Entry information : SmRboh02-1_19 ( SmRboh02a_19)
Entry ID | 7386 |
---|---|
Creation | 0000-00-00 (Christophe Dunand) |
Last sequence changes | 2016-02-10 (Christophe Dunand) |
Sequence status | complete |
Reviewer | Achraf Jemmat |
Last annotation changes | 2016-02-10 (Achraf Jemmat) |
Peroxidase information: SmRboh02-1_19 ( SmRboh02a_19)
Name (synonym) | SmRboh02-1_19 ( SmRboh02a_19) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Class | Respiratory burst oxidase homolog [Orthogroup: Rboh002] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Taxonomy | Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Isoetopsida Selaginellaceae Selaginella | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism | Selaginella moellendorffii [TaxId: 88036 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular localisation | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue type | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Inducer | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Repressor | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Best BLASTp hits |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '7386' 'complement(join(1121348..1121457,1121535..1121613,1121685..1121813,1121866..1122267,1122328..1122430,1122528..1122643,1122725..1122820,1123058..1123444,1123960..1124373,1124479..1124592,1124646..1124694,1124761..1124923,1125004..1125218,1125315..1125374,1125474..1125724))' |
Exons►
|
Literature and cross-references SmRboh02-1_19 ( SmRboh02a_19)
DNA ref. | Phytozome 12: scaffold_19 (1125724..1121348) |
---|---|
mRNA ref. | JGI transcript: 97417 |
Protein sequence: SmRboh02-1_19 ( SmRboh02a_19)
Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
|
||||||||||||
Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
|
||||||||||||
Remarks | Complete sequence from genomic (14 introns). No EST. | ||||||||||||
DNA ► Send to BLAST |
|
||||||||||||
CDS► Send to BLAST |
|
||||||||||||
cDNA► Send to BLAST |
|