Entry information : KflPrx01 ( kfl00004_0140)
| Entry ID | 7730 |
|---|---|
| Creation | 2010-11-04 (Qiang Li) |
| Last sequence changes | 2014-08-20 (Christophe Dunand) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Christophe Dunand |
| Last annotation changes | 2016-03-07 (Christophe Dunand) |
Peroxidase information: KflPrx01 ( kfl00004_0140)
| Name (synonym) | KflPrx01 ( kfl00004_0140) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Class III peroxidase [Orthogroup: Prx328] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Klebsormidiophyceae Klebsormidiaceae Klebsormidium | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Klebsormidium flaccidum [TaxId: 3175 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
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| Tissue type | N/D |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '7730' 'join(1..69,551..653,1174..1269,1752..1822,2177..2239,2720..2839,5956..6010,6357..6435,6849..6972,7395..7474,8081..8216)' |
Exons►
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Literature and cross-references KflPrx01 ( kfl00004_0140)
| Literature | Timme,R.E., Bachvaroff,T.R. and Delwiche,C.F. Broad phylogenomic sampling and the sister lineage of land plants. PLoS ONE 7 (1), e29696 (2012). |
|---|---|
| EST ref. | GenBank: HO437950.1 [Fragment] |
| Cluster/Prediction ref. | klebsormidium DB: kfl00004_0140 |
Protein sequence: KflPrx01 ( kfl00004_0140)
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from 1 EST and genomic (10 introns). Incorrect prediction from Klebsormidium DB (extra last short exon) |
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| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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