Entry information : PhucoPxd01
Entry ID | 7677 |
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Creation | 2010-11-02 (Marcel Zamocky) |
Last sequence changes | 2016-02-16 (Christophe Dunand) |
Sequence status | complete |
Reviewer | Christophe Dunand |
Last annotation changes | 2016-02-17 (Christophe Dunand) |
Peroxidase information: PhucoPxd01
Name | PhucoPxd01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Class | Peroxidasin [Orthogroup: Pxd001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Taxonomy | Fungi/Metazoa; Metazoa; Bilateria; Ecdysozoa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism | Pediculus humanus corporis (human body louse) [TaxId: 121224 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular localisation | N/D |
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Tissue type | N/D |
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Inducer | N/D |
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Repressor | N/D |
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Best BLASTp hits |
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Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '7677' 'complement(join(508001..508117,508203..508457,508527..508672,508760..508968,509077..509194,509283..509627,509701..509920,509980..510119,510192..510369,510432..510829,510907..511140,511214..511489,511601..511999,512076..512231,513727..513847,513941..514092,514183..514352,514439..514556,514650..514698))' |
Exons►
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Literature and cross-references PhucoPxd01
Literature | Kirkness,E., Hannick,L., Hass,B., Bruggner,R., Lawson,D., Bidwell,S., Joardar,V., Caler,E., Walenz,B., Inman,J., Schobel,S., Galinsky,K., Amedeo,P. and Strausberg R. Annotation of Pediculus humanus corporis strain USDA. (Unpublished since 2008)
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Protein ref. | GenBank: XP_002431634.1 |
DNA ref. | GenBank: DS235854.1 (514698..508001) |
mRNA ref. | GenBank: XM_002431589.1 |
Protein sequence: PhucoPxd01
Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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Remarks | Complete from genomic (18 introns). No EST found. Strain="USDA". In GenBank annotated as "thyroid peroxidase precursor". | ||||||||||||
DNA ► Send to BLAST |
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CDS► Send to BLAST |
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