Entry information : PstrCIIBB01 (MnP3-short)
| Entry ID | 8516 |
|---|---|
| Creation | 2011-09-22 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2012-04-03 (Christophe Dunand) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Catherine Mathe |
| Last annotation changes | 2017-03-10 (Catherine Mathe) |
Peroxidase information: PstrCIIBB01 (MnP3-short)
| Name (synonym) | PstrCIIBB01 (MnP3-short) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Other class II peroxidase type B [Orthogroup: CIIBB001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Fungi Basidiomycota Agaricomycetes Corticiaceae Punctularia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Punctularia strigosozonata [TaxId: 202698 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
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| Tissue type | N/D |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '8516' 'complement(join(355973..356047,356099..356787,356842..356905,356970..357026,357079..357267))' |
Exons►
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Literature and cross-references PstrCIIBB01 (MnP3-short)
| DNA ref. | JGI genome: scaffold_5 (357267..355973) |
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Protein sequence: PstrCIIBB01 (MnP3-short)
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic (4 introns, one stop codon in frame). Uncorrect prediction from Phytozome, due to stop in frame => short exon SNAD :CGCGGACG and missing sequence) | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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