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Entry information : DrPxd01
Entry ID 7648
Creation 2010-10-22 (Marcel Zamocky)
Last sequence changes 2016-02-02 (Achraf Jemmat)
Sequence status complete
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2016-02-02 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: DrPxd01
Name DrPxd01
Class Peroxidasin    [Orthogroup: Pxd001]
Taxonomy Eukaryota Metazoa Chordata Actinopterygii Cyprinidae Danio
Organism Danio rerio (Zebrafish)    [TaxId: 7955 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value DrPxd01
start..stop		 S start..stop
GacPxd01 2575 0 31..1461 1..1432
TrubPxd01 2561 0 10..1464 11..1465
OlaPxd01 2473 0 8..1466 13..1472
MdoPxd01 2389 0 31..1462 182..1617
Literature and cross-references DrPxd01
DNA ref. GenBank:   NW_003040481.3 (86603..178618)
mRNA ref. GenBank:   XM_002665266.1
Cluster/Prediction ref. Genebank:   100332937
Protein sequence: DrPxd01
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   1468 (1438)
PWM (Da):   %s   164145.56 (160851.8)  
PI (pH):   %s   6.87 (6.74) Peptide Signal:   %s   cut: 31 range:31-1468
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MALRTVRNLP CFLSVLSVFL LSSGPYRVSS CPSRCLCFRT TVRCMHLNLE SVPAVLPQTT ILDLRFNKIK DLQPGSFKRL KNLNTLLLNN NHIRRIPRGA FEDLENLKYL YLYKNEIQAI  DREAFKGLVS LEQLYLHFNN IESLEPESFS HLPKLERLFL HNNRISHLAL GTFSHLQSMK RLRLDSNALH CDCELLWLAD LLKQYAESGN AQAAATCDYP NRLQGRSVAT LTAHELNCEV  PRITSEPQDV DVTSGNTVYF TCRAEGNPKP QIIWLRNNNA LNMRDDTRLN LLEDGTLMIQ DTRETDQGVY QCMAKNVAGE VKTSEVTLRY FRSPSRPSFV IQPQNTEVLV GESVTLECSA  TGQPQPRVTW TRGDQSALPV DPRINITPSG GLFIQNIHQA DGGQYTCFAS NNVDTIHANA YIIVQARPQF TVTPQDQSVL EGQTVDFPCE ASGFPQPVIA WTRGGSPLPN DRRHVVLSTG  SLRISRVALH DQGQYECQAV SPVGTARAAV HLNILQSVTP VFTSAPRDLT VESGSDVQIP CSAQGEPTPI ITWSKDGVQI TESGKFHINP DGYLEVHDVG LADGGRYECV ARNSIGYSSS  SMVLTVQVPQ VSREGDPFVS TSLEEAIRSI NSAIDSTRRQ LFDGSPRTPA ELLALFRYPR DPYTVEQARA GEIFEQTLLL IQRHVNQGLM VDTNGTAYRY NDLVSPRFLD MIANLSGCTA  HRRINNCSDI CFHQKYRTHD GTCNNLQHPM WGASLTPFER LLKPVYDNGF NLPRGTTERW HNGYPLPLPR LVSTTMIGTE TITPDDRYTH MLMQWGQFLD HDLDSTVVSL SQSRFSDGQL  CTSVCTNDPP CFPIMFPPND PRQRRNGARC MFFVRSSPVC GSGMTSLLMN SVYPREQMNQ LTSYIDASNV YGSSQHEAEE IRDLASHRGM LRQGIVQRTG KPLLPFATGP PTECMRDENE  SPIPCFLAGD HRANEQLGLT AMHTVWLREH NRIASELLRL NPHWDGDTIY HEARKIVGAQ MQHITYNQWL PKILGEAGMR IMGDYTGYNP NINAGILNAF ATAAFRFGHT LINPILYRLD  ENFQPIQQGH ISLHKAFFSP FRIVNEGGID PLLRGLFGVA GKMRMSTQLL NTELTERLFS MAHAVALDLA AMNIQRGRDH GIPSYNDYRV FCNLTSAQTF EDLKNEIQNP SVREKLQRLY  GTPLNVDLFP ALMAEELVPG SRLGPTLMCL LATQFKRLRD GDRFWYENPG SFSPAQLTQL KQTSLSRVLC DNGDNITRIQ SDAFSVADLP HGYGSCADLP KIDLRMWQDC CEDCRTKGQF  NALSFHFRGR RSAEHSYAEE KKPANNLTEN SSTLEDAAVN ITVSPKSSTE PSAKDFQDFV TDMQKTITSL RKQIKRLEGR VSRTDCADED GRERADGESW RKNPCTMCQC KAAQVTCFVE 
KCAPAVCETS VTPSGSCCPV CLNQPTAA 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo 17, 24 introns), no EST. Strain="Tuebingen"
DNA ►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGTTGC GGACTGTGCG AAACTTACCC TGCTTTTTAA GTGTACTCAG CGTGTTTCTC CTCAGCAGTG GCCCGTACCG GGTGTCCTCA TGTCCGAGCC GCTGTTTATG TTTCCGTACC  ACTGTCAGAT GCATGCATTT GAACCTGGAA TCAGTGCCCG CAGTTCTTCC TCAGACCACA ATCCTGTAAG TACACTAGCT TTTTTTGTTC TCCAAGTGTC TGCTTGATTG CTCTATATCT  ATATCGGAAC TACTCTCTTT AACAACTTTA AGTTGTAGCA ATGTTTGCGT GTTCTGCATT GGTCTCACCG GTTGCATACA GGCGAGTTTG TCTTGCGGCG TCTGAATATT GCGGTAAAAT  TGTTTTTATT TTCGCACATT CGTTCATTTT TGAAAAGTGA CAACTTCTAA TAACGTTTCT ATATTATTTA CCAACTATTT TAGCTGTGAA ATCACTTGTG AGACAGCGTT ATTTAATTGA  CTGTGATCAA TGCTTACTTT CATAGTCGTT TGTTGCTCAT GCTAATATGA TTTCCCCTGC AAAGAATACT TTTAGGAAAT AATATTAGCG AGAAAGTTTG AATGTGTGAA TGTAAAACCA  ACTTTACCCC AGTAGTTTGA ATCACCTTCC TAATCTGGAC GGGTCTTTGT TTCAACACTG AGGCTGTGTC TGCACTTTAA CCCTACATAG GCAGCATTTT GGGGGGCGCG ATTCGACTAT  ATTAGATGTG TACCAACGCA AACTCTGATA CAAACCCTGC AGGAATCTTT GCACGGCCAC GAATGCTGCA AGAATTGTGA TTCACTTAAT TACCGGAGCA TATGACATCG GCTCCGTCCC  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TCTGTGACGC CCAGTGGCTC GTGTTGCCCC GTCTGCCTCA ACCAACCCAC AGCAGCATGA 

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AAGTGTGCGC CGGCCGTGTG TGAGACGTCT GTGACGCCCA GTGGCTCGTG TTGCCCCGTC TGCCTCAACC AACCCACAGC AGCATGA 

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