Sequence Properties
first value : protein second value (mature protein) |
Length (aa): |
299 |
PWM (Da): |
33392.92 |
|
PI (pH): |
7.06 |
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Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
MGFILFHVQKQNQSIVRNTVESYMNTDPTIAAGLLRLHFHDCFVQGCDGSVLISGNLAERNALPNLGLRGFEVIEDAKSELEAECPGIVSCADILALAARDAVDLSKGPSWSVPTGRRDG RVSSKSEAQNLPSPLESIAVHKKKFAEKGLDEQDLLTLLGAHTIGQTDCLFFRYRLHNFTTTCNSDPTINPSFLTELKELCPNDGDATKRVALDKDSQFKFDLSFFNNIKDGNGVLESDQ RLWNDDSTRSIIQKYISPLRGLLGLRFDYNFRKSMIKMSSIEVKTGMQVEIRRKCSRFN* |
Retrieve as FASTA
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Remarks |
Complete sequence from genomic (3 iotrons). Incorrect prediction from Phytozome (exons 1 and 2are ot predicted). |
DNA ►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGGGTTTTATTCTTTTTCATGTCCAAAAGCAGAATCAATCTATAGTGAGAAATACGGTTGAATCGTACATGAATACCGATCCTACCATTGCAGCTGGGTTATTGAGGCTTCATTTTCAC GACTGTTTTGTGCAGGTTATTGCTCTTCATCATTTGGTTTTTAATATTGTAGTTAACTTACGAGAATCATTGTATATAATAGTAATGGGTTTTTTTATACATATTGGCAGGGGTGTGATG GTTCAGTGTTGATTTCGGGTAATTTGGCTGAGAGAAATGCTTTGCCAAACCTTGGATTAAGAGGGTTTGAAGTAATTGAAGATGCAAAATCAGAGCTTGAAGCTGAGTGTCCTGGCATTG TCTCTTGTGCAGATATTCTTGCTTTGGCTGCCCGTGATGCCGTTGACTTGGTAATACTATGTATCTTTTCATGGCTTAGAGACTATATAATATTAGATCTCAAATGAAACCTCTACTTGG TTCACAAGATGTGTGGACATTGTTAATTAATAATGGCTATGAATAACCAGAAAGTGATACGACTTTGAGTCAAGCTGAGAGAAACTTTACAAAATACAAGAAAGAAAGATCAAAAGGCTC TCACCATCATTCATCAAGTCATTGATGATTCAAAATGTGAGAATATTTATGGAGCAACTATTGCACATCAAGCATCGCAAATTTTGGAGAATAAGTATAAAGGAGTAGATTGAGTCAAGA ATGTTTCATCTTCAAAAATTAAGAGGTGATTATGAGTCGCTGCCTATTAAGAAGTCTGAATTAGTATCAAATTATACTTCAAGATTGCTAGTAGTAGTAAATGAAATAATAAGATATGGG TGAGACAATAAGTGATGAGCAAGTAGTAGAAAAGACAATTTAATTTGTTCATATATTAGACAAAAAATTCAATTTCATCGTTGTAGCTATTAAAGAATCAAAGAATTTGAGTACAATGTC 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TTTCTAAGTCTATCACAACTCCAAGTGAAATTAGGACCAAAGTGTCTAAATTTGAAGAATGAGATGTTGATCGTTCGTATTTCAAAAGTTTGGTTGAAATTTTGAGATATTAAATTTGAA CACTACCAGATATTCTTTTCAGCATTGGATTAGTGAGCCCATTTGTGGAATTAAGCGCCTACAATTATACTCATTTGAAAGTGGCATTTATTCTTCTTTACCTCAAAGGTACGCTTAACT ATGCAGTATTTAATCTTCATCTAAAGTATTCAAGCTTGAAGGCTATTGTGACAATGACTAGGCTAGAGATACTAATTAATTAATTATCAAAAGAGCACTTGTGGATATATTTTCCTTGTT GGTAACAACGCATTTACTCGGAGTTCTAAGAAGCAACCTGTTGTGGCATTATCCACTAGTGAGGCAGAATATGTTTTTGCAGCTTCATATGTCTGTTATGCAGTTTGGTTAAGAAATTTG TTAAAGACAATAAAAAATTTGCAAGATGATTCAAATGTGATTCATGTAGACAATAAGTCAACAATTGCTTTAGAGAAGAATCTCGTGTTTCATGAATTGTAGCAAACTCATTGATAAAAA GATTTCACTTGATCAGAGATTACATTTTAAGGAAAGAGGTTCAAGTTGAATATGTAAAAAGATCCTTAAAATTAATATGTTTAACAAGTTAAAAACCTTTGCTTGGAGTTTTTAGAAAAC ATTTTTAAGGGAGAATGTTGAAAATTAAACATGTTTTAATTTAATAACTTGTTTTATGATACGTTAAAATGTTAGAGTTAATTTAGTAACAATTTCAATATATTATTTAATTGTAGGATT TAAAATAATGAATTTGTATAAGCGCGTGACTAATCCTATAAGTAGGATTAAAATGTTCTAATCTAAATTATGGAAGGGAATAAGAATACACATAAAGTGAGTTAAAAGTCTTTCCAATAA 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ATTGCTTGTTCTTCAGATATCGTTTACACAACTTCACAACAACATGCAACTCAGACCCAACCATAAACCCATCATTCTTAACAGAGTTGAAAGAACTTTGCCCCAATGATGGAGATGCAA CCAAAAGGGTGGCATTGGACAAAGACAGCCAGTTCAAATTTGATCTTAGTTTCTTCAACAACATTAAAGATGGAAATGGAGTTTTGGAGTCAGACCAAAGGCTTTGGAATGATGATTCAA CTAGAAGTATTATCCAAAAGTACATCAGCCCTTTAAGAGGACTTTTGGGGTTAAGATTTGACTACAACTTTCGGAAGTCCATGATTAAAATGAGTAGCATTGAGGTTAAGACTGGTATGC AAGTAGAGATCAGGAGAAAATGTTCGAGATTTAATTAA |
Retrieve as FASTA
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