Entry information : CintPxd01
Entry ID 7647
Creation 2010-10-21 (Marcel Zamocky)
Last sequence changes 2016-02-02 (Achraf Jemmat)
Sequence status complete
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2016-02-02 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CintPxd01
Name CintPxd01
Class Peroxidasin    [Orthogroup: Pxd001]
Taxonomy Eukaryota Metazoa Chordata Ascidiacea Cionidae Ciona
Organism Ciona intestinalis    [TaxId: 7719 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CintPxd01
start..stop
S start..stop
SpurPxd01 1043 0 65..1635 20..1411
PretPxd01 986 0 117..1638 7..1434
PretPxd01 466 1.96e-138 65..709 3..640
MdoPxd02 949 0 343..1639 310..1470
MdoPxd02 421 1.68e-122 32..609 99..674
AaePxd 939 0 32..1637 33..1432
Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '7647' 'join(151..341,8095..8166,9751..9822,10865..10936,12136..12207,13519..13587,13945..14135,14590..14707,14891..14973,15550..15668,15844..15964,16136..16243,16549..16710,17068..17175,17313..17429,17798..17975,18261..18394,18666..18782,19147..19257,19542..19646,19988..20081,20252..20436,20805..20955,21120..21257,21544..21779,22022..22203,22637..22802,23236..23351,23594..23746,24155..24303,24650..24782,25232..25438,25783..25943,26501..26736,27079..27380)' Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 151..341 189 N° 2 8095..8166 70 N° 3 9751..9822 70 N° 4 10865..10936 70
N° 5 12136..12207 70 N° 6 13519..13587 67 N° 7 13945..14135 189 N° 8 14590..14707 116
N° 9 14891..14973 81 N° 10 15550..15668 117 N° 11 15844..15964 119 N° 12 16136..16243 106
N° 13 16549..16710 160 N° 14 17068..17175 106 N° 15 17313..17429 115 N° 16 17798..17975 176
N° 17 18261..18394 132 N° 18 18666..18782 115 N° 19 19147..19257 109 N° 20 19542..19646 103
N° 21 19988..20081 92 N° 22 20252..20436 183 N° 23 20805..20955 149 N° 24 21120..21257 136
N° 25 21544..21779 234 N° 26 22022..22203 180 N° 27 22637..22802 164 N° 28 23236..23351 114
N° 29 23594..23746 151 N° 30 24155..24303 147 N° 31 24650..24782 131 N° 32 25232..25438 205
N° 33 25783..25943 159 N° 34 26501..26736 234 N° 35 27079..27380 300  
join(151..341,8095..8166,9751..9822,10865..10936,12136..12207,13519..13587,13945 ..14135,14590..14707,14891..14973,15550..15668,15844..15964,16136..16243,16549.. 16710,17068..17175,17313..17429,17798..17975,18261..18394,18666..18782,19147..19 257,19542..19646,19988..20081,20252..20436,20805..20955,21120..21257,21544..2177 9,22022..22203,22637..22802,23236..23351,23594..23746,24155..24303,24650..24782, 25232..25438,25783..25943,26501..26736,27079..27380)


exon

Literature and cross-references CintPxd01
DNA ref. GenBank:   NC_020172.2 (2420264..2448155)
mRNA ref. GenBank:   XM_002121514
EST ref. GenBank:   BW430040.1
Cluster/Prediction ref. Genebank:   100185463
Protein sequence: CintPxd01
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   1642 (1617)
PWM (Da):   %s   184165.42 (181403.9)  
PI (pH):   %s   8.09 (8.02) Peptide Signal:   %s   cut: 26 range:26-1642
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MWIKRTLTLCVAFAILVNLDGTCKAQSPEHRACPSGCLCFVTTVR
CMHRRRDTIPQVAPETRV
LDMRFNRIRSIPASTFRRMRNLNSLLLNNNEIQSISENAFRGLSSLKYLYLYKNKIRTIHKRAFNGLVSLEQLYLHDNKIVTVPSGTFATLPKLERLLLHSNLIETLPNRLFDDLTLKRL
RLDGNRLRCDCDLAWLATYLQGPGRSVLATAVCYQPRSLSGRHIPTIQPSEFQCSDTNNSTY
IAPIFYEMPEDVEVQQGESVIFRCGVRGSPRPLITWHHDGTPVRLDTRVRKSTDGSLV
IQTSRQSD
GIYKCTADNTVGHRSSSVARLTYRGAQGPPVFTTVPSNKVILNGRVTFQCRSTGTPEPVTRWYHNHERLPVTPNFIVMPGTLHIRSASIENNGTYTCMAANSEGFINSSATL
IVR
NPPKFTVKPQDQTAIQGRSVTLDCHAEGIPEPTLSWLRNGHTLNRDQRYLVMTSGSLLIRGVNPGDEGTYTCKAESNAGVSTSDAFVTIMVPPRFTVRPQNQRVRQGLTVDFQCQVA
GRPQPQIVWTIN
GRAVPDDPRYSLLPSGTLRLLRAQPEHAGNYRCEAANAVGAQHAQVSLTVIPPTPLSFVRTPEDQTVDAGTDVTIRCHVTGGGVDDETAPNIYWTKDNVRLTTGRFSI
SRSSLSELLIRQVARDDTGRYECVARSGSDFISA
SMTLVVNLRNTVKDIVVKLAQILPADCLLHGCPDELDQSSHSSHDEEQSPLSLDELLNQHFLASASRQKRQSVVHLSELYDTIQSA
TNEVNRGINNSIQHFNN
GRNRQSPGDLLALVRFPSTRAGVDLARAAEVFDVALRMIECCVRRGMRPRDFDVRHTKDRQGDGPASLDGDEEMDVMSLIGSEAVELVANLSGCSAHRPNIDC
SRDICFHR
KYRSPDGTCNNLHHPMWGASLTPFHRLLQPIYENGFNAPISWNNNKKYNNNTLPSPRSVSVGVLMSAGSRPPRKDPDFTHMVMQWGQFLDHDLDFTTMAPSVQRFSDGLACK
DTCEHEAPCFPI
VDNDSRHSRFHHHPPSPRRHGRQHPHGSGRCMTFTRSSAVCGSGITSVFFSAISRREQINITSYLDASNVYSSNDKEMRNLRDFSSDLGLLKEGQSLELGQKPLLPYN
VYSDLES
GSNSIQLVAPLDCFRGEGETARQRSVPCFLAGDLRANEVSLTTMHTLWMREHNRIARYIKQVNQHWDGDTIFHETRKIIGAQMQHITYTHWLPKLLGPFTSLIGEYRGYDPNL
PSSIVNVFATAAYRFGHTMINPIMY
RLNETWHESRYGNLNLHEAFFAPFRIVHEGGIDPLIRGLIAKPMARDSDSNMNEELIERLFSMAEEVALDLGALNIQRGRDHALPFYNEWRQFCN
LSSATTFDDLATEIKNPE
VRNKLRELYKVPANIDPFVGMIVEDVVPGSRLGPTLACLLTEQFKRTRAGDRFWYENPGIFSPTQVNALKQASLARVICDNTDSIKTVPRDVFLNQPQADFV
SCDEIPSIDLSAWIDCCSDCSDSGSFETL
DHFQRRSRSKRSTNKRHSHRNINNSSNTNQPWDNPLTPSPPLQNEPRLRVGVKKMNKIEPEGIPSASMDKVLSVIEALESKISQLQGQVQT
LEQKLQDRD

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete from genomic (chromo 7, ) and 15 ESTS.
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGTGGATTAAAAGGACACTGACTCTGTGCGTTGCTTTCGCTATATTGGTAAATCTTGATGGTACATGCAAGGCGCAGAGCCCAGAACACCGCGCTTGCCCCTCTGGATGTCTGTGCTTC
GTAACAACTGTCCGATGCATGCATCGAAGGCGAGACACCATCCCACAAGTCGCACCCGAGACCAGAGTCCT
CTGTGAGTAAAATTCAATGTTACATTTAGGTGCATAAAATATGAATTTT
TGGTCAGTGTGGATACAAACAATACGCAGCCTATGTTTGATACGATTACCGCAATGGTTATCGCATTTCAAAGTATATCACTGAAATTGATTTAAATTTCTAAACCTCATTTAGAGAATA
TATGTGTCGCGGCATGTATAATTCATGTTTCTACTACTAAGCATTCGATTACAAGTTTCCACGACTTATACACGGATAATCCATCATAAGAAACATCTTCGCTTCGTCTGTTTCACTTGT
TTACTTAGTCTACAAACATAAACCGGTGGAGTGTTAGGACCTATAATTTTACCAATATACACAAATCGTGTATTCTATTGTATATTTTGAGTCGAGATTACCAAGTTGGACTGGTTGTTT
TGAAGACTTTGTTGACCTTTACAGGCATATAAACTGTTCACAGTAACGTAGATTGCGTGCAAAGTAATATCCTACTGTGAAATATCGTTCTTGTGCGATCTTTACAACTGAAAACATAAC
TTGCGTTAAAGTAAACATCACTCGAACTCGCATAACCTATGAAAGCTACGGAGTCTTATTATTATAACAATATATCCATCTTTGCCGAAGACTTTGCCGTTTTATAAGCAGGTTTAATAT
CGTGGTTATGGTTTGTTTACTTTTCGTTTGCAGCTTGAATTTAAAGAGCTATGGAACTCTAAAGTTGAATAATATAGTTACACCCAAACCTGGGTTTTGTTGGTTTAGCGAAATTACTAG
TTCTACTCGCGAGTGGTGGTACGGCTTGGTTTACAATGAGTCACAAGCCGAAGAGAGGCCTGGTATTATATTCGAACTTACCTTCAATCTCTCGGCTTTGTTTCTTGAGTGTTGTACAGC
CCTTGGGAAACCATAGATAGCGCTTGGCAAGCGTTAAGTCCGAAGCAGATTTAGTCCCAATGAAGGACCCGAACTAATCAACGTAATGGATTGAAAAGTTTAAAATTAACGATCACACAC
GATAAGCAAATCCGCTGCGGCGCTGTTGTGTCTATCCCTGGTTTAGTTTTGGGTTTAGGTCAATTAGACCTGTATTTTCTTGTTAGGTGTGTTGGAGCGTGAGTAAACGGTATAAACTAT
ATATACGAGAGTTGCGGGAATTACCTTATCGTTTAGCAATGCATCACATAGCAACGGACATGTTGCATTTGTTATTTTCGAGCAGCAACAACATAACCGTTTATTCCCAAGAGATTTAGC
ATGGTAATTAAATACTTTACCACGGGGATAGATCCTGGTTACTTTACCACATACTTGAACGTGTATACAATGCGCACAGAACCCCACACGTCGAAAATGCAAAGATAATCATTAATTTGA
TTTTTACCTAACCATAGAGTGATAATTTACAAACAGAAAACAGAATAACAGTTATAGTAGGGTTGGGAAGATGGGATACCTTATTCTATTCTGCGTCGCATTTGGTAGTAAACAAAGAAC
ACTCAAAGAATGTTTAATACCGTATATCCTATAAACCGTTGATAATTGTTTAAAACACAATCAGGATATTTTGATATTAGGTGCTAAAGGTATCATATATCTTACCCCACAGTACTGTAG
TATATAGGGTGGGGGAAGATGGGACACCTTTTATTCGATTTTTCGTCCCATTTGGTAGTAAAGAAAAAAACATTTAAAGAATAATAAAACTGTATCCTCACAACTCCCATAGACCGCTGT
TAACTGTTTAAAACATATTTGGATGCCATGTGCTAAAGGTATCCCGTCTCCCTCCATTCTTCTATATATATATTATATCCACTGCGGTTGCGCGTCACACCGCATTGATATAACGCATGG
AATTCAATTAATTGGAGTTTTTGCGCCACCGTACATATACTGTGACTATTAGAGACCATGTACAGACTTGAGAGCCGGGGTCTCCTTATTAGACTTCGTGTTTAAAGCCATACATTGTTA
TACAGACCACACCTGTTGAATAATTACGTGGGTTGGCTCCAATAATCCAATGCCAGGAACACGGTTAACTTGGAATAGAAAGCATAGCTTCTATACACCCTCCATGGACCATGTATTAAT
ACTTAGGTTACCGAAGAAGCTGGAACGTCTGCCGTATGCATTCAGAGTCAGTCATGTTACAAGGCACGAGTCATTGACATAGTCTCTCGCTACGTCACAGGTCCAGCACTTTATACTGAC
ATGGTGGGAACATGTATGTCTCGTGTTTGTGGCAGGCGTAATCTTATCCCTGAGGACCCTTTGTTTGAAAGTTCGTGGGAATATTTCACACTGGGTTGAAATTCCAGCTTCGTTTTGCAA
GGGTTTGACCTATAGACGACTTAATTGGTTACAGGTCAATAATTGAAACATACACTTTCATATAACAAAAGTTCTGTAAGTCGCTAACTATGTTTTAACCACTGTATGCAATGCCTGTTA
GTTCCCAGTTTACATTGGGAAAGCGCTATATTGTCAAACCCCAGGCACCTTACTTTCTCAACGCTGCGTCTTTGTTTGTGTAAAATAAATGCAGTGTGTTCATATTTTTCTGTAGAATGT
GTTACAGCACTGTTTTTCTCCGCGTCACAGCGTTGCATTGGTAAAGTAATTGAATATTAAACAGTGACGCGAAAAAGGAAATTGTTTTATTACAAAAATAATTTATTACAAATTACAAAG
TATTTCCGAGTTAGTAAAGTTTGAAGTGAAACGTGTAAGGTTTACATTACAATTAGGACAATGTATTTAAGTTATTGGCAGGCTTCATGTATATTCAGTTTAAATTTGTAAACCTTTGCT
TGTGAACTAAACCAACGTTGGTTGAACGGCTAGAGTTCTACCTTGCTGATAACAATCCTTTCCCCACTTAAAAGGTTGTTTCTGACCTACTTTTGATCACAAGAAACAAATTTGAATGTA
AACACCCCGACACTTGTGAATTACCACAGACGCATTGAGGCCCCCGGCGGTTTTTTTTCGCGACAATTTACTGTCATGGCATTTTGTACCACGTATTACTCGTGGTATAAATCATTATAA
AACTGCTGTAACAATATTTTCGCCAATCGCGGGCGATTGTATATATATCCTGTTACGTTGTATGAAGTAGAATAAAACACAAACATAGTTTACTTAATAATTTGCTATGCTTATTGTCAA
AAGGGAAATTGCATCTGATATTTCAAGTTTTCGTTTATCGTTTTGCAATTAAAAGTCAAACGGTCATAAAATTCACTTTAATCGATTATTTAAGTGTTTTATAAAAGAAGTGTATATATA
AATTGTAGAAGTGTCTATGGTTAGTATTTCTTATTTAAAGGAATTATTGTAAAGTTGTTTTAAATTTGTGGGCTAATTAAATTTTCGTCGTTTATAGGTATCTCTTAATTTCTATATTGA
AATAATAATATATAGTAGGGTAGGGGAAGATGGGATACCTTTAGCACATAATATACAAATATCATGATCGTGTTTTTTTTAAATTAACAACGGTCTATGGGAGTCGTGAGGATAAAGTTT
TATGATTCTCTGAATGTTCTTTGTTTACTACTAAACGAGACGAGAAAATGGAGTTAAAAGGTGTCCCATCTTCCCCCACCCTATTGTATTTAAAAAGTATAATGAGATTCCTTGTAAAAG
ATTTGTGGATTTCGCTATCTTCTTGATAATTGATTTATAATCCTATATAGTTTATTTAATTTGAAACAAGCATAACCTTATGAACGTGTGATTTATGAATGAATTATATTTTATTAACAC
TTATTTATTCACGAAGTTAGTTTAATTGGTATACCAACACTGGTTTAATGTTGAAATTACGGTAATTCAGTGCTCTTGGTATAGGTTTGTACTTTCATTTTGATGTTTTAAGTGGAACAC
CCGTGTTAATTGGAATGTGAAGGAAACGTGAAATTAGTCTGGAATCATTCGAAATATACACTGTAAGTGTATGGGCGATAATTAAATACAACGAGTGATAATTGGTTGAACCGGTTTTAA
AGGTGTGTGACTTATCCATAAGGATAATATTTAGGCTGACATATTTAATCAAAGGATTAATATAAACATCGATTATTAGCAAGTTAAGTGTTTATGTGTTATATGACCACACATTTGATC
AAACTGTAAAGCATATTTACATGGATCTGCAAAAATGCATTGATAAAAGCAATAACAACGTGTTTCTGCAATGCATGCGCTCGGCCATGGTCGTAAATATATTCAGCAGCAAATCTGCTT
AAAATATCGCTTTTACAACGTTGCACTTACTTCCCAAAGTAAAGCGAGAAGTACGCTTGACAGGTTACGACCTAATTTCGTTTGATTCCACATGGGTGGCTTGATTTTTAGAGCCCAGTG
TGTTTCTAATAAACCGCCATACTTTCAACGGGCTGTCGTGCACCTAGGAAACCGAGATTCTCACTCACACCTTAGGAATGTTAATCATTCGACCATATTCTCTCGGCACGCGACCGCCGA
TGTCCCAACTTACTACCGAAAATGGTGAAAAGATATTTTCTCAGCAATATCTTTGGTTTACCATCCCGTGTTATTTGTAGCGGTTAATCGGAAATAAGCGTAACAAGCCGCCCACTGTCA
TTATTTCACCCCGACATGCGCATAAGCTCTTTAAATCTGAACTAACCGCAACCTTTAGCTCTTGCTACTAAAAGCGAGATTTCATGCAAACCAATTAAAAAGTAATTTCCTAGCGCGCTT
CCAGGTAGGCCTGTACTAATTATATCTACAAGGCCCTTAGTGTGCTTTGCAGATTTTCAGATACTTTTTTGGTTCTCCTACCTCGTGCCACGAAAATGCAAACCGAGATAGCACACTGCG
TTGTAATTGATTGCAGAGAATTTTTTTTCGTCTGATATATACCAGTGCTGGTACGAACAAATAAATGCAGATGAATAGCAAATGAAAATCTGTGACGATCGAATTTAATAAATTTTGCAC
AACGTTTTGTAAAATAAGCGTCCATGAAGTGCTACAGCACCAACTGTTGTTGAGAAGCACTGTTCTACATAGGCCTACCCACCAAAGGGTTTGGTTGTTTTCTGATACCCACCAGTGCCA
CCACAACACCTAACAGAGCTCTTCCATCGCCTCCAGGATAAACTTGGCATTTTGCCAGAACCGCAAACTCGCAAACCATAGGGTTGGACATTTAGCTTACAGTAAACACTTCCGTACGTT
AAAAGGTTGCAAAAGTAACTGCAGTTGTATATATAACAAGAATTACGCCTTCGGATACGACAAAGATTAATTAAACAAGCAAAGAGAAGGGAATTTGTAGCAAAACGTTCTTACTTATTG
CTGGTTTTTAATGTTTAATATCCGAGTAAGGTGTTTGCGTTTAAATGGTCTATCGCGCATAATAACGGTACAGCCGTCAAGTTTTTATTATACGGTTGTTTTGTGTAATATTGACTTTTG
CTACTCTACCCTATCAGCAAGTCATGCCATGGGGCCTAATGTACAAGGCGTAAATGCAAACATGGTTTAATATGAAGCAACACTTTGTTTAAATTGTAGCATGGGACAAGTTAACACTTA
ATATTCAGATCAATCTGCAAGAAATGAAAACGTACCGATACAACTTATATATATATCTGGTTTTACGATTTTCGTTTTGAAAATTGTGTGATGTTTTGAAAGCCTTTTGGGCAAACCTTT
TGAATGGGTGTTTTTTTATGTTACGTCAGAGTTAGAGACACAACAGGTGATTTATAACCGGCATAAATTTCCCAATGACGCGTCTCAAGTGTGCTTAGAATCTAAAACAACTAAACACGT
CATATCCAGTCTGTGCATCTTCAGACACAAGTTGAATAATCCACATGTTGCTTAAACCGGCAGCTTCAATGAACTTGTCGTCTGTGGATTTTGGATTTAGATCAAGGCTACGACACTTTT
AGCTCGCGTACAGTTTGCTGTACACACATCCCCCGCCCTTTTAGTAATAGCATTGCTTGAAACTCAATCCAAGGGTTCACTTATCGGTTTGACTTTATAGGCGGTACTTTGTTATGTGTT
GGTTAACGTAAGTATAACATATTATACACCGAACTAAGCACGAACGTTCGCTGCCAGTAGTGCTTAAAATGTTACCTTCTTTAGCGCGAATTTTAAAGACCAATACCTCGAATTTGGTTT
GTGTCATCCTTTTTTTCTGCAACCGTATGTTCTGTTTTTGTAAATTTGTGTATCACACATTGCGAGATAAGAATGTGCTCTTTCGTTTTATGAATCTTTCAATATCACGTCATAATTAGT
TATCCCCACCGCTAAATGAATGTTGGACCACTTTATTACGTCACAAACATACCGAGATAAGCTTCGGAAGCCACGAAGCGATTTAGGAAGTTTGTCGTCACCGCATTTCCTGTTTGCGGC
AGCTCGTCTCTTATTCGGCGAGATCGTAGCACAGCTTGCGCCATTCATTTAACTTCCACCATAAACATGCTTTCATTCGATATCTATTTATTATTGATTCGTTGTGAAAACATGCCGCAC
TTGGCGCCTCGGTTTGTTTGAATAATGTTACCATTTCCTAAGGTCGTTTTGCGGTTTAACTCTACCCGTTGTACTTTGCTCTTCTGTTAAATTGTCTGTTTTAAAACCTATTACACTCAT
ACGTATCACTCTTGAGTCATTAAATCTTAACCTCCAAGTTTAAACAGGGCGTATCGTGCTCTTGTATGCTAAACAATCATATACCCTGGTCGTTAAGACGGTACAACAACTTTAACCTTT
TAAAATGTCGCTCAATATATCATCCCGTGCGATTTTATTAACTGCTGCTTCCAATGGCCATAGATTGGTATATAGTACTGTGGGGTAAGATGGAATACTGTTAGCACCTAAATCTACTTT
GGGGTCGTGGGGCTACGGTTATATAACTCTGTAAATAATATTGAAAATAGAATAACAACATATCTCTTCTTATCCCACCCGACTATATAAGAGTGTTTCTAAATGACACTGAACTGTAAA
TGCGATGCAGATTGTCACGAAGATACCATCTGTTTTCATTGCTGATGCGAGTAAATTACCACTGTTGTTAATAATCTTTACACTGTAGTTAATAATGGATAGTCCAACACTGGCAATTTG
TATTTGTCGTGAATAGAAATATATGAGGCACGGTATTAATGAACCGACCGTGAACCAGTTTAAAATGTTTTTTCACCGAGTGTATGAAACAAAACACTGTCGTTTTGCGCCCTCATGCAA
GAATAAATAACATAAATTCACTCATAATCTAGAGTTTGAGAGACCCGTGTATATTGAGCAGTTCAAAAGACCTGCTGCAATACAATAGTACTTTTTGTGTTCTTACCTTACAAGGAAACT
ATGTTAATTTAAACTCATAAAACGCTTTGCCGATTTAAAAGCATTAATCATATATACCAACATACACCAGTACAACATAAAGATTTGCGCCTGAACGCATGCCGTCCCGATGTACATTTT
CCCGTAACCACTTTGAACACTTGCACAACACTTCAAACCCGATTGCAATAACTTTAATTGCGCTGCTTTCTGTGTTAAACTTAGTTACGCCTTGTTTTTGGAAGTCCAACACGAATGTTA
TATTGTACGGTACGTTTAATAATATGTAAAGTGCAATACTGTGTATTGTAGAGTACATATATAAAATGCTATGGCATAATATAATTTATGTAAGGTATAATATAATACAGGACGTTATAT
AATGTAATGTAAATTTATTTTCCCAGAGACATGAGGTTCAATAGAATTCGTAGCATTCCTGCGTCTACTTTCCGTCGAATGAGGAATCTGAATTCACTCTGTGAGTATGTATGGACGGTA
GCCATCTCAAATACTTCTAGTATTAAACACTTCAATGTCAACTTAAGGGTCGAGTGAAACCGTTGAATTCCAAGTTCGAGTACCACTTGAATTCTTGACTGAAATATCACACGAAAGCTC
GACCCTAAACTGCGATGCAGCAACCTCACGTCTGTACCGTGCTTGATCACTTCTAAAAGATTCTCCGATTGTGTAGGCTAGGTTACCTAAGCTTCACGTTTACAGGTGTATTATATTGCC
CGTCTTGGAAGCGCTCGCAGCTCTCAATTGGAATTAAACCCCGCAATAATTCTTAACCGAAATGTAAAACCCTGCGAACGAAATCTAACTGAACTAAAAAGCGTTTCGTCGCTTAAGTTG
AGAGAATTTCAGCGCAAGTTACACCTCGGGGTCGTGTTCACGTCGCATGGGGTCTAACGTTGTAACAACCCATCACACTGACACGTTTACAAAACAAGAAATTTTGTCCATGCAACATCG
TTTGATTGATGGATACTTAAGCCTTGGGTTTCGCTGCTGATTCGCATGCTGCGCGGCAATGTTTGTTTGGCGTTACAACGTGGTCGGCTATGTGCCAAAAAACGCCGATAAAGTTGCTGA
TGCTGCGAAACGAAATCTTTCACATCAGAGACAATTTTGGCATAGGTTTAATAAATACTTGTATCGCATTTTATCAACATAACGCTTTGGTTTAATGTCACCGTTTGAAAGTTGCACCTC
GTCCGTTATAATTTTGCGTTGCTTTTATTGATAGCAAGCAACTTTCTCGTACGTATAAAGCAGAAGGGGATTATGTTCGTTGACATAATGATAAGGTAGACGGTTTGCCGACGACCTGTT
TCGTTTGCACAAGTTAACGGTTCATTTACCACTGGATTAAGGGCACTGGTTTCTCTGAATTCACTTACCGGCTCTCGTTAACAGACAGGCTATCAGCGCCGTAACACGTTTGTTTCAGTG
ATACATTACCAGCCAACAAATTTAAAGATTTTAAGGCGCATTCCCAGGCTCTGCCTTGTGTATTTACCGAAAGAAAACAAATAAGTCGAGGCCTCTTCAAGGTTGCGGTTTTCCACCAAA
TTAAACTCATTGAAGATGAAAAATTCGTCCAACTTTTGAAGTCTGATCATTTGTCTCGCAATCCAATACTCCTATAGACTTCTATTTGATAAATAGGCTTTTCGCTTTGAAATATGGCAC
TTTGTAGATCATGAACATTGTTACTGCTTTGAAATTAACCATCACGTTTGTTATGGGTCAAAAAAAATCACGTCTGTTTTATATTATACTTTTTATTATGCAAACTTATTTTACAATCAG
CATAGTTAAACAAAAGTGTTATGTACCAATGTTTATCATCTAAATATATTTAAAGTAGAAATTAAATCACGTTTAAGTGTTCTACATTTTTTAAATATAAAAACATACCTATGCAAAATC
GATTTTAAGTAGCATATATAAGTGTGGTACCACTCGCGGTGACGTTGACGACGCAGGAGACGTGTACGACTGAAGTTATTGAGCGTTCATATCTGCGTGCTTGAAATTGAACCTTGTTTT
TCAGATTACTCAACAACAACGAGATCCAATCAATCTCAGAGAACGCATTCCGAGGTCTCTCATCACTCAAGTATTTTTGTGAGTATAAGATAACCATAGACGAACCCGCAGAAGCGCCGT
GGCAAAAGTATTAATTCAAACCACTCAAGCCGTCGCTTTGGCATCTAAAGTCTATTTTCCACTTTAATATTGATAGATTTCTTGAAACAGAATGCACAAATTGAACTGATTTTTTGTTTA
CACTATAGTTTAGAGCTAACCCAACTTAAATGAAATTTACGGAGCATTTAAAGATGTTTTTTTGTTACTTTTCACTTCGATGAACACTGCAATGTAAACACCGCTTAAGAGTGATCAAAA
ACCGCCATTTATAGATTAGAATACCCGGGCACGGCTTAGCTGCTTAAGCTTACGCGACAAAACCAATAAACGAACGTCTTGTTACTGCATAGCGTGGATTTGGGCGCAACATTTTTAGTA
TTTGCTTGCCTGTGCTTTGAGTAGATACAGCCATAATCACTATCCAGCATGGCGATATAAAATTCTTTATTTTCTGTTTATTTCGCTGTTTAGTTAACACTGGTTCGTATAAAATCGGTA
TATATAGATACTAATTTTCATCCAAAACACCTGAAATTCTAGGTTTTTTAAAGGAAGTTTGGCTCTAGAGTCGTTTATATATACCAGAATTTACTCCCTACTGTAGCAAATAGCTTGCGA
TTTTTTGTATGAACACAATGCCTTTATTTGCACAAGCCACAAGTTGCGGTTGTTCCCCCAAACCGAACTCGGTCAACTTTTGGCGAACGAGTCGGGTTGTTTTCGAGCTGAAAACCATCA
ACTGTTCGACACTGAATTCCACAGGAACTGGTAGTAAACAGCACGCAAGAGGAATTTCTATTCAACCCGTAGTAAACACCTGGTGCTTGCATAATATCTGACGTAAGAATACGTCATGTC
ATATTATGCAAGCAGACTATAGTTTACATTGGTATGAAATTTGGCATTTGCGTTCGAGTGTACGGCTGTACTTTGTTCCGTGTCAACTACAATAACAAACAGCTGTTAAAAACTTCTACT
GTTATAAAACATGGCCTGACACGCTCTTTTATGTTGACAGATACCTATACAAGAACAAAATAAGGACGATACACAAAAGAGCGTTCAATGGCCTAGTTTCTTTAGAGCAATTTTGTGAGT
TATTTCTTTGTTCATAGTGGTATAATTTTGTCCCCTTATCCACTGCATTAAAGTGGCACTAACCGTGTTAAATCTACTTTGTGTTCAGTGGAGGCCTTAAGGCTGCTTAGCGAATTCCGC
ATGTAATCGCTAAGCTTTATAAGAAAAATACTAACTACGTATATTACGCATGAACTAATACACACTGGGTTAACAAACGTATATATGTCAGCTGTGTTGGCCATGGGGCATTCGGTTTTA
ATATTGTGTTTACGTTTATTATAAACCTATTAGGTTTAGAATTCCCAAGTAAAGTCAACGAAAACGAACCTAAAACATACTTTTTATTAAGCCTAGACACCGGCGCTTTGGGGCATGATG
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ATCCCAACTACAAGGACAGGTCCAAACATTGGAACAAAAGCTGCAAGATAGGGATTAG

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGTGGATTAAAAGGACACTGACTCTGTGCGTTGCTTTCGCTATATTGGTAAATCTTGATGGTACATGCAAGGCGCAGAGCCCAGAACACCGCGCTTGCCCCTCTGGATGTCTGTGCTTC
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AGACATGAGGTTCAATAGAATTCGTAGCATTCCTGCGTCTACTTTCCGT
CGAATGAGGAATCTGAATTCACT
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TTACTCCATTCGAATTTGATTGAAACTCTACCAAATCGGCTCTTTGATGATCTGACGCTAAAGCGGCT
GAGGTTAGATGGGAATCGTTTACGCTGTGATTGCGACCTTGCTTGGTTGGCC
ACTTATTTGCAAGGGCCCGGTCGCTCTGTTCTTGCCACTGCAGTATGTTACCAACCAAGGTCACTGTCTGGTCGTCACATACCAACTATCCAACCATCCGAGTTTCAATGCAGTGACACT
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GTTCTTTACTTATTCGTGGTGTAAACCCTGGTGACGAAGGGACTTACACTTGCAAAGCTGAGAGCAACGCTGGAGTTTCAACTTCAGATGCCTTTGTTACCATAATGGTA
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GTCGA
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GGGGTGGATGATGAAACTGCTCCAAATATATATTGGACCAAAGATAATGTTCGACTAACTACTTCAG
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