Entry information : TguPxd01
Entry ID | 7678 |
---|---|
Creation | 2010-11-02 (Marcel Zamocky) |
Last sequence changes | 2016-02-09 (Christophe Dunand) |
Sequence status | complete |
Reviewer | Achraf Jemmat |
Last annotation changes | 2016-02-09 (Achraf Jemmat) |
Peroxidase information: TguPxd01
Name | TguPxd01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Class | Peroxidasin [Orthogroup: Pxd001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Taxonomy | Eukaryota Metazoa Chordata Aves Estrildidae Taeniopygia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism | Taeniopygia guttata (Zebra Finch) [TaxId: 59729 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular localisation | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue type | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Inducer | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Repressor | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Best BLASTp hits |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '7678' 'complement(join(16175212..16175334,16175979..16176092,16176984..16177116,16179584..16179704,16187832..16188040,16190539..16190673,16191506..16193009,16197437..16197594,16198034..16198142,16201602..16201758,16202693..16202805,16205849..16206007,16207089..16207205,16208495..16208767,16209703..16209872,16211948..16212065,16213329..16213498,16214007..16214078,16214654..16214725,16222025..16222096,16228481..16228552,16230204..16230275,16256851..16256903))' |
Exons►
|
Literature and cross-references TguPxd01
DNA ref. | GenBank: NW_002198514 (16256978..16172447) |
---|---|
mRNA ref. | GenBank: XM_002195455.1 |
Cluster/Prediction ref. | Genebank: 100230769 |
Protein sequence: TguPxd01
Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
|
||||||||||||
Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
|
||||||||||||
Remarks | Complete from genomic (chromosome 3, 23 introns). No EST found. | ||||||||||||
DNA ► Send to BLAST |
|
||||||||||||
CDS► Send to BLAST |
|