s   i7-29o
PI (pH):   %s   9.54 (9.52) Peptide Signal:   %s   cut: 27 range:27-327
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAFSRHIVVL ILQLMLVPLA FNLCNAQGLK YGFYSKTCPG VESIVRKTTA QFISKAPTLA APLLRMQFHD CFVRGCDGSV MLNSTKNNQA ERDAIPNQSL RGFQVINGVK SALENKCPGV  VSCADIVALV ARDAVSMING PYWKVLLGRR DGRVSIMLEA LTLLPPPFAN ISTLKSQFAS VGLNAKDLVV LSGGHTIGTS HCFAFTNRMY NFTGNGDADP TMDPNYIAGL KLKCSPTDVT 
TLVEMDPGSF KTFDEKYYTL VAKRRGLFQS DSALLDDIET RAYVKRQALT HGKTFFKDFA KSMVKMGKIG VLTGQAGEIR KHCDFVN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and 3 +1 ESTs (FS389410.1, FS389784.1, No overlap between the 3' and 5' => NtPrx 18b has been used as a template). Uncorrect prediction from SGN (splicing errors introns 1, 2 and 3!!!)
DNA ►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTTCT CAAGGCATAT TGTAGTGCTC ATTCTTCAAT TGATGCTTGT CCCTCTTGCC TTTAACCTTT GTAATGCACA AGGCTTGAAA TATGGCTTCT ACAGCAAAAC ATGTCCTGGA  GTTGAATCAA TTGTGAGAAA GACAACTGCT CAATTCATAT CTAAGGCACC AACTCTAGCT GCTCCTTTGC TTAGGATGCA GTTCCATGAT TGCTTTGTTA GGGTATCTTT TTATTTCTCT  CATTTTCTTG CAGCCTCTTT ATTTTTCGAT TTCTCACTCG ATATCTAGTA CTCACATTAT TGGAGATAGA CTAGTCCGGA CTCGCACCGT GTAAGACCCA GAATAGGAGG AAATGCTCCC  TACTAGGGTT TTTTCCTGTA CCAATTAGGG CTCGGATTCG AAACCTCTAG TTAAGGGTAG AAGGATCTTA TCCATCCCAC TGCAACCCTT CGTATTATAG CCTCTATTAT CCATGCTTTA  TGACGAATGA CACTATTCTT TAAGCATACA CTGATTTTTT TTGTATTATT ATTATTGTTG TTGTTGATCT TATTGTTGTT ATTATCATTA TTACTCTCCC CGTTTCATTT ATATGATATT  TTGTAATTCC TTTTACTTTG TTTTAAAAAG AATGACGTGT TTTTATTTTT AAAAACTTTC AAACTTAAAA TTTATAATTG TTGTTAATGA CATGCTCTTG TAGTCATAGA AATATCGTGG  CATGTAATAT GTATCAAAAG TTTTTATTCT TTCTTAAACA ATATGCTTAG TCAAATACCG CTTTTATAAA ATGAAATAGA TAGAAGTATT ATTTTTTATT AGAAAATTGT TATTGGAAAA  GAATGTCTTA TTGACATACA AAATGTTTTT TCAGGGATGT GATGGTTCTG TAATGCTAAA CTCAACCAAG AATAATCAAG CTGAGAGAGA TGCCATTCCA AACCAATCTC TAAGAGGATT  CCAAGTGATT AATGGTGTAA AATCTGCACT AGAAAACAAG TGTCCAGGTG TTGTATCTTG TGCAGATATC GTAGCCTTAG TAGCTCGGGA TGCAGTTTCT ATGGTAAGAT CTCATGATAT  TATTTTTGAT AATCGAAAAA TCTCTGACAG CCAATGGTGC AGTATATAAA CCTCAGTGAA TAATATATAA GTTTGCCTTT TTCCCTTCTT CACTTAAATT CCAGACTTTA TTAATTACTA  CTGTGTTTTA TTACACCAGA GTTGAATTGT TAATTACATT TATATAATTT GATTTTACAG ATTAACGGAC CATATTGGAA AGTTCTTTTG GGAAGAAGAG ATGGGAGAGT GTCAATCATG  TTAGAAGCCT TGACCCTTTT ACCACCTCCA TTTGCTAACA TCTCAACCCT TAAATCACAG TTTGCCTCTG TTGGTTTGAA TGCAAAAGAC CTTGTGGTTC TATCAGGTAA AAATTTTGAC  TTATATATCA ATGTATTTTA ATATGGCGTT ACATATGTTT ACTTGTAATT ATCTTTTTGA TACATGATAT ATATTGTGAT TGAATTCTTT ACATTATCAC TATAAATTAA ACAAGTTAAA  CTCTTTTAAA TATGGTAAGA TATAACACAT ATACTCAGTC TCATTATTTA CTAGACTTGG TCAAATGTAC CAGCTAATTA GGAGCATGAA TGAGCATTGT ACATGTGGTG CATACAAGAA  AAATCCCACT AATTCCGAGA TTATAACGCT CTGGGTAGTT CAAGGTCAAG ATAGTGTTGG TCAACCAATT AATGTGGCGT ATGAGGTAAA ACAATTAGTA GAAAATAATC TAGTTAGGAT  TGTAGCTATG AGTGGTCTAA CGAGAGGAAT GGAAGTGATT GACGCAGGAG CTCCTATAAG TATTCCGGTC AGGGGAGCGA CTCTGCGACG AATTTTAACG TGCTTGGAGA GTCTTGTTGA  TAATTTTTGG ATTGTAGGTT ATACACTTAT ATTAACTTGT ACTATATATA GTTAGTCAAT TTTCAATTAT ATTAGGTTAC TAATTAATGC TTATCATATA ATTTTTCTTG TAATTACTTT  ATAACTCATG ATCTGATTGT GTAAATATTT TTATTATTGT GATCAGGTGG ACATACCATT GGAACTTCCC ATTGTTTCGC TTTCACAAAC AGAATGTACA ATTTCACAGG GAATGGTGAT  GCTGATCCAA CAATGGATCC AAACTACATT GCTGGTTTGA AGCTAAAATG CAGTCCAACT GATGTAACAA CACTTGTAGA AATGGATCCA GGAAGTTTCA AAACTTTTGA TGAAAAATAT  TACACACTTG TGGCTAAAAG GAGAGGGCTT TTTCAGTCTG ATTCTGCACT TCTTGATGAT ATTGAGACCA GAGCTTATGT TAAACGTCAA GCTCTTACCC ATGGTAAAAC GTTTTTCAAA 
GACTTTGCAA AATCTATGGT GAAAATGGGA AAGATTGGTG TCTTGACTGG TCAAGCTGGT GAAATCAGGA AACATTGTGA TTTTGTTAAT TAA 

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTTCT CAAGGCATAT TGTAGTGCTC ATTCTTCAAT TGATGCTTGT CCCTCTTGCC TTTAACCTTT GTAATGCACA AGGCTTGAAA TATGGCTTCT ACAGCAAAAC ATGTCCTGGA  GTTGAATCAA TTGTGAGAAA GACAACTGCT CAATTCATAT CTAAGGCACC AACTCTAGCT GCTCCTTTGC TTAGGATGCA GTTCCATGAT TGCTTTGTTA GGGGATGTGA TGGTTCTGTA  ATGCTAAACT CAACCAAGAA TAATCAAGCT GAGAGAGATG CCATTCCAAA CCAATCTCTA AGAGGATTCC AAGTGATTAA TGGTGTAAAA TCTGCACTAG AAAACAAGTG TCCAGGTGTT  GTATCTTGTG CAGATATCGT AGCCTTAGTA GCTCGGGATG CAGTTTCTAT GATTAACGGA CCATATTGGA AAGTTCTTTT GGGAAGAAGA GATGGGAGAG TGTCAATCAT GTTAGAAGCC  TTGACCCTTT TACCACCTCC ATTTGCTAAC ATCTCAACCC TTAAATCACA GTTTGCCTCT GTTGGTTTGA ATGCAAAAGA CCTTGTGGTT CTATCAGGTG GACATACCAT TGGAACTTCC  CATTGTTTCG CTTTCACAAA CAGAATGTAC AATTTCACAG GGAATGGTGA TGCTGATCCA ACAATGGATC CAAACTACAT TGCTGGTTTG AAGCTAAAAT GCAGTCCAAC TGATGTAACA  ACACTTGTAG AAATGGATCC AGGAAGTTTC AAAACTTTTG ATGAAAAATA TTACACACTT GTGGCTAAAA GGAGAGGGCT TTTTCAGTCT GATTCTGCAC TTCTTGATGA TATTGAGACC  AGAGCTTATG TTAAACGTCA AGCTCTTACC CATGGTAAAA CGTTTTTCAA AGACTTTGCA AAATCTATGG TGAAAATGGG AAAGATTGGT GTCTTGACTG GTCAAGCTGG TGAAATCAGG 
AAACATTGTG ATTTTGTTAA TTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GAACATTGGG AAATAGAGAA AAATAAATCA ACTTTATTTC CTACTTCTAA CAATACAATG GCTTTCTCAA GGCATATTGT AGTGCTCATT CTTCAATTGA TGCTTGTCCC TCTTGCCTTT  AACCTTTGTA ATGCACAAGG CTTGAAATAT GGCTTCTACA GCAAAACATG TCCTGGAGTT GAATCAATTG TGAGAAAGAC AACTGCTCAA TTCATATCTA AGGCACCAAC TCTAGCTGCT  CCTTTGCTTA GGATGCAGTT CCATGATTGC TTTGTTAGGG GATGTGATGG TTCTGTAATG CTAAACTCAA CCAAGAATAA TCAAGCTGAG AGAGATGCCA TTCCAAACCA ATCTCTAAGA  GGATTCCAAG TGATTAATGG TGTAAAATCT GCACTAGAAA ACAAGTGTCC AGGTGTTGTA TCTTGTGCAG ATATCGTAGC CTTAGTAGCT CGGGATGCAG TTTCTATGAT TAACGGACCA  TATTGGAAAG TTCTTTTGGG AAGAAGAGAT GGGAGAGTGT CAATCATGTT AGAAGCCTTG ACCCTTTTAC CACCTCCATT TGCTAACATC TCAACCCTTA AATCACAGTT TGCCTCTGTT 
GGTTTGAATG CAAAAGA 

Retrieve as FASTA