Entry information : PtAPx10 (POPTR_0005s17350 / Potri.005G161900)
Entry ID | 8470 |
---|---|
Creation | 2011-08-18 (Christophe Dunand) |
Last sequence changes | 2011-08-18 (Christophe Dunand) |
Sequence status | complete |
Reviewer | Qiang Li |
Last annotation changes | 2011-11-28 (Qiang Li) |
Peroxidase information: PtAPx10 (POPTR_0005s17350 / Potri.005G161900)
Name (synonym) | PtAPx10 (POPTR_0005s17350 / Potri.005G161900) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Class | Ascorbate peroxidase [Orthogroup: APx2004] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Taxonomy | Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Salicaceae Populus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism | Populus trichocarpa (Western balsam poplar) [TaxId: 3694 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular localisation | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue type | Leaves |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Inducer | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Repressor | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Best BLASTp hits |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene structure Fichier |
Exons►
![]() |
Literature and cross-references PtAPx10 (POPTR_0005s17350 / Potri.005G161900)
DNA ref. | Phytozome 12: scaffold_5 (14664740..14661631) |
---|---|
Omic ref. | ePlant: Potri.005G161900 |
Protein sequence: PtAPx10 (POPTR_0005s17350 / Potri.005G161900)
Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
|
||||||||||||
Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
|
||||||||||||
Remarks | Complete sequecne from genomic and 8 ESTs. Incorrect prediction from Phytozome (first intron is not predicted) | ||||||||||||
DNA ► Send to BLAST |
|
||||||||||||
CDS► Send to BLAST |
|