Entry information : AbraCP01
| Entry ID | 8379 |
|---|---|
| Creation | 2011-05-13 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2012-04-23 (Catherine Mathe (Scipio)) |
| Sequence status | partial |
| Reviewer | Marcel Zamocky |
| Last annotation changes | 2012-04-23 (Catherine Mathe (Scipio)) |
Peroxidase information: AbraCP01
| Name | AbraCP01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Catalase peroxidase [Orthogroup: CP001]* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Fungi Ascomycota Dothideomycetes Pleosporaceae Alternaria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Alternaria brassicicola [TaxId: 29001 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tissue type | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Inducer | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repressor | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Best BLASTp hits |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '8379' 'complement(join(36154..37565,37616..38354))' |
Exons►
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Literature and cross-references AbraCP01
| Literature | Clifton,S., Fulton,L., Fulton,B., Godfrey,J., Minx,P. and Nelson,J.
Draft sequence assembly of the Alternaria brassicicola genome (unpublished since 2009) |
|---|---|
| DNA ref. | JGI genome: Contig11 (38354..36154) |
Protein sequence: AbraCP01
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
|
||||||||||||
| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
|
||||||||||||
| Remarks | Partial sequence from genomic (1 intron). Short 3' end is missing. | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
|
||||||||||||
| CDS► Send to BLAST |
|
||||||||||||
