Entry information : BfPOX01 ( TPO-like)
Entry ID | 7614 |
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Creation | 2010-09-22 (Marcel Zamocky) |
Last sequence changes | 2016-02-09 (Christophe Dunand) |
Sequence status | complete |
Reviewer | Achraf Jemmat |
Last annotation changes | 2016-02-09 (Achraf Jemmat) |
Peroxidase information: BfPOX01 ( TPO-like)
Name (synonym) | BfPOX01 ( TPO-like) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Class | Non mammalian vertebrate peroxidase [Orthogroup: POX001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Taxonomy | Eukaryota Metazoa Chordata Branchiostomidae Branchiostoma | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism | Branchiostoma floridae (Florida lancelet) (Amphioxus) [TaxId: 7739 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular localisation | N/D |
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Tissue type | Testis |
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Inducer | N/D |
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Repressor | N/D |
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Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '7614' 'complement(join(1156343..1156378,1157462..1157618,1158189..1158288,1159792..1159917,1160392..1160562,1161037..1161239,1161478..1161673,1161797..1161944,1162386..1162526,1163285..1163415,1164207..1164453,1164794..1164905,1165840..1165994,1166202..1166304,1166493..1166617,1167217..1167518,1172002..1172077))' |
Exons►
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Literature and cross-references BfPOX01 ( TPO-like)
Literature | Putnam N.H., et al. (2008) The amphioxus genome and the evolution of the chordate karyotype. Nature 453:1064-1071 |
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Protein ref. | UniProtKB: C3YBC9 |
DNA ref. | GenBank: GG666497.1 (1172077..1156343) |
mRNA ref. | GenBank: XM_002606230 |
EST ref. | GenBank: BW706337 [5' end] |
Protein sequence: BfPOX01 ( TPO-like)
Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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Remarks | Complete sequence from genomic (16 introns) and 1 EST. Strain="S238N-H82" |
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DNA ► Send to BLAST |
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CDS► Send to BLAST |
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