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Entry information : DrKat01
Entry ID 8420
Creation 2011-06-01 (Marcel Zamocky)
Last sequence changes 2011-06-16 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2011-06-16 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: DrKat01
Name DrKat01
Class Catalase    [Orthogroup: Kat001]
Taxonomy Eukaryota Metazoa Chordata Actinopterygii Cyprinidae Danio
Organism Danio rerio (Zebrafish)    [TaxId: 7955 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value DrKat01
start..stop		 S start..stop
HmolKat01 1051 0 4..526 3..525
OfKat01 982 0 1..526 1..527
KmaKat01 952 0 1..526 1..514
RrugKat01 916 0 1..521 1..522
Gene structure Fichier Exons►
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 361698..361763 64 N° 2 360138..360309 170 N° 3 359294..359404 109 N° 4 358385..358515 129
N° 5 357651..357755 103 N° 6 357438..357563 124 N° 7 356854..357045 190 N° 8 356155..356307 151
N° 9 355796..355934 137 N° 10 354148..354278 129 N° 11 353957..354064 106 N° 12 353757..353840 82
N° 13 352610..352672 61  
complement(join(352610..352672,353757..353840,353957..354064,354148..354278,3557 96..355934,356155..356307,356854..357045,357438..357563,357651..357755,358385..3 58515,359294..359404,360138..360309,361698..361763))


exon

Literature and cross-references DrKat01
Literature Zebrafish gene collection (unpublished since 2003)
Protein ref. UniProtKB:   Q7ZTT1
DNA ref. GenBank:   NW_003336217.1 (352610..361763) [Mismatch]
mRNA ref. GenBank:   BC051626.1
EST ref. GenBank:   GW711456.1
Cluster/Prediction ref. UniGene:   Dr.1079
Protein sequence: DrKat01
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   526
PWM (Da):   %s   59519.44  
PI (pH):   %s   7.99
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MADDREKSTDQMKLWKEGRGSQRPDVLTTGAGVPIGDKLNAMTAGPRGPLLVQDVVFTDEMAHFDRERIPERVVHAKGAGAFGYFEVTHDITRYSKAKVFEHVGKTTPIAVRFSTVAGEA
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NLMAVHSDYGNRVQALLDKHNAEGKKNTVHVYSRGGASAVAAASKM

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo 25, 12 introns), mRNA and 66 ESTs. Strain="Tuebingen". Clade 3 catalase with NADPH binding site.
DNA ►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCAGACGACAGAGAAAAGTCGACGGATCAGATGAAACTGTGGAAGGAGGGTCGCGGTTCCCAGGTCTGCTGCAGAATTAATTTGTTAAACATGATGTTGTGTGTAACATGAGTTCAC
ATTTGAGGGTTTTAACTGGTTTTCATTGTTTTTTTTAATGCGCAGAGCGAAATTGTGTCAAAGGTCGCAGGGCAATAACAAACAAACTCGAAGCATTTTAATATATTTACTTGAATTTCA
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GTTTGTTTATAGCGCGGGTGAGGCTGGGTCATCAGATACTGTCCGAGATCCTCGTGGTTTCGCAGTGAAGTTCTACACCGATGAGGGCAACTGGGATCTTACAGGAAACAACACCCCCAT
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ACATGTAGCACCTTAAGTCTCATTCTGATATTTACAGGATATCTGTGTTTGTAGTTTTTCCGTCTTTCATCCACTCTCAGAAGCGCAATCCGCAGACTCACCTGAAGGATCCGGACATGG
TTTGGGATTTTTGGAGCTTGCGTCCTGAATCGCTGCACCAGGTAAGGATGCAGAAGAAGGCCAATTGAGCTTTTTCTTGTTCCTGTAGTCGTAATGTCTCGCTCATGTTGTTTTCTGCAT
ATATACAGGTGTGTCTTTCCTGTTCAGTGATCGAGGGATTCCCGATGGCTACCGTCATATGAACGGATACGGATCGCACACCTTTAAACTGGTCAATGCTCAGGGCCAGCCGGTGTACTG
CAAGTTCCACTACAAGGTACGTAGTTTGTGAGTGTCCACAGAAGCGTTTTTAAGCACTGAGCTGAGTTTTTTTCTGTTGTTGTCAATGGAATTGCTGTGTTTTTAAAGTGCCTGCAGTGT
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ATGTATGTATGCATGTATGTATGTATGTATGTATGTTTGTATGTAGGTGTGTGTGTGTATTTTATAAATAAACAGTTATAAATAAAATATGAATATATATATATATATATATATATATAT
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TTTTTCATTTAATTTTTAAATTTTTTTTTCATTTATTGGTTGTAATTTTTTTTTTTTTTTTTATAAGTTTGATAGTATTTAAGTTAACACTTGTTTACATTTGCATCAATTCATAGTCTT
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GAACCGAAACCCCGTTAACTATTTCGCGGAGGTTGAGCAGCTGGCGTTTGATCCCAGTAACATGCCACCCGGCATTGAGCCCAGCCCAGACAAGATGCTGCAGGTACGTTTGTACATCTG
TGTTACAAAACCTATTAAGCAACATAACTAGAGACGTTTCCACAGGGTTGTAGTTCACAAAGGATGTTGTTGGCTATTAATGTACTTAAACTGTGGTTAGTTGTAATAGGAGTCCTGTAA
ATCCCTTTAGATTAAAGCATCATTGTCTAATGAGTAATTAGAAGAATGACTAAATACTGCAATTACTCAATTCTTTGCTGCAGGGGGGCGTCTTTTCTCCTACCCAGACACACATCGCCA
TCGACTCGGAGCTAATTACCTCCAACTACCAGTCAACTGCCCGTACCGCACCCGTGTGGCAAACTATCAGAGAGATGGACCCATGTGCATGCATGACAACCAGGGTGAGTGACGCACAAG
AGAAAACATTTAATTTCAATTACTAGGTAGAGTTTTGGGTTGGAAATGGTATTAGTCTGACTCAGATTAAGAATGCAACATCTGTCTGCTATGCTGGATCAGGATGAGTAACCTCAAATG
CTTATATTTCATTGGTCTGTGATTTTTATTGGAAACCTTTTTTCCCTCTTTTCTCAGAATTAAGTAATGCTCAAGTTTTATTAGCTCTCTATAAATTCTGGGTTTACTGTGCACAATTCT
GTTTACATTCAGATTATTTTTTGCATTTTGTGAGTTTACTTTTCACAGCTCACGAGTTGAATTTTTATGGGTTTGATCATTTAGCAGTTTATGGGTATGTTTTTCGGAGTTTGTGTTTAT
TTCTCGCAATTTTTAAGTTTCTTACAATTCGTAGGTTTCTACTTCCATTTTGTGAGTTTACTTTTTGCAATTCTGAAGTTTGCTTTTCGCAATTGCTGAGTTTTTACTTGGAGTTTGCTA
AGCAGTTTGAGTTTTCTACATTTGCACAATTCGTGATAATTAAAAATTTTTTTTTTTTTTAACTTCGCAGTTTGAATTTCACACAATTTGTGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATTTTTT
TTTGCGCAATTTTTTTTATTTTACTTTTTTTTTTTTTACTTTTGCACAATATGTGATTTTTAAGTCACACTTTTTTTTTTTTTTACTTTAGTGCAATTAAGTTTACTTTGCAATTTTGTA
TGTGTTTTACTTTTTGTATTATTCATAAGTTTTTTGGGGTTTTTTTTGTTACTTTAAAATTCGTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTTTCGTGGAACTCCTGAG
TTTTTAACTTTGCAATTTGTGAATTTTTTATTATTTTTTTTTTACTTTTATTGCAATTCCTGAGTTTTTAACTTTGCAATTTGTGAATTTTTTTTATTTTTTACTTTATTGCAATTCCTG
AGTTTTTTACTTCGCAATTTGTGAGTTTTTTTTTTTTTACTTTCGCGCAATTTGTGAGTTATTACTTTGCAATTTGTGAGGGTTTTGTTTTTTTTGTTTTTTTTTTATTGATTACTTTTC
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AAAAAATTGAATTTCAAATTTATAACCTACAGTTATGAAACTTGTAATTGCAAGCCAAAAGCCAGAATACCGAAAATACATTAAATATTTAGCATCCATCTAAAGTAAAACCTTACCTTC
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GCTCAACTCTTCATCCAGAAACGCATGGTATGATCTTTTGTTTTAGAGTCTGTGACATTTTTAGGTCACATTGATGGGAGGCCTGGAAAATAATACACTGCTTGATTTTAGAGGATTCAG
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GTTGACTACTCAATTCAAAAGATGACTTCTCGCATTTTGTAACATAATTTCTAAGTTTACATATCATAATTTGTGAATTTACTTGTCATTTCTAAACTACTTTCAGCAGTACTTCCCGCA
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AAAAATCTAAATAATAATATTAATAAAAGCCCTTAGTAATATTATTTTCAGTTGCTCTAAAATATGGTAGCTTATTCTACCATGGGATAAAAATATTTAAAACTGAAAGTCTAAATTGTG
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TGTTCATGTTTATTCACGTGGTGGAGCGTCTGCTGTGGCTGCAGCTTCTAAGATGTGA

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCAGACGACAGAGAAAAGTCGACGGATCAGATGAAACTGTGGAAGGAGGGTCGCGGTTCCCAGCGTCCGGATGTCCTGACCACTGGAGCTGGAGTCCCGATAGGGGACAAGTTAAAT
GCGATGACGGCAGGGCCTCGTGGGCCATTGCTGGTCCAGGATGTGGTGTTTACTGATGAAATGGCCCATTTTGACCGAGAGCGGATACCAGAGAGAGTCGTGCATGCTAAAGGAGCAGGG
GCGTTTGGCTACTTCGAAGTCACTCACGACATCACGCGCTACTCCAAAGCCAAAGTGTTTGAGCATATTGGAAAGACGACACCGATCGCTGTCCGCTTTTCCACAGTGGCGGGTGAGGCT
GGGTCATCAGATACTGTCCGAGATCCTCGTGGTTTCGCAGTGAAGTTCTACACCGATGAGGGCAACTGGGATCTTACAGGAAACAACACCCCCATCTTCTTTATCAGGGATACGCTTCTG
TTTCCGTCTTTCATCCACTCTCAGAAGCGCAATCCGCAGACTCACCTGAAGGATCCGGACATGGTTTGGGATTTTTGGAGCTTGCGTCCTGAATCGCTGCACCAGGTGTCTTTCCTGTTC
AGTGATCGAGGGATTCCCGATGGCTACCGTCATATGAACGGATACGGATCGCACACCTTTAAACTGGTCAATGCTCAGGGCCAGCCGGTGTACTGCAAGTTCCACTACAAGACTAATCAG
GGCATTAAGAATATTCCTGTTGAAGAAGCGGATCGTCTGGCTGCCACTGATCCGGATTACTCTATCAGAGACCTTTACAACGCTATCGCCAATGGCAACTTCCCATCCTGGACCTTCTAC
ATCCAGGTTATGACCTTTGAGCAGGCTGAAAACTGGAAGTGGAATCCATTTGATTTGACCAAGGTCTGGTCCCATAAAGAGTTCCCTCTGATTCCTGTGGGGCGTTTTGTGTTGAACCGA
AACCCCGTTAACTATTTCGCGGAGGTTGAGCAGCTGGCGTTTGATCCCAGTAACATGCCACCCGGCATTGAGCCCAGCCCAGACAAGATGCTGCAGGGGCGTCTTTTCTCCTACCCAGAC
ACACATCGCCATCGACTCGGAGCTAATTACCTCCAACTACCAGTCAACTGCCCGTACCGCACCCGTGTGGCAAACTATCAGAGAGATGGACCCATGTGCATGCATGACAACCAGGGTGGA
GCTCCAAACTACTACCCCAACAGCTTCAGTGCTCCTGACGTCCAGCCACGCTTCCTTGAGTCAAAGTGTAAAGTGTCTCCTGATGTGGCCCGATACAACAGCGCAGACGATGACAACGTG
ACCCAAGTGCGCACGTTCTTCACTCAGGTGCTAAATGAAGCCGAGAGAGAGCGTCTGTGCCAGAATATGGCCGGGCATCTGAAAGGAGCTCAACTCTTCATCCAGAAACGCATGGTGCAA
AACCTGATGGCTGTTCACTCTGATTATGGCAACCGAGTTCAGGCTCTCCTGGATAAACACAACGCTGAAGGGAAAAAGAACACTGTTCATGTTTATTCACGTGGTGGAGCGTCTGCTGTG
GCTGCAGCTTCTAAGATGTGA

Retrieve as FASTA  
cDNA►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCAGACG ACAGAGAAAA GTCGACGGAT CAGATGAAAC TGTGGAAGGA GGGTCGCGGT TCCCAGCGTC CGGATGTCCT GACCACTGGA GCCGGAGTCC CGATAGGGGA CAAGTTAAAT  GCGATGACGG CAGGGCCTCG TGGCCCATTG CTGGTCCAGG ATGTGGTGTT TACTGATGAA ATGGCCCATT TTGACCGAGA GCGGATACCA GAGAGAGTCG TGCATGCTAA AGGAGCAGGA  GCGTTTGGCT ACTTCGAAGT CACTCACGAC ATCACGCGCT ACTCCAAAGC CAAAGTGTTT GAGCATGTTG GAAAGACGAC ACCGATCGCT GTCCGCTTTT CCACAGTGGC GGGTGAGGCT  GGGTCATCAG ATACTGTCCG AGATCCTCGT GGTTTCGCAG TGAAGTTCTA CACCGATGAG GGCAACTGGG ATCTTACAGG AAACAACACC CCCATCTTCT TTATCAGGGA TACGCTTCTG  TTTCCGTCTT TCATCCACTC TCAGAAGCGC AATCCGCAGA CTCACCTGAA GGATCCGGAC ATGGTTTGGG ATTTTTGGAG CTTGCGTCCT GAATCGCTGC ACCAGGTGTC TTTCCTGTTC  AGTGATCGAG GGATTCCCGA TGGCTACCGT CATATGAACG GATACGGATC GCACACCTTT AAACTGGTCA ATGCTCAGGG CCAGCCGGTG TACTGCAAGT TCCACTACAA GACTAATCAG  GGCATTAAGA ATATTCCTGT TGAGGAAGCG GATCGTCTGG CTGCCACTGA TCCGGATTAC TCCATCAGAG ACCTTTACAA CGCCATTGCC AATGGCAACT TCCCATCCTG GACCTTCTAC  ATCCAGGTTA TGACCTTTGA GCAGGCTGAA AACTGGAAGT GGAATCCATT TGATTTGACC AAGGTCTGGT CCCATAAAGA GTTCCCTCTG ATTCCTGTGG GGCGTTTTGT GTTGAACCGA  AACCCCGTTA ACTATTTCGC GGAGGTTGAG CAGCTGGCGT TTGATCCCAG TAACATGCCA CCCGGCATTG AGCCCAGCCC AGACAAGATG CTGCAGGGGC GTCTTTTCTC CTACCCAGAC  ACACATCGCC ATCGACTCGG AGCTAATTAC CTCCAACTAC CAGTCAACTG CCCGTACCGC ACCCGTGTGG CAAACTATCA GAGAGATGGA CCCATGTGCA TGCATGACAA CCAGGGTGGA  GCTCCAAACT ACTACCCCAA CAGCTTCAGT GCTCCTGACG TCCAGCCACG CTTCCTTGAG TCAAAGTGTA AAGTGTCTCC TGATGTGGCC CGATACAACA GCGCAGACGA TGACAACGTG  ACCCAGGTGC GCACGTTCTT CACTCAGGTG CTAAATGAAG CCGAGAGAGA GCGTCTGTGC CAGAATATGG CCGGGCATCT GAAAGGAGCT CAACTCTTCA TCCAGAAACG CATGGTGCAA  AACCTGATGG CTGTTCACTC TGATTATGGC AACCGAGTTC AGGCTCTCCT GGATAAACAC AACGCTGAAG GGAAAAAGAA CACTGTTCAT GTTTATTCAC GTGGTGGAGC GTCTGCTGTG  GCTGCAGCTT CTAAGATGTG ATTACAAAGT GACGTCCCAC TACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACAGA TTCATTCTCT TATAGAGTGT GATATAGTGT TATAATGCCT  AATTCATTCC ATATATGGTT TAGAAATGCA GACATATCTA ATATGGCCAA TTGACAACAC AAGTGATCTT AGCAAATGCA ACACTGACTC CTTAATCTTG ATCTATGCCT TCAAGCAAAA  TGGGGGCCTT TGCATACAAA GATTTGAGCT AATCCAAACT AAATCAGCCT ATTTCAGTAT CTTTCTGCAT TTTGATTTCT GTGAAATGTA GAATAGCCAA TAATAATCTG AAAATCAAAG  CAACTGTTTA GTTTAATGCT GTATGACACT TGATTTTTTT TCTCCACAAT TTCTAAAAAC CTTGGCTACT TATGCAGTTT TTAAGCTGAA TTAAGATGGA ATGAATGTTT GCCGTCCTTT 
CTGCCTTGAC TGAATATAAT TCGGTTCTCA TAATATGAAT GTAACTCGTT TTGTCATTTT ATAATTAATA AATGATAATA TTTGATCTCA AAAAAAAAAA AAAAAA 

Retrieve as FASTA