Entry information : NtPrx78-1B(Nitab4.5_0000263g0190)
Entry ID 8327
Creation 2011-04-20 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2011-04-21 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2022-08-03 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NtPrx78-1B(Nitab4.5_0000263g0190)
Name NtPrx78-1B(Nitab4.5_0000263g0190)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx006]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Nicotiana
Organism Nicotiana tabacum    [TaxId: 4097 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Trichomes
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NtPrx78-1B
start..stop
S start..stop
NtPrx78-2B 646 0 1..319 1..319
NtPrx78-1A 646 0 1..319 1..319
StPrx16 608 0 1..319 1..319
LePrx25 603 0 1..319 1..319
Literature and cross-references NtPrx78-1B(Nitab4.5_0000263g0190)
Protein sequence: NtPrx78-1B(Nitab4.5_0000263g0190)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   319 (297)
PWM (Da):   %s   34406.28 (32148.1) Transmb domain:   %s   i7-29o
PI (pH):   %s   9.1 (8.91) Peptide Signal:   %s   cut: 23 range:23-319
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MASFKTAIVL FFLVSLTGSS SAQLTTGFYS KSCPKLYETV KSVVHSAIQK ETRMGASLLR LFFHDCFVNG CDGSLFLDDT STFTGEKRAQ QNFNSARGFE VIDDIKSAVE KVCPGIVSCA  DILAVTARDS VVILGGPNWD VKLGRRDART ASQAAANSSI PPPTSNLNRL ISSFTAVGLS TKDMVALSGA HTIGQARCTS FRARIYNETN NLDSSLAKTR QNNCPRNSGS GDNNLAPLDL 
QTPTYFDNHY FINLVSKKGL LHSDQQLFNG GSADSIVKSY SDNPSSFATD FVTAMIKMGD NRPLTGSKGE IRKNCRRIN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and EST.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTCTT TTAAGACTGC CATAGTTTTG TTTTTCCTAG TGAGCTTAAC TGGAAGCTCC TCAGCTCAAC TAACCACTGG CTTTTATTCA AAATCATGTC CTAAGCTCTA TGAAACTGTG  AAATCTGTAG TGCATTCTGC CATTCAGAAG GAAACCCGTA TGGGTGCTTC CCTCCTTCGC CTATTCTTCC ACGATTGCTT CGTCAATGTA AGCTTTCTTC TTCATTTTTG GCCATTTTCC  GTAGAAATAA TAGTTTAATT CTTTATATCT ACTAACACCA TCGAGTATAT ATGTAGTATA ACACGAGAGC GACTAATTTT TATTTTTCAA TCTACAGTTG ATGATGTATA AAGACTAGGC  AAGAAATGTT AATTGTAAAG CATTGTATAT GACGGGGCAA AGGTAAATAG CCCTAAGGAT GGTCAACTGA CCATCTTTCG TTGAACAATT AAATGTATAT ACAAGTAAAA TATTAGATTT  TAAAGGTATA TAATATATAT TGAACACTTT TTATAATGAT TATTTTTTAT TTATTTCAAG TTTGAACGCC CTAAATGAAA TTTCTGGTTT CGCCATCGGT ATATGACCAC GAAAGTTAAA  GTATTTTCTG TTGCCAAGTG TTCCTGGATT GATCGAGATA TCGTTTCCAA GTCTATGTTT GACAAGTTGA CTACTAATTT GTTGCCGAGT CTTTATTAGT AGTAGAAGTT GTTTTTTACT  GTCTCCAGGC ATTCAGAAGG TCTTGGTCTC GATTATATAT CGATAAGTTA GGTTTAGTAC ACCTAATTGT TAAACTTTGA CTTAGGCATA CTCATAAATT GGTCACGTTT ACATTATTTT  GTTATGCCTT TTGTCTAAAT TGCTTAATGT CTTATTTCAG GGATGCGATG GATCATTATT CCTGGATGAT ACATCAACCT TCACAGGGGA AAAAAGGGCA CAACAAAATT TCAATTCCGC  CAGAGGATTT GAAGTTATTG ACGACATCAA ATCTGCCGTC GAAAAAGTGT GCCCTGGTAT CGTCTCTTGT GCTGATATTT TGGCCGTTAC TGCTCGAGAC TCTGTTGTCA TTGTAAGTTC  TTTATGTTAT TATTAAGTAC AATAGTTTTC ATTGTAAACC TCCTTTTGAA TTCTATGCTA ACGCGGATTA TTGTTGTATA TAATGTAGCT TGGAGGGCCT AATTGGGATG TAAAACTAGG  AAGAAGAGAT GCCAGAACAG CAAGCCAAGC TGCTGCAAAT AGTAGCATTC CTCCCCCGAC TTCAAACCTT AACCGTCTCA TCTCTAGCTT CACTGCTGTT GGCCTTTCCA CCAAGGATAT  GGTTGCCTTA TCTGGTTCGT TCTCTTCCCC GGCAACTCTT CGAAAAACAC CTCTTAAACA TAACGAAAAA GGGTCATGTT TGACGGATAA GAGGTTACAT CTTTAGGTAT GGGTTGGTTA  ATAAACAGAT GCCCTCCACC TGTCCTTTTA AAGGTGGGTC CGGGTTGACC GTTGTAGGCA AAGGTATTTG AGTTTAAAAG GGTAACGATA TGGATAAATA ATGTTGAAAA GTATAATATG  GGCTAATATG ACCTTTTTGC ATAACTAGAA TAACTTGTTA CAATATACTG ATAGCGTAAA TATTTTTTTA TACTATGATC AATGTATACA AATTACGTAA ATCTTCTCTA ATATACAATT  TTGTGGTTAT GTTCGTCAGG AGCTCACACC ATTGGACAAG CAAGGTGCAC AAGTTTCAGG GCACGCATAT ACAACGAGAC CAATAACTTG GATTCATCAC TAGCAAAAAC CAGGCAAAAC  AACTGCCCAA GAAACTCAGG TTCAGGGGAC AACAACTTGG CACCTCTTGA TCTTCAGACT CCTACATATT TCGACAACCA TTATTTCATT AACCTTGTAA GCAAAAAGGG TCTACTCCAC  TCTGATCAGC AGCTCTTCAA CGGCGGATCC GCCGATTCAA TTGTGAAATC ATACAGCGAC AACCCCAGCA GTTTCGCCAC TGATTTTGTG ACTGCCATGA TTAAGATGGG TGACAACCGT 
CCCCTTACTG GATCTAAAGG AGAGATCAGG AAGAATTGCA GGAGGATCAA CTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TGGCAGCACA CTTAATCTTC CCTTCAAAGT AATATATTTC TAAGTAAAAT TTCTTCAATG GCTTCTTTTA AGACTGCCAT AGTTTTGTTT TTCCTAGTGA GCTTAACTGG AAGCTCCTCA  GCTCAACTAA CCACTGGCTT TTATTCAAAA TCATGTCCTA AGCTCTATGA AACTGTGAAA TCAGTAGTGC ATTCTGCCGT TCAGAAGGAA ACCCGTATGG GTGCTTCCCT CCTTCGCCTA  TTCTTCCACG ATTGCTTCGT CAATGGATGC GATGGATCAT TATTCCTAGA TGATACATCA ACCTTCACAG GGGAAAAAAG GGCACAACCA AATTTCAATT CCGCCAGAGG ATTTGAAGTT  ATTGACGATT TCAAATCTGC CGTTGAAAAA GTGTGCCCTG GGGTCGTCTC TTGCGCTGAT ATTTTGGCCG TTACTGCTCG AGACTCTGTT GTCATTGTAA GTTCTTTATG TTAACTAAGT 
ACAATAATTT TCATTGTAnA CCTCCTTTTG AATTTTATGC TAACGCGAAT TATTGTTGTA TATAATGTAG CTTGGAGGGC CTAATTGGGA TG 

Retrieve as FASTA