Entry information : GgaPxd02
Entry ID | 7673 |
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Creation | 2010-10-28 (Marcel Zamocky) |
Last sequence changes | 2016-02-16 (Christophe Dunand) |
Sequence status | complete |
Reviewer | Achraf Jemmat |
Last annotation changes | 2016-02-16 (Achraf Jemmat) |
Peroxidase information: GgaPxd02
Name | GgaPxd02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Class | Peroxidasin [Orthogroup: Pxd001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Taxonomy | Eukaryota Metazoa Chordata Aves Phasianidae Gallus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism | Gallus gallus [TaxId: 9031 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular localisation | N/D |
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Tissue type | N/D |
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Inducer | N/D |
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Repressor | N/D |
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Best BLASTp hits |
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Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '7673' 'join(2590..2753,10995..11066,17819..17890,18010..18081,20858..20929,22307..22378,23927..24096,25433..25550,27100..27269,27723..27995,28169..28285,29846..30004,31708..31820,32871..33027,34311..34419,35166..35323,37007..38510,38995..39129,39607..39815,40368..40482,40860..40953,41277..41372)' |
Exons►
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Literature and cross-references GgaPxd02
Literature | International Chicken Genome Sequencing Consortium (2004) Sequence and comparative analysis of the chicken genome provide unique perspectives on vertebrate evolution. Nature 432: 695-716. |
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DNA ref. | GenBank: NC_006107.4 (9279703..9235568) |
mRNA ref. | GenBank: XM_417421.2 |
EST ref. | GenBank: BU486113.1 [5' end] |
Cluster/Prediction ref. | Genebank: 419247 |
Protein sequence: GgaPxd02
Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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Remarks | Complete sequence from genomic (chromosome 20, 18 introns) and 1 EST, strain="inbreed line UCD001". | ||||||||||||
DNA ► Send to BLAST |
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CDS► Send to BLAST |
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