Entry information : VcaCP01
| Entry ID | 8373 |
|---|---|
| Creation | 2011-05-12 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2011-05-12 (Christophe Dunand) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Marcel Zamocky |
| Last annotation changes | 2012-01-18 (Christophe Dunand) |
Peroxidase information: VcaCP01
| Name | VcaCP01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Catalase peroxidase [Orthogroup: CP002] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Viridiplantae Chlorophyta Chlorophyceae Volvocaceae Volvox | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Volvox carteri [TaxId: 3067 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tissue type | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Inducer | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repressor | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Best BLASTp hits |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '8373' 'join(623660..623805,624287..624496,624684..624954,625278..625391,625814..625877,626112..626281,626556..627109,627463..627654,627905..628064,628383..628523,628759..628869)' |
Exons►
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Literature and cross-references VcaCP01
| Literature | Prochnik S., Umen J., Nedelcu A.M., Hallmann A., Miller S.M., Nishii I., Ferris P., Kuo Al. Mitros T. et al. (2010) Genomic Analysis of Organismal Complexity in the Multicellular Green Alga Volvox carteri. Science 329:223-226. |
|---|---|
| Protein ref. | UniProtKB: D8UCP0 [Incorrect prediction] |
| DNA ref. | Phytozome 12: scaffold_60 (623660..628869) |
| Cluster/Prediction ref. | UniGene: Vca.1617 [5' end] Vca.1438 [3' end] |
Protein sequence: VcaCP01
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
|
||||||||||||
| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
|
||||||||||||
| Remarks | Complete sequence from genomic (10 introns) and 24 ESTs. Incorrect splicing prediction from Phytozome => confirmed with EST (FD830641.1). | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
|
||||||||||||
| CDS► Send to BLAST |
|
||||||||||||
