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Entry information : LspPxc01
Entry ID 7783
Creation 2010-11-29 (Marcel Zamocky)
Last sequence changes 2016-03-02 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Achraf Jemmat
Last annotation changes 2016-03-02 (Achraf Jemmat)
Peroxidase information: LspPxc01
Name LspPxc01
Class Bacterial peroxicin    [Orthogroup: Pxc001]
Taxonomy Bacteria Cyanobacteria Lyngbya
Organism Lyngbya sp.    [TaxId: 28073 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LspPxc01
start..stop		 S start..stop
FspPxc01 281 4.58e-88 24..529 46..591
CsePxc01 265 4.01e-82 31..529 61..579
SpoPxc01 246 5.12e-75 31..501 28..537
RsphPxc01_241 240 1.19e-72 62..494 47..526
Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '7783' 'join(2098..3690)' Exons►
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 2098..3690 1591  
join(2098..3690)


exon

Literature and cross-references LspPxc01
Literature Stal L., Ferriera S., Johnson J., Kravitz S., Venter J.C. (Unpublished since 2006)
Protein ref. GenBank:   EAW35456.1 UniProtKB:   A0YTW9
DNA ref. GenBank:   AAVU01000029.1 (2098..3690)
Protein sequence: LspPxc01
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   530 (912)
PWM (Da):   %s   59176.46 (100306.0)  
PI (pH):   %s   6.8 (6.71) Peptide Signal:   %s   cut: 19 range:19-930
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MLKNISHAGG VNPQAKERRE QTEEILFSTP FGYMFPDLVM GENTEANKLP VASNTVPALK MLGDAMADLG EAGAEMKKFN SNIPSVFTYL GQFIDHDITA RTDRETEISM ISIGDNANDE  LKPIDPQIII NKLKNGRRPQ LDLDSLYGDG PALIPGGKVG ANTEAQFLYE DESLLLKVQD LGKFVDLPRA DRKAKIADMR NDENVIISQL HAAFLKFHNV IACTLPKHLS PQSRYIYARQ  FVRWCYQYVV INDYLRSVCD PNIVDDILLN GPRFYLPGFS GNSVFMPLEF SVAGFRFGHS MIRPFYQLNR QSQVKIMNLL GVSKDRPQES DLLEKNGDNY QLKKSFSVDW ENFVRFVPDE  PIPNVARKID PQISQGLFDL QLDGVRANTF MSHLAQRNLV RGYSLSLPTG QKLAKAFGFQ PLTREDLIDK EPNEKLKQAL EYGNFGDRTP LWYYILKEAA LQTGGNTLGA VGSSIVAETL 
IGLVKQDPNS YLNHLHNPAV RPNGIRIPRL YGRASIINSI GDILSCAGVR 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Strain="PCC 8106".
DNA ►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCTAAAAA ATATCAGTCA TGCCGGGGGA GTCAACCCAC AAGCAAAAGA GAGAAGGGAA CAAACCGAAG AAATTCTATT TAGTACACCT TTTGGTTATA TGTTCCCCGA CTTGGTAATG  GGGGAAAATA CAGAGGCGAA TAAATTACCT GTAGCCAGCA ACACGGTTCC TGCTTTAAAG ATGCTAGGAG ACGCCATGGC TGACTTAGGA GAAGCGGGGG CAGAAATGAA GAAATTCAAC  TCTAATATTC CTTCTGTTTT TACCTATTTA GGTCAGTTTA TTGATCACGA TATTACCGCT CGAACAGATC GGGAAACAGA GATCAGTATG ATTAGTATTG GTGATAATGC CAATGATGAA  TTAAAACCGA TTGACCCACA AATTATTATC AATAAGCTCA AAAATGGGCG GCGTCCTCAG CTTGATCTCG ATAGTCTTTA TGGTGACGGG CCAGCATTAA TACCGGGCGG AAAAGTTGGA  GCAAATACAG AAGCTCAGTT TCTTTATGAG GATGAAAGCT TACTGTTAAA AGTTCAAGAT TTGGGTAAAT TTGTGGATTT ACCTCGGGCT GATCGCAAAG CCAAAATTGC GGATATGCGT  AATGATGAAA ACGTGATTAT TAGTCAGCTT CATGCTGCTT TTTTAAAGTT TCATAATGTA ATTGCTTGTA CTTTACCGAA ACATTTATCT CCTCAAAGTC GGTATATTTA TGCTCGTCAG  TTTGTGCGTT GGTGTTATCA GTATGTTGTC ATCAATGACT ATCTCAGATC AGTTTGCGAC CCCAATATTG TAGACGATAT TCTGCTCAAC GGGCCGCGTT TTTATCTCCC TGGCTTTAGT  GGAAATTCGG TTTTTATGCC GCTAGAATTC TCCGTCGCCG GATTTCGGTT TGGTCACTCG ATGATTCGTC CGTTTTATCA ACTTAATCGT CAGTCTCAAG TCAAAATTAT GAATCTCTTG  GGTGTTTCCA AAGATCGACC TCAAGAGTCT GATTTGCTAG AAAAGAACGG TGATAATTAT CAACTCAAGA AAAGTTTTAG TGTTGACTGG GAAAACTTTG TCAGATTTGT ACCGGATGAA  CCGATTCCTA ACGTCGCTCG TAAAATCGAT CCGCAGATTT CTCAAGGCTT ATTTGATCTT CAACTCGACG GAGTAAGAGC GAATACATTC ATGTCTCATT TAGCTCAACG AAATCTAGTC  AGAGGTTATT CATTGAGTTT ACCAACTGGA CAAAAACTAG CTAAAGCATT TGGTTTTCAA CCCCTAACAA GAGAAGATTT AATCGATAAA GAACCGAATG AAAAACTAAA GCAAGCACTT  GAATATGGGA ATTTTGGAGA CAGAACACCT TTATGGTATT ACATTCTCAA AGAAGCCGCA TTACAAACAG GAGGAAACAC GTTAGGAGCT GTAGGAAGTA GTATTGTTGC AGAGACTTTA  ATTGGGTTAG TCAAACAAGA TCCCAACAGC TATTTAAACC ATTTGCATAA TCCGGCTGTA CGACCCAATG GAATTCGCAT TCCTCGGCTT TATGGTCGTG CTTCAATCAT TAACTCGATT 
GGAGATATTT TATCCTGTGC AGGAGTTCGT TAG 

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCTAAAAA ATATCAGTCA TGCCGGGGGA GTCAACCCAC AAGCAAAAGA GAGAAGGGAA CAAACCGAAG AAATTCTATT TAGTACACCT TTTGGTTATA TGTTCCCCGA CTTGGTAATG  GGGGAAAATA CAGAGGCGAA TAAATTACCT GTAGCCAGCA ACACGGTTCC TGCTTTAAAG ATGCTAGGAG ACGCCATGGC TGACTTAGGA GAAGCGGGGG CAGAAATGAA GAAATTCAAC  TCTAATATTC CTTCTGTTTT TACCTATTTA GGTCAGTTTA TTGATCACGA TATTACCGCT CGAACAGATC GGGAAACAGA GATCAGTATG ATTAGTATTG GTGATAATGC CAATGATGAA  TTAAAACCGA TTGACCCACA AATTATTATC AATAAGCTCA AAAATGGGCG GCGTCCTCAG CTTGATCTCG ATAGTCTTTA TGGTGACGGG CCAGCATTAA TACCGGGCGG AAAAGTTGGA  GCAAATACAG AAGCTCAGTT TCTTTATGAG GATGAAAGCT TACTGTTAAA AGTTCAAGAT TTGGGTAAAT TTGTGGATTT ACCTCGGGCT GATCGCAAAG CCAAAATTGC GGATATGCGT  AATGATGAAA ACGTGATTAT TAGTCAGCTT CATGCTGCTT TTTTAAAGTT TCATAATGTA ATTGCTTGTA CTTTACCGAA ACATTTATCT CCTCAAAGTC GGTATATTTA TGCTCGTCAG  TTTGTGCGTT GGTGTTATCA GTATGTTGTC ATCAATGACT ATCTCAGATC AGTTTGCGAC CCCAATATTG TAGACGATAT TCTGCTCAAC GGGCCGCGTT TTTATCTCCC TGGCTTTAGT  GGAAATTCGG TTTTTATGCC GCTAGAATTC TCCGTCGCCG GATTTCGGTT TGGTCACTCG ATGATTCGTC CGTTTTATCA ACTTAATCGT CAGTCTCAAG TCAAAATTAT GAATCTCTTG  GGTGTTTCCA AAGATCGACC TCAAGAGTCT GATTTGCTAG AAAAGAACGG TGATAATTAT CAACTCAAGA AAAGTTTTAG TGTTGACTGG GAAAACTTTG TCAGATTTGT ACCGGATGAA  CCGATTCCTA ACGTCGCTCG TAAAATCGAT CCGCAGATTT CTCAAGGCTT ATTTGATCTT CAACTCGACG GAGTAAGAGC GAATACATTC ATGTCTCATT TAGCTCAACG AAATCTAGTC  AGAGGTTATT CATTGAGTTT ACCAACTGGA CAAAAACTAG CTAAAGCATT TGGTTTTCAA CCCCTAACAA GAGAAGATTT AATCGATAAA GAACCGAATG AAAAACTAAA GCAAGCACTT  GAATATGGGA ATTTTGGAGA CAGAACACCT TTATGGTATT ACATTCTCAA AGAAGCCGCA TTACAAACAG GAGGAAACAC GTTAGGAGCT GTAGGAAGTA GTATTGTTGC AGAGACTTTA  ATTGGGTTAG TCAAACAAGA TCCCAACAGC TATTTAAACC ATTTGCATAA TCCGGCTGTA CGACCCAATG GAATTCGCAT TCCTCGGCTT TATGGTCGTG CTTCAATCAT TAACTCGATT 
GGAGATATTT TATCCTGTGC AGGAGTTCGT TAG 

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