Entry information : CbrKat01
| Entry ID | 8430 |
|---|---|
| Creation | 2011-06-16 (Marcel Zamocky) |
| Last sequence changes | 2011-06-16 (Marcel Zamocky) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Christophe Dunand |
| Last annotation changes | 2011-08-11 (Christophe Dunand) |
Peroxidase information: CbrKat01
| Name | CbrKat01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Catalase [Orthogroup: Kat001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Metazoa Chromadorea Rhabditidae Caenorhabditis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Caenorhabditis briggsae [TaxId: 6238 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
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| Tissue type | N/D |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '8430' 'join(787637..787704,787806..787876,787978..788042,788112..788756,788799..789071,789123..789644)' |
Exons►
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Literature and cross-references CbrKat01
| Literature | Stein L.D., Bao Z., Blasiar D., Blumenthal T., Brent M.R., Chen N., Chinwalla A., Clarke L., Clee C., Coghlan A., Coulson A., D'Eustachio P., Fitch D.H.A., Fulton L.A., Fulton R.E., Griffiths-Jones S., Harris T.W., Hillier L.W., Waterston R.H. (2003) The genome sequence of Caenorhabditis briggsae: a platform for comparative genomics. PLoS Biol. 1:166-192. |
|---|---|
| Protein ref. | GenBank: CAP37752 UniProtKB: A8XYN6 |
| DNA ref. | GenBank: CAAC02000575.1 (787637..789644) |
Protein sequence: CbrKat01
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic, 5 introns. Strain="AF16". No EST found. Clade 3 catalase. | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
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