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Entry information : NtPrx13-1B(Nitab4.5_0002731g0010 / Nitab4.5_0015635g0010 / NtPOX1)
Entry ID 7250
Creation 2010-02-24 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2010-02-24 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2022-08-23 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NtPrx13-1B(Nitab4.5_0002731g0010 / Nitab4.5_0015635g0010 / NtPOX1)
Name NtPrx13-1B(Nitab4.5_0002731g0010 / Nitab4.5_0015635g0010 / NtPOX1)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx055]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Nicotiana
Organism Nicotiana tabacum    [TaxId: 4097 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NtPrx13-1B
start..stop		 S start..stop
NtPrx13-1A 706 0 1..360 1..360
NtPrx27-1B 589 0 1..360 1..358
NtPrx27-1A 580 0 1..360 1..358
StPrx72 558 0 1..360 1..363
Literature and cross-references NtPrx13-1B(Nitab4.5_0002731g0010 / Nitab4.5_0015635g0010 / NtPOX1)
Protein ref. UniProtKB:   Q50LG5
mRNA ref. GenBank:   AB178953
EST ref. GenBank:   EH618395.1 [5' end]  EB443136.1 [3' end]
Cluster/Prediction ref. UniGene:   Nta.19809  Nta.2015
Protein sequence: NtPrx13-1B(Nitab4.5_0002731g0010 / Nitab4.5_0015635g0010 / NtPOX1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   360 (340)
PWM (Da):   %s   38609.44 (36517.2) Transmb domain:   %s   i7-29o
PI (pH):   %s   7.89 (7.60) Peptide Signal:   %s   cut: 21 range:21-360
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAFRLSHLSL ALSLLALALA GVAIYRNTYE AMSKGFQTLS PELDLLESAA SILTLNNNNA EQNSDSKLTQ PLSPSACIFS AVRRVVNRAI DRERRMGASL IRLHFHDCFV DGCDGGVLLD  DIPGSFQGEK TSPPNNNSAR GFEVIEQAKQ RVKDTCPNTP VSCADILAIA ARDSVVKLGG QGYNVALGRR DARAANFTGA LTQLPAPFDN LTVQIRKFND KNFNAREMVA LAGAHTVGFT  RCATACNSNN VNPAARLQCN CSVTQNDTNL QQLDRTPAVF DRVYFQDLNR NQGILFSDQV LTGNTTTAAI VTTYSNNGAV FLGDFAAAMI KMGNLPPSPG VQLEIRDVCS RVNPSSVASM 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and ESTs (FG149240.1, FG162851.1, EH618059.1, EH623632.1, EH623597.1) and GSS. Cultivar="K326". Found in contig and 1 scaffolfd (12.5 kb)
DNA ►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTTTC GTTTGAGTCA TTTGAGCCTT GCCCTGAGCC TTTTGGCTCT TGCACTTGCA GGTGTTGCCA TTTATAGGAA CACTTATGAA GCCATGAGTA AGGGATTCCA AACACTTTCT  CCAGAGTTAG ATCTGCTGGA GTCAGCAGCC AGCATTTTAA CCCTAAATAA TAATAATGCT GAGCAAAATT CAGACAGCAA GTTAACTCAA CCATTATCTC CATCGGCATG CATCTTCTCT  GCTGTTCGAC GAGTTGTTAA CAGAGCCATT GATAGAGAAA GACGCATGGG AGCTTCTCTC ATTCGTCTCC ATTTCCATGA CTGCTTTGTT GATGTAAATT CCTTCACTCT TTCTTCTGCT  CTCGCATTCT TTACTCTCTC TGCCGTATTT AATTACTTTA AAAGAACAAC AAAGAAAAGA AAAAGAATCA ATAAAAGGCA GTTTTTTTTT CGTCAAATGT TTTCCTAAAT TTATCAATCT  TTAAAGGTTT AATGGGATAT AAGGAGTTTT TCACAACTGT CGAAACCAAG AATTTCTCCA TGAGTGTTTG AGATTTCCTA CGAGGAAGGT TGTCCAACTG ATTGTACGTC CGCCCCTACC  AAGGCCGTAA TTAACTTATA ATGCATGAAC CAAAGTAATG TCAAAACAAT TTATTTACAT ATGATAAAAA TTAAAGTTGT TGTCCTAGCT AGTATTTAAT CAATCAAAAA GCACTTATAT  CATTTTAGTA TTATATTATG AGAAATGTTT GCTATTACGA TTTTTTTTTT TTCGGGGGGG GGGGGGGnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnTACAACTA GTGGAGTAGT TGGAAAAGTC  TATTCTGCTT CTTTTTTAGG TTGCCTTCCA ATTCTTGTTT GTCGCTGTCA CTTAAGTAGC TTTTTCCTAT AAAAAAAATA CTTGGGTAGC TTGAATAAAC TTTAAGAAAA TAAAGAAAAA  CTGCTCAAAC TTTAAATATT TGTGTAGCTC TAAATCATCT CATAGCAATA AAATAAAAAG ATTTAAATTA AATTATTATC AAAATTAGAA AATTGTGATT CATTTTAGGA TAGACTAATA  AGGAATATTG ACATATAAAG TAGAATGAAG GGACTAGCTT TCTCCTATTT TACCCCTGGA CAAAGCTTTG TCATGCTTTT CCAATTTTTA TATGCCTGCG TTCTCATTAT TCTCATCCGG  ACTATCTATC TATGCTCATG ACCGAGCTTC CATTTCTTCT TTCAGCTTAT CTAGCCATAA AACTTCATTT TCATTAACCA TAAAGCAAGA TTAAGGTTCA TTTTACATCA ATTCACGTAA  TCTAGTTCAT TTATAATTTT AAAACATATT CTACTCATGA AGTGATGATT ATGGTTGACT AATAGCTACA TGGTTATTAA CAGGGTTGCG ATGGAGGAGT TCTTCTAGAC GATATTCCCG  GATCATTCCA AGGGGAAAAG ACCTCACCAC CCAACAACAA CTCAGCCAGA GGTTTTGAAG TCATAGAACA AGCTAAACAA AGAGTAAAAG ATACTTGTCC CAACACGCCT GTATCTTGCG  CAGACATCTT AGCTATTGCT GCTCGTGATT CTGTTGTTAA AGTAAGTTCA TTAATTTTCT ATCTGTAACG TACCAAATTT TACTTTAACG ATTATTTACC ACCACCCAAA TTCCACCCCC  ATGGTTTTGG GGTATAGAGT TTCTGTTCGC TACACAAGAC AGCGAAACCA ATTTTATATT ACTAGATTAA GAGTTGCCTT CCACCAACAG TAAGGTATGT CAATACTTTG ACAATCAGGA  CTTATTTTGC AATAAAAAAA GCAAATTAAT TGTTTAACAA AAAATTGAAT TATTAGGCCA GCAATTAAAT ATACATTATC AGCAAAAACT ACCTTAAAGA TTTCAATTAT ATACACACAT  AATATTAAAG ATTTTTGCAC GATCAATGAA TTTTAATATA TAATAGTAGG TTTATTGCAA CTTTTGTAAT TATGTTACTA TTACTCCATC GCTTCATCTT ACGTGAACTT GCGGAGTTTA  ACAAAGAAAT ACTTTTGGAA TTATGTTTTT AAACATGTCA TGATACTTTT GGAATTATGT TTTTAAATAT GTCATTAAGA ATAAAATAAA TAAATTAAAG TCAAGTTATT TTTAATATAG  AAATATATTA TTTTTTAATA ATAAATTAAT AGTAAGAAAA TAGTATCACA TAAATAAAAT AAGGGAATAA CTTAAAAGTC TGTTGTGTAT TTGACAGCTA GGAGGACAAG GCTATAACGT  TGCACTTGGG AGAAGAGATG CAAGAGCGGC CAACTTCACT GGTGCTTTAA CTCAGCTTCC AGCTCCGTTC GACAATCTAA CCGTCCAAAT AAGAAAATTT AATGACAAAA ACTTTAATGC  CCGGGAAATG GTGGCGCTAG CCGGTGCCCA CACGGTGGGT TTCACCAGGT GCGCCACCGC GTGCAACAGC AACAACGTTA ACCCAGCGGC ACGTCTTCAA TGCAACTGCT CCGTCACCCA  AAACGACACC AACTTGCAAC AACTGGATAG AACTCCTGCA GTGTTCGACA GAGTTTACTT CCAGGACTTA AACAGGAACC AGGGTATACT TTTCTCGGAT CAAGTGTTGA CGGGGAATAC  CACCACTGCT GCTATTGTTA CAACCTACAG CAATAATGGT GCTGTTTTTC TTGGAGATTT TGCTGCTGCT ATGATCAAGA TGGGGAACTT GCCTCCCTCA CCGGGCGTTC AATTGGAAAT 
TCGTGATGTT TGCAGCAGGG TCAATCCCAG CTCTGTGGCT TCTATGTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTTTC GTTTGAGTCA TTTGAGCCTT GCCCTGAGCC TTTTGGCTCT TGCACTTGCA GGTGTTGCCA TTTATAGGAA CACTTATGAA GCCATGAGTA AGGGATTCCA AACACTTTCT  CCAGAGTTAG ATCTGCTGGA GTCAGCAGCC AGCATTTTAA CCCTAAATAA TAATAATGCT GAGCAAAATT CAGACAGCAA GTTAACTCAA CCATTATCTC CATCGGCATG CATCTTCTCT  GCTGTTCGAC GAGTTGTTAA CAGAGCCATT GATAGAGAAA GACGCATGGG AGCTTCTCTC ATTCGTCTCC ATTTCCATGA CTGCTTTGTT GATGGTTGCG ATGGAGGAGT TCTTCTAGAC  GATATTCCCG GATCATTCCA AGGGGAAAAG ACCTCACCAC CCAACAACAA CTCAGCCAGA GGTTTTGAAG TCATAGAACA AGCTAAACAA AGAGTAAAAG ATACTTGTCC CAACACGCCT  GTATCTTGCG CAGACATCTT AGCTATTGCT GCTCGTGATT CTGTTGTTAA ACTAGGAGGA CAAGGCTATA ACGTTGCACT TGGGAGAAGA GATGCAAGAG CGGCCAACTT CACTGGTGCT  TTAACTCAGC TTCCAGCTCC GTTCGACAAT CTAACCGTCC AAATAAGAAA ATTTAATGAC AAAAACTTTA ATGCCCGGGA AATGGTGGCG CTAGCCGGTG CCCACACGGT GGGTTTCACC  AGGTGCGCCA CCGCGTGCAA CAGCAACAAC GTTAACCCAG CGGCACGTCT TCAATGCAAC TGCTCCGTCA CCCAAAACGA CACCAACTTG CAACAACTGG ATAGAACTCC TGCAGTGTTC  GACAGAGTTT ACTTCCAGGA CTTAAACAGG AACCAGGGTA TACTTTTCTC GGATCAAGTG TTGACGGGGA ATACCACCAC TGCTGCTATT GTTACAACCT ACAGCAATAA TGGTGCTGTT  TTTCTTGGAG ATTTTGCTGC TGCTATGATC AAGATGGGGA ACTTGCCTCC CTCACCGGGC GTTCAATTGG AAATTCGTGA TGTTTGCAGC AGGGTCAATC CCAGCTCTGT GGCTTCTATG 
TGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CGGGGAGTCA TTTGAGCCTT GCCCTGAGCC TTTTGGCTCT TGCACTTGCA GGTGTTGCCA TTTATAGGAA CACTTATGAA GCCATGAGTA AGGGATTCCA AACACTTTCT CCAGAGTTAG  ATCTGCTGGA GTCAGCAGCC AGCATTTTAA CCCTAAATAA TAATAATGCT GAGCAAAATT CAGACAGCAA GTTAACTCAA CCATTATCTC CATCGGCATG CATCTTCTCG GCTGTTCGAG  GAGTTGTGAA CAGTGCAATT GATAGAGAAA GGCGCATGGG AGCTTCTCTC ATTCGTCTCC ACTTCCATGA CTGCTTTGTT GATGGTTGCG ATGGAGGAGT TCTTCTAGAC GATATTCCCG  GATCATTCCA AGGGGAAAAG ACCTCACCAC CCAACAACAA CTCAGCCAGA GGTTTTGAAG TCATAGAACA AGCTAAACAA AGAGTAAAAG ATACTTGTCC CAACACGCCT GTATCTTGCG  CAGACATCTT AGCTATTGCT GCTCGTGATT CTGTTGTTAA ACTAGGAGGA CAAGGCTATA ACGTTGCACT TGGGAGAAGA GATGCAAGAG CGGCCAACTT CACTGGTGCT TTAACTCAGC  TTCCAGCTCC GTTCGACAAT CTAACCGTCC AAATAAGAAA ATTTAATGAC AAAAACTTTA ATGCCCGGGA AATGGTGGCG CTAGCCGGTG CCCACACGGT GGGCTTCACC AGGTGCGCCA  CCGCGTGCAA CAGCAACAAC GTTAACCCAG CGGCACGTCT TCAATGCAAC TGCTCCGTCA CCCAAAACGA CACCAACTTG CAACAACTGG ATACAACTCC TGCTGTGTTC GACAGAGTTT  ACTTCCAGGA CTTAAACAGG AACCAGGGCA TACTTTTCTC GGATCAAGTG TTGACGGGGA ATACCACCAC TGCTGCTATT GTTACGACCT ACAGCAATAA TGGTGCTGTT TTCCTGGGAG 
ATTTTGCTGC TGCTATGATC AAGATGGGAA ACTTGCCTCC CTCACCGGGC GTTCAATTGG AAATTCGTGA TGTTTGTAGC AGGGTCAATC CCAGCTCTGT GGCTTTTATG TG 

Retrieve as FASTA